RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 FAM153CQ494X1 144 aa24.7■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 ACTRT1Q8TDG2 376 aa24.7■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 FAM153AQ9UHL3 310 aa24.7■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 NAGPAQ9UK23 515 aa24.7■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 RIMBP2O15034 1052 aa24.69■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 SLC9A1P19634 815 aa24.69■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 CIITAP33076 1130 aa24.69■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 SREBF1P36956 1147 aa24.69■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 SCFD2Q8WU76 684 aa24.69■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 PPM1EQ8WY54 764 aa24.69■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 PIK3R5Q8WYR1 880 aa24.69■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 SPAG5Q96R06 1193 aa24.69■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF233A6NK53 670 aa24.69■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 CPP00450 1065 aa24.69■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 FOSP01100 380 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 ACTN1P12814 892 aa24.69■■□□□ 1.54
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HOXD1-201ENST00000331462 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 JAM2P57087 298 aa24.69■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 SLFN13Q68D06 897 aa24.69■■□□□ 1.54
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HOXD1-201ENST00000331462 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
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HOXD1-201ENST00000331462 INTUQ9ULD6 942 aa24.69■■□□□ 1.54
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HOXD1-201ENST00000331462 ASTN1O14525 1302 aa24.68■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 RAD51CO43502 376 aa24.68■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 ZEB2O60315 1214 aa24.68■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 PSMC6P62333 389 aa24.68■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 NFIAQ12857 509 aa24.68■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 AMNQ9BXJ7 453 aa24.68■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 ZHX3Q9H4I2 956 aa24.68■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 SIX2Q9NPC8 291 aa24.68■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 NRXN2Q9P2S2 1712 aa24.67■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 ESYT3A0FGR9 886 aa24.67■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 SHTN1A0MZ66 631 aa24.67■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 FLOT1O75955 427 aa24.67■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 RPL13P26373 211 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP24.67■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 PRR16Q569H4 304 aa24.67■■□□□ 1.54
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HOXD1-201ENST00000331462 ISCUQ9H1K1 167 aa24.67■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 EBAG9O00559 213 aa24.67■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 AKAP3O75969 853 aa24.67■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 CCT5P48643 541 aa24.67■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 SCNN1DP51172 638 aa24.67■■□□□ 1.54
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HOXD1-201ENST00000331462 VAV3Q9UKW4 847 aa24.67■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa24.67■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 GFPT2O94808 682 aa24.66■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 NR3C1P04150 777 aa24.66■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 DNA2P51530 1060 aa24.66■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 NFIL3Q16649 462 aa24.66■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 SLC35C1Q96A29 364 aa24.66■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 ZDHHC15Q96MV8 337 aa24.66■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 OLFML3Q9NRN5 406 aa24.66■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 KCNK3O14649 394 aa24.65■■□□□ 1.54
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HOXD1-201ENST00000331462 TPCN2Q8NHX9 752 aa24.65■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 UIMC1Q96RL1 719 aa24.65■■□□□ 1.54
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HOXD1-201ENST00000331462 FAM86B1E9PN63 330 aa24.65■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 FAM86B2P0C5J1 330 aa24.65■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 NPEPPSP55786 919 aa24.65■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 SLC15A2Q16348 729 aa24.65■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 LRIG3Q6UXM1 1119 aa24.65■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 SIAH1Q8IUQ4 282 aa24.65■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 GMCL1Q96IK5 515 aa24.65■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 MRIQ9BWK5 157 aa24.65■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 EYA4O95677 639 aa24.64■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 GAP43P17677 238 aa24.64■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 ECHS1P30084 290 aa24.64■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 TATDN1Q6P1N9 297 aa24.64■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 VPS36Q86VN1 386 aa24.64■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 TEX2Q8IWB9 1127 aa24.64■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 ZFPM1Q8IX07 1006 aa24.64■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 BORCS6Q96GS4 357 aa24.64■■□□□ 1.54
HOXD1-201ENST00000331462 SPDYE3A6NKU9 549 aa24.63■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC188H7C350 402 aa24.63■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
HOXD1-201ENST00000331462 MEIS1O00470 390 aa24.63■■□□□ 1.53
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