RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373166.7

TRAPPC3-204, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-204ENST00000373166 EYA4O95677 639 aa21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 CPA1P15085 419 aa21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 KCNA2P16389 499 aa21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 CAMK1Q14012 370 aa21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 RTN1Q16799 776 aa21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 IER5Q5VY09 327 aa21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 FTHL17Q9BXU8 183 aa21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 BRPF3Q9ULD4 1205 aa21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
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TRAPPC3-204ENST00000373166 GOLGA8AA7E2F4 631 aa21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 GOLGA8BA8MQT2 603 aa21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 ATP9AO75110 1047 aa21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 RCAN1P53805 252 aa21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 MARCH8Q5T0T0 291 aa21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 NPAS4Q8IUM7 802 aa21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 SPPL3Q8TCT6 385 aa21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 MSLNLQ96KJ4 702 aa21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 SQORQ9Y6N5 450 aa21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 NLRC5Q86WI3 1866 aa21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 RRN3P2A6NIE6 340 aa21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 STAG3L1P0CL83 205 aa21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 RPS6KB1P23443 525 aa21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 CD52P31358 61 aa21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 IGBP1P78318 339 aa21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 PKN1Q16512 942 aa21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 Q6ZUG5 572 aa21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 CCDC82Q8N4S0 544 aa21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 EFHBQ8N7U6 833 aa21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 M0QZ92 97 aa21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 ITGB1P05556 798 aa21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 DNAJB1P25685 340 aa21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 MTMR1Q13613 665 aa21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 CRIPAKQ8N1N5 446 aa21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 KLHL23Q8NBE8 558 aa21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 LINC01599Q8WXQ3 324 aa21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 BRF1Q92994 677 aa21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 MYO7AQ13402 2215 aa21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 ITGB5P18084 799 aa21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC3-204ENST00000373166 COASYQ13057 564 aa21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC3-204ENST00000373166 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC3-204ENST00000373166 TRIM67Q6ZTA4 783 aa21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC3-204ENST00000373166 SMRP1Q8NCR6 262 aa21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC3-204ENST00000373166 POF1BQ8WVV4 589 aa21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC3-204ENST00000373166 PBXIP1Q96AQ6 731 aa21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC3-204ENST00000373166 PRRX2Q99811 253 aa21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC3-204ENST00000373166 PSTPIP2Q9H939 334 aa21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC3-204ENST00000373166 CLEC1BQ9P126 229 aa21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC3-204ENST00000373166 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC3-204ENST00000373166 TMEM221A6NGB7 291 aa21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC3-204ENST00000373166 M0R296 226 aa21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC3-204ENST00000373166 MAFGO15525 162 aa21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC3-204ENST00000373166 INSRRP14616 1297 aa21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC3-204ENST00000373166 NRIP1P48552 1158 aa21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC3-204ENST00000373166 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC3-204ENST00000373166 APOBRQ0VD83 1088 aa21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC3-204ENST00000373166 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC3-204ENST00000373166 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC3-204ENST00000373166 AZI2Q9H6S1 392 aa21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC3-204ENST00000373166 PKD2L1Q9P0L9 805 aa21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC3-204ENST00000373166 PADI3Q9ULW8 664 aa21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC3-204ENST00000373166 TRPV2Q9Y5S1 764 aa21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC3-204ENST00000373166 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC3-204ENST00000373166 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC3-204ENST00000373166 LOC730098B7Z3J9 87 aa21.87■■□□□ 1.09
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TRAPPC3-204ENST00000373166 PTPN5P54829 565 aa21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC3-204ENST00000373166 PAK2Q13177 524 aa21.87■■□□□ 1.09
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TRAPPC3-204ENST00000373166 FBXL16Q8N461 479 aa21.87■■□□□ 1.09
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TRAPPC3-204ENST00000373166 LRFN2Q9ULH4 789 aa21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC3-204ENST00000373166 SPDYE3A6NKU9 549 aa21.86■■□□□ 1.09
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TRAPPC3-204ENST00000373166 TMEM62Q0P6H9 643 aa21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC3-204ENST00000373166 RUFY3Q7L099 469 aa21.86■■□□□ 1.09
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TRAPPC3-204ENST00000373166 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
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TRAPPC3-204ENST00000373166 TRPC6Q9Y210 931 aa21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC3-204ENST00000373166 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC3-204ENST00000373166 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC3-204ENST00000373166 NID2Q14112 1375 aa21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC3-204ENST00000373166 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC3-204ENST00000373166 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC3-204ENST00000373166 IER5LQ5T953 404 aa21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC3-204ENST00000373166 PRSS33Q8NF86 280 aa21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC3-204ENST00000373166 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa21.85■■□□□ 1.09
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