RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 IL10P22301 178 aa11.38□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 LSP1P33241 339 aa11.38□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 RCAN1P53805 252 aa11.38□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 INAQ16352 499 aa11.38□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 EXOC3L4Q17RC7 722 aa11.38□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 OLFML2BQ68BL8 750 aa11.38□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 LRIG3Q6UXM1 1119 aa11.38□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 ARHGEF5Q12774 1597 aa11.38□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa11.38□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 ATP2B4P23634 1241 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 NCAPG2Q86XI2 1143 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 PHACTR3Q96KR7 559 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 NLRP3Q96P20 1036 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC40A1Q9NP59 571 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 ABHD10Q9NUJ1 306 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 KIF17Q9P2E2 1029 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 MDH1P40925 334 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 LUZP2Q86TE4 346 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 NUP107P57740 925 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 MAGEB5Q9BZ81 275 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 TBK1Q9UHD2 729 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 ASAP2O43150 1006 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 RAPH1Q70E73 1250 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 TRIM62Q9BVG3 475 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 CARD14Q9BXL6 1004 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 GPCPD1Q9NPB8 672 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 V9GY48 417 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 PIK3R2O00459 728 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 CCDC134Q9H6E4 229 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 HESX1Q9UBX0 185 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 KCNJ14Q9UNX9 436 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 L3MBTL1Q9Y468 752 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 BCORL1Q5H9F3 1711 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 FOSP01100 380 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 POMGNT1Q8WZA1 660 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM206Q9H813 350 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 HPCAL4Q9UM19 191 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 PPIP5K2O43314 1243 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 ST13P50502 369 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 CLIC6Q96NY7 704 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 GINS4Q9BRT9 223 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM192AQ9GZU8 254 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 AZI2Q9H6S1 392 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 PZPP20742 1482 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 PLCH2O75038 1416 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 TBKBP1A7MCY6 615 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 C1orf146Q5VVC0 180 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 CCDC127Q96BQ5 260 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 NDEL1Q9GZM8 345 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 KDM4CQ9H3R0 1056 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 RHBDL2Q9NX52 303 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 ATP1A3P13637 1013 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 NELFCDQ8IXH7 590 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF555Q8NEP9 628 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 TADA1Q96BN2 335 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 SGSM3Q96HU1 749 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP11.36□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 KLC2Q9H0B6 622 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 M0QZ92 97 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 GPAA1O43292 621 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP11.36□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 PTPN21Q16825 1174 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 NAA35Q5VZE5 725 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 TTBK2Q6IQ55 1244 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 APBB2Q92870 758 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC5A4Q9NY91 659 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 STRIP2Q9ULQ0 834 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 SRGAP2O75044 1071 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 SAT1P21673 171 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 WDR24Q96S15 920 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 SMYD2Q9NRG4 433 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 KRT82Q9NSB4 513 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
SH3BP2-201ENST00000356331 FHOD1Q9Y613 1164 aa11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms