RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000339007.3

LRRC25-201, Transcript of leucine rich repeat containing 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRC25, Length 2,415 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC25-201ENST00000339007 SLFN11Q7Z7L1 901 aa20.01■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 GPBP1Q86WP2 473 aa20.01■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 SYCE1Q8N0S2 351 aa20.01■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 KIAA1024Q9UPX6 916 aa20.01■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 C21orf2O43822 256 aa20.01■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 PRKCIP41743 596 aa20.01■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 GRIK5Q16478 980 aa20.01■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa20.01■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 VPS36Q86VN1 386 aa20.01■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 TAX1BP1Q86VP1 789 aa20.01■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 HAUS2Q9NVX0 235 aa20.01■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 MYH7BA7E2Y1 1941 aa20■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 KIF13BQ9NQT8 1826 aa20■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa20■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 BACH1O14867 736 aa20■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 IFFO1Q0D2I5 559 aa20■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 EXOC3L4Q17RC7 722 aa20■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 FRMD5Q7Z6J6 570 aa20■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 DNAAF5Q86Y56 855 aa20■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 GJA10Q969M2 543 aa20■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 NYXQ9GZU5 481 aa20■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa20■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 AFPP02771 609 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 H2AFZP0C0S5 128 aa20■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 TBC1D9BQ66K14 1250 aa20■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 H2AFVQ71UI9 128 aa20■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 DAAM2Q86T65 1068 aa20■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 PHF20L1A8MW92 1017 aa19.99■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 PON1P27169 355 aa19.99■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 NF2P35240 595 aa19.99■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 NOVP48745 357 aa19.99■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 UBE2SQ16763 222 aa19.99■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 ASPRV1Q53RT3 343 aa19.99■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 PPP1R18Q6NYC8 613 aa19.99■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 MAGEC3Q8TD91 643 aa19.99■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 NENFQ9UMX5 172 aa19.99■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 KRT18P05783 430 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 XRCC4Q13426 336 aa19.98■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 SPDYCQ5MJ68 293 aa19.98■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 NT5DC3Q86UY8 548 aa19.98■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 DPH5Q9H2P9 285 aa19.98■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 KDM4CQ9H3R0 1056 aa19.98■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 ZHX3Q9H4I2 956 aa19.98■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 INTUQ9ULD6 942 aa19.98■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 WNK3Q9BYP7 1800 aa19.98■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 CYP11B2P19099 503 aa19.98■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 DRD4P21917 467 aa19.98■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 BTDP43251 543 aa19.98■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 NPEPPSP55786 919 aa19.98■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 DDB1Q16531 1140 aa19.98■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 CEP57Q86XR8 500 aa19.98■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 CCT6BQ92526 530 aa19.98■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 TLCD1Q96CP7 247 aa19.98■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 CHMP6Q96FZ7 201 aa19.98■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 HES6Q96HZ4 224 aa19.98■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 FMO2Q99518 471 aa19.98■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 DONSONQ9NYP3 566 aa19.98■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 PPFIA2O75334 1257 aa19.97■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 GHRP10912 638 aa19.97■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 ELF1P32519 619 aa19.97■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 HOOK3Q86VS8 718 aa19.97■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 TEX11Q8IYF3 940 aa19.97■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 CENPTQ96BT3 561 aa19.97■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 HVCN1Q96D96 273 aa19.97■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 RAB17Q9H0T7 212 aa19.97■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 ODF2LQ9ULJ1 636 aa19.97■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa19.97■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 POTEB3A0JP26 581 aa19.97■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 FRMD3A2A2Y4 597 aa19.97■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 POTECB2RU33 542 aa19.97■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 ERMARDQ5T6L9 678 aa19.97■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 POTEBQ6S5H4 581 aa19.97■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 CUL5Q93034 780 aa19.97■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa19.97■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa19.97■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa19.96■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 CLK2P49760 499 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 SCLT1Q96NL6 688 aa19.96■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 FAM129AQ9BZQ8 928 aa19.96■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
LRRC25-201ENST00000339007 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms