RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324444.7

SYNE4-201, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SYNE4, Length 1,354 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-201ENST00000324444 PKD2L1Q9P0L9 805 aa20.1■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa20.09■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 ATP9AO75110 1047 aa20.09■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 EYA4O95677 639 aa20.09■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 PLA2G4BP0C869 781 aa20.09■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 PSMC5P62195 406 aa20.09■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 FAM200AQ8TCP9 573 aa20.09■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 ATP6V0A1Q93050 837 aa20.09■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 DYDC2Q96IM9 177 aa20.09■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 UIMC1Q96RL1 719 aa20.09■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 ALPK3Q96L96 1907 aa20.09■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 DOCK5Q9H7D0 1870 aa20.09■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 RPN1P04843 607 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 UVSSAQ2YD98 709 aa20.08■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 TINF2Q9BSI4 451 aa20.08■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 TRIM9Q9C026 710 aa20.08■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa20.08■□□□□ 0.81
SYNE4-201ENST00000324444 CYP4A11Q02928 519 aa20.08■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 MORC3Q14149 939 aa20.08■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 MCM6Q14566 821 aa20.08■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 ANO6Q4KMQ2 910 aa20.08■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa20.08■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 METTL7BQ6UX53 244 aa20.08■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 OTUD6AQ7L8S5 288 aa20.08■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 C4orf19Q8IY42 314 aa20.08■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa20.08■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 BPIFA3Q9BQP9 254 aa20.08■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 LXNQ9BS40 222 aa20.08■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 MLXIPQ9HAP2 919 aa20.08■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 RGL1Q9NZL6 768 aa20.08■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 MAN1B1Q9UKM7 699 aa20.08■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP20.07■□□□□ 0.86e-6■■□□□ 11.7
SYNE4-201ENST00000324444 PRR29P0C7W0 189 aa20.07■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 COL6A1P12109 1028 aa20.07■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF165P49910 485 aa20.07■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 TPM4P67936 248 aa20.07■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 ASIC1P78348 528 aa20.07■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 PSMD2Q13200 908 aa20.07■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 CUL4BQ13620 913 aa20.07■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 ECM1Q16610 540 aa20.07■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 POTEGQ6S5H5 508 aa20.07■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 GAS2L3Q86XJ1 694 aa20.07■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 C7orf61Q8IZ16 206 aa20.07■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 GRPEL1Q9HAV7 217 aa20.07■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 EXOC1Q9NV70 894 aa20.07■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 NRBP1Q9UHY1 535 aa20.07■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
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SYNE4-201ENST00000324444 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
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SYNE4-201ENST00000324444 E9PMD0 336 aa20.06■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 ATG7O95352 703 aa20.06■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP20.06■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 KRT18P05783 430 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 ACTR2P61160 394 aa20.06■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 STIM1Q13586 685 aa20.06■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 FAM160B1Q5W0V3 765 aa20.06■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 UNC13DQ70J99 1090 aa20.06■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 CCDC65Q8IXS2 484 aa20.06■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 MTRQ99707 1265 aa20.06■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 TIPINQ9BVW5 301 aa20.06■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 ANKEF1Q9NU02 776 aa20.06■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 BECN2A8MW95 431 aa20.05■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 BIN1O00499 593 aa20.05■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 SEPT4O43236 478 aa20.05■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 RHOBTB3O94955 611 aa20.05■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 CCNE2O96020 404 aa20.05■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 TXNP10599 105 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 SLC12A3P55017 1021 aa20.05■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 LAMC2Q13753 1193 aa20.05■□□□□ 0.8
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SYNE4-201ENST00000324444 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 IQSEC1Q6DN90 963 aa20.05■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 TAPT1Q6NXT6 567 aa20.05■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 CYFIP1Q7L576 1253 aa20.05■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 EEPD1Q7L9B9 569 aa20.05■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 GPBP1Q86WP2 473 aa20.05■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 SEPT1Q8WYJ6 367 aa20.05■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 DDX12PQ92771 950 aa20.05■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 STAMQ92783 540 aa20.05■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 DNAJC25Q9H1X3 360 aa20.05■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 BLZF1Q9H2G9 400 aa20.05■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 WDR81Q562E7 1941 aa20.05■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 ARHGEF35A5YM69 484 aa20.04■□□□□ 0.8
SYNE4-201ENST00000324444 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa20.04■□□□□ 0.8
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