RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342075.8

PMS1-201, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 2

Gene PMS1, Length 3,012 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-201ENST00000342075 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
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PMS1-201ENST00000342075 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
PMS1-201ENST00000342075 TGFB3P10600 412 aa15.48■□□□□ 0.07
PMS1-201ENST00000342075 HSPA6P17066 643 aa15.48■□□□□ 0.07
PMS1-201ENST00000342075 NLRP12P59046 1061 aa15.48■□□□□ 0.07
PMS1-201ENST00000342075 PRKCEQ02156 737 aa15.48■□□□□ 0.07
PMS1-201ENST00000342075 KLHL10Q6JEL2 608 aa15.48■□□□□ 0.07
PMS1-201ENST00000342075 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
PMS1-201ENST00000342075 AFG1LQ8WV93 481 aa15.48■□□□□ 0.07
PMS1-201ENST00000342075 C7orf25Q9BPX7 421 aa15.48■□□□□ 0.07
PMS1-201ENST00000342075 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa15.48■□□□□ 0.07
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PMS1-201ENST00000342075 CBX8Q9HC52 389 aa15.48■□□□□ 0.07
PMS1-201ENST00000342075 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa15.47■□□□□ 0.07
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PMS1-201ENST00000342075 EYA4O95677 639 aa15.47■□□□□ 0.07
PMS1-201ENST00000342075 PSAPP07602 524 aa15.47■□□□□ 0.07
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PMS1-201ENST00000342075 C1QTNF8P60827 252 aa15.47■□□□□ 0.07
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PMS1-201ENST00000342075 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa15.47■□□□□ 0.07
PMS1-201ENST00000342075 RINT1Q6NUQ1 792 aa15.47■□□□□ 0.07
PMS1-201ENST00000342075 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
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PMS1-201ENST00000342075 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
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PMS1-201ENST00000342075 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa15.46■□□□□ 0.07
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PMS1-201ENST00000342075 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
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PMS1-201ENST00000342075 NACC1Q96RE7 527 aa15.46■□□□□ 0.07
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PMS1-201ENST00000342075 PRCPP42785 496 aa15.44■□□□□ 0.06
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PMS1-201ENST00000342075 IQCB1Q15051 598 aa15.44■□□□□ 0.06
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PMS1-201ENST00000342075 OR6J1Q8NGC5 347 aa15.44■□□□□ 0.06
PMS1-201ENST00000342075 NEK9Q8TD19 979 aa15.44■□□□□ 0.06
PMS1-201ENST00000342075 EXOC1Q9NV70 894 aa15.44■□□□□ 0.06
PMS1-201ENST00000342075 TRIM49BA6NDI0 452 aa15.43■□□□□ 0.06
PMS1-201ENST00000342075 MYADML2A6NDP7 307 aa15.43■□□□□ 0.06
PMS1-201ENST00000342075 AP5Z1O43299 807 aa15.43■□□□□ 0.06
PMS1-201ENST00000342075 GH1P01241 217 aa15.43■□□□□ 0.06
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