RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 ITGB8P26012 769 aa17.29■□□□□ 0.36
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PGGT1B-202ENST00000379615 QARSP47897 775 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
PGGT1B-202ENST00000379615 ADAM17P78536 824 aa17.29■□□□□ 0.36
PGGT1B-202ENST00000379615 NCAPH2Q6IBW4 605 aa17.29■□□□□ 0.36
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PGGT1B-202ENST00000379615 RAB34Q9BZG1 259 aa17.29■□□□□ 0.36
PGGT1B-202ENST00000379615 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
PGGT1B-202ENST00000379615 SZT2Q5T011 3432 aa17.29■□□□□ 0.36
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PGGT1B-202ENST00000379615 HIC1Q14526 733 aa17.27■□□□□ 0.36
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PGGT1B-202ENST00000379615 ERMNQ8TAM6 284 aa17.27■□□□□ 0.36
PGGT1B-202ENST00000379615 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
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PGGT1B-202ENST00000379615 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa17.27■□□□□ 0.36
PGGT1B-202ENST00000379615 IL23AQ9NPF7 189 aa17.27■□□□□ 0.36
PGGT1B-202ENST00000379615 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
PGGT1B-202ENST00000379615 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa17.27■□□□□ 0.36
PGGT1B-202ENST00000379615 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa17.27■□□□□ 0.36
PGGT1B-202ENST00000379615 STK24Q9Y6E0 443 aa17.27■□□□□ 0.36
PGGT1B-202ENST00000379615 UMODL1Q5DID0 1318 aa17.26■□□□□ 0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 KLRC1P26715 233 aa17.26■□□□□ 0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 PRPHP41219 470 aa17.26■□□□□ 0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
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PGGT1B-202ENST00000379615 OTUD6AQ7L8S5 288 aa17.26■□□□□ 0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
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PGGT1B-202ENST00000379615 FERMT3Q86UX7 667 aa17.26■□□□□ 0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 NME8Q8N427 588 aa17.26■□□□□ 0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
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PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF862O60290 1169 aa17.25■□□□□ 0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 RSPH10BP0C881 870 aa17.25■□□□□ 0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 TECP42680 631 aa17.25■□□□□ 0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 PDIA5Q14554 519 aa17.25■□□□□ 0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 NBR1Q14596 966 aa17.25■□□□□ 0.35
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PGGT1B-202ENST00000379615 IER5Q5VY09 327 aa17.25■□□□□ 0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 C4orf19Q8IY42 314 aa17.25■□□□□ 0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 EXOC8Q8IYI6 725 aa17.25■□□□□ 0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 TDHQ8IZJ6 230 aa17.25■□□□□ 0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 BANK1Q8NDB2 785 aa17.25■□□□□ 0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 MTMR6Q9Y217 621 aa17.25■□□□□ 0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 PPME1Q9Y570 386 aa17.25■□□□□ 0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa17.24■□□□□ 0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 M0QZ92 97 aa17.24■□□□□ 0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 FGBP02675 491 aa17.24■□□□□ 0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 ACTN1P12814 892 aa17.24■□□□□ 0.35
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PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF618Q5T7W0 954 aa17.24■□□□□ 0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 DTHD1Q6ZMT9 781 aa17.24■□□□□ 0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 TPH2Q8IWU9 490 aa17.24■□□□□ 0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF710Q8N1W2 664 aa17.24■□□□□ 0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 C4orf32Q8N8J7 132 aa17.24■□□□□ 0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa17.24■□□□□ 0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 SCLYQ96I15 445 aa17.24■□□□□ 0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 HSD17B14Q9BPX1 270 aa17.24■□□□□ 0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 LXNQ9BS40 222 aa17.24■□□□□ 0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP17.24■□□□□ 0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 LTBP2Q14767 1821 aa17.24■□□□□ 0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 CYP4A11Q02928 519 aa17.23■□□□□ 0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa17.23■□□□□ 0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM26DQ5JW98 314 aa17.23■□□□□ 0.35
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