RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361441.4

APOBEC3C-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3C, Length 2,818 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-201ENST00000361441 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 SESTD1Q86VW0 696 aa11.73□□□□□ -0.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa11.73□□□□□ -0.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 TAB2Q9NYJ8 693 aa11.73□□□□□ -0.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 TMOD3Q9NYL9 352 aa11.73□□□□□ -0.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 KIF1AQ12756 1690 aa11.73□□□□□ -0.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa11.73□□□□□ -0.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa11.72□□□□□ -0.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 GSG1L2A8MUP6 293 aa11.72□□□□□ -0.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 TACC1O75410 805 aa11.72□□□□□ -0.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 PLEKHA8P1O95397 391 aa11.72□□□□□ -0.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 GSTA2P09210 222 aa11.72□□□□□ -0.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP11.72□□□□□ -0.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 PTPREP23469 700 aa11.72□□□□□ -0.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 CTSWP56202 376 aa11.72□□□□□ -0.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 RCN2Q14257 317 aa11.72□□□□□ -0.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 MUM1Q2TAK8 710 aa11.72□□□□□ -0.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 CAPN12Q6ZSI9 719 aa11.72□□□□□ -0.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 NLRP10Q86W26 655 aa11.72□□□□□ -0.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 PEX5LQ8IYB4 626 aa11.72□□□□□ -0.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRIM22Q8IYM9 498 aa11.72□□□□□ -0.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 AZIN2Q96A70 460 aa11.72□□□□□ -0.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 PLIN2Q99541 437 aa11.72□□□□□ -0.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 CIDEBQ9UHD4 219 aa11.72□□□□□ -0.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 ECM29Q5VYK3 1845 aa11.72□□□□□ -0.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa11.72□□□□□ -0.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa11.72□□□□□ -0.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 HGSO14964 777 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 PDE8BO95263 885 aa11.72□□□□□ -0.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 ITGA2BP08514 1039 aa11.72□□□□□ -0.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 PDGFRBP09619 1106 aa11.72□□□□□ -0.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 GBP1P32455 592 aa11.72□□□□□ -0.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 LSAMPQ13449 338 aa11.72□□□□□ -0.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 CFAP157Q5JU67 520 aa11.72□□□□□ -0.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 CCDC122Q5T0U0 273 aa11.72□□□□□ -0.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 C6orf183Q5T699 404 aa11.72□□□□□ -0.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 IQCEQ6IPM2 695 aa11.72□□□□□ -0.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa11.72□□□□□ -0.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 SPATA5Q8NB90 893 aa11.72□□□□□ -0.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 MDM1Q8TC05 714 aa11.72□□□□□ -0.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 PSMB7Q99436 277 aa11.72□□□□□ -0.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRELID1Q9Y255 219 aa11.72□□□□□ -0.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa11.72□□□□□ -0.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 MYH13Q9UKX3 1938 aa11.72□□□□□ -0.53
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APOBEC3C-201ENST00000361441 TUFMP49411 452 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 ADGRA1Q86SQ6 560 aa11.71□□□□□ -0.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 CHMP6Q96FZ7 201 aa11.71□□□□□ -0.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 TMEM87BQ96K49 555 aa11.71□□□□□ -0.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 SPATA16Q9BXB7 569 aa11.71□□□□□ -0.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 MKS1Q9NXB0 559 aa11.71□□□□□ -0.53
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APOBEC3C-201ENST00000361441 ORC4O43929 436 aa11.71□□□□□ -0.54
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APOBEC3C-201ENST00000361441 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 CSF1RP07333 972 aa11.71□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 MYZAPP0CAP1 466 aa11.71□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 GSTT2P0CG29 244 aa11.71□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 GSTT2BP0CG30 244 aa11.71□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 IDEP14735 1019 aa11.71□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 CD97P48960 835 aa11.71□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 PLCD1P51178 756 aa11.71□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 NEK2P51955 445 aa11.71□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 ARPC4P59998 168 aa11.71□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 WDR78Q5VTH9 848 aa11.71□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 IRGCQ6NXR0 463 aa11.71□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF654Q8IZM8 581 aa11.71□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 PIGBQ92521 554 aa11.71□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 HAUS1Q96CS2 278 aa11.71□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 SPATA17Q96L03 361 aa11.71□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 SNX27Q96L92 541 aa11.71□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 RETREG1Q9H6L5 497 aa11.71□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 TMBIM4Q9HC24 238 aa11.71□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 EHD2Q9NZN4 543 aa11.71□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 PNMA2Q9UL42 364 aa11.71□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 JAG2Q9Y219 1238 aa11.71□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 TMEM94Q12767 1356 aa11.71□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 ASLP04424 464 aa11.7□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 ACADSP16219 412 aa11.7□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 VGLL2Q8N8G2 317 aa11.7□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 NACC2Q96BF6 587 aa11.7□□□□□ -0.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 FAM136AQ96C01 138 aa11.7□□□□□ -0.54
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