RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 SAMM50Q9Y512 469 aa29.63■■■□□ 2.33
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HOXD8-201ENST00000313173 MAFGO15525 162 aa29.63■■■□□ 2.33
HOXD8-201ENST00000313173 UQCRHP07919 91 aa29.63■■■□□ 2.33
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HOXD8-201ENST00000313173 ASTN1O14525 1302 aa29.57■■■□□ 2.32
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HOXD8-201ENST00000313173 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa29.56■■■□□ 2.32
HOXD8-201ENST00000313173 NFASCO94856 1347 aa29.55■■■□□ 2.32
HOXD8-201ENST00000313173 YWHABP31946 246 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
HOXD8-201ENST00000313173 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP29.55■■■□□ 2.32
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