RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292211.4

UBE2Q1-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2Q1, Length 3,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-201ENST00000292211 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
UBE2Q1-201ENST00000292211 AKR1B10O60218 316 aa23.04■■□□□ 1.28
UBE2Q1-201ENST00000292211 CYP3A4P08684 503 aa23.04■■□□□ 1.28
UBE2Q1-201ENST00000292211 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
UBE2Q1-201ENST00000292211 KRT26Q7Z3Y9 468 aa23.04■■□□□ 1.28
UBE2Q1-201ENST00000292211 JAKMIP2Q96AA8 810 aa23.04■■□□□ 1.28
UBE2Q1-201ENST00000292211 MACROD2A1Z1Q3 448 aa23.04■■□□□ 1.28
UBE2Q1-201ENST00000292211 MYBP10242 640 aa23.04■■□□□ 1.28
UBE2Q1-201ENST00000292211 TGFB2P61812 414 aa23.04■■□□□ 1.28
UBE2Q1-201ENST00000292211 TCERG1LQ5VWI1 586 aa23.04■■□□□ 1.28
UBE2Q1-201ENST00000292211 SAMM50Q9Y512 469 aa23.04■■□□□ 1.28
UBE2Q1-201ENST00000292211 NFIBO00712 420 aa23.03■■□□□ 1.28
UBE2Q1-201ENST00000292211 FAM13AO94988 1023 aa23.03■■□□□ 1.28
UBE2Q1-201ENST00000292211 ARID5AQ03989 594 aa23.03■■□□□ 1.28
UBE2Q1-201ENST00000292211 OTOP1Q7RTM1 612 aa23.03■■□□□ 1.28
UBE2Q1-201ENST00000292211 MYCT1Q8N699 235 aa23.03■■□□□ 1.28
UBE2Q1-201ENST00000292211 MTMR14Q8NCE2 650 aa23.03■■□□□ 1.28
UBE2Q1-201ENST00000292211 VPS33BQ9H267 617 aa23.03■■□□□ 1.28
UBE2Q1-201ENST00000292211 NEBLO76041 1014 aa23.03■■□□□ 1.28
UBE2Q1-201ENST00000292211 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
UBE2Q1-201ENST00000292211 FBXW10Q5XX13 1052 aa23.03■■□□□ 1.28
UBE2Q1-201ENST00000292211 MAEAQ7L5Y9 396 aa23.03■■□□□ 1.28
UBE2Q1-201ENST00000292211 FZD1Q9UP38 647 aa23.03■■□□□ 1.28
UBE2Q1-201ENST00000292211 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa23.03■■□□□ 1.28
UBE2Q1-201ENST00000292211 LRRC53A6NM62 1247 aa23.03■■□□□ 1.28
UBE2Q1-201ENST00000292211 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
UBE2Q1-201ENST00000292211 RASSF7Q02833 373 aa23.03■■□□□ 1.28
UBE2Q1-201ENST00000292211 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
UBE2Q1-201ENST00000292211 SIK3Q9Y2K2 1263 aa23.03■■□□□ 1.28
UBE2Q1-201ENST00000292211 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa23.03■■□□□ 1.28
UBE2Q1-201ENST00000292211 KRT86O43790 486 aa23.02■■□□□ 1.28
UBE2Q1-201ENST00000292211 HERVK_113P62684 666 aa23.02■■□□□ 1.28
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZCWPW2Q504Y3 356 aa23.02■■□□□ 1.28
UBE2Q1-201ENST00000292211 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa23.02■■□□□ 1.28
UBE2Q1-201ENST00000292211 HAUS4Q9H6D7 363 aa23.02■■□□□ 1.28
UBE2Q1-201ENST00000292211 NFKBIEO00221 500 aa23.02■■□□□ 1.28
UBE2Q1-201ENST00000292211 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
UBE2Q1-201ENST00000292211 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
UBE2Q1-201ENST00000292211 PDE11AQ9HCR9 933 aa23.02■■□□□ 1.28
UBE2Q1-201ENST00000292211 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
UBE2Q1-201ENST00000292211 STK24Q9Y6E0 443 aa23.02■■□□□ 1.28
UBE2Q1-201ENST00000292211 FRMD3A2A2Y4 597 aa23.01■■□□□ 1.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 CLIC2O15247 247 aa23.01■■□□□ 1.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 APBA1Q02410 837 aa23.01■■□□□ 1.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 CDC23Q9UJX2 597 aa23.01■■□□□ 1.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 EYA4O95677 639 aa23.01■■□□□ 1.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 MTMR2Q13614 643 aa23.01■■□□□ 1.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 MEA1Q16626 185 aa23.01■■□□□ 1.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 SLITRK3O94933 977 aa23.01■■□□□ 1.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 PRELPP51888 382 aa23.01■■□□□ 1.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 CHMP4BP1P59074 171 aa23.01■■□□□ 1.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 GOLGA1Q92805 767 aa23.01■■□□□ 1.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 DEFB129Q9H1M3 183 aa23.01■■□□□ 1.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 ARFGAP3Q9NP61 516 aa23.01■■□□□ 1.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 HACL1Q9UJ83 578 aa23.01■■□□□ 1.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 DUSP10Q9Y6W6 482 aa23.01■■□□□ 1.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 KIF5AQ12840 1032 aa23■■□□□ 1.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 PLS1Q14651 629 aa23■■□□□ 1.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 CEP63Q96MT8 703 aa23■■□□□ 1.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 LACRTQ9GZZ8 138 aa23■■□□□ 1.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 KCTD10Q9H3F6 313 aa23■■□□□ 1.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 SPP2Q13103 211 aa23■■□□□ 1.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 RINT1Q6NUQ1 792 aa23■■□□□ 1.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 NSMFQ6X4W1 530 aa23■■□□□ 1.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 TEKT3Q9BXF9 490 aa23■■□□□ 1.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 PSMD10O75832 226 aa22.99■■□□□ 1.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 ICAM1P05362 532 aa22.99■■□□□ 1.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 KCNA1Q09470 495 aa22.99■■□□□ 1.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 CCDC102AQ96A19 550 aa22.99■■□□□ 1.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 GNA14O95837 355 aa22.99■■□□□ 1.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 IVLP07476 585 aa22.99■■□□□ 1.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 FIGNQ5HY92 759 aa22.99■■□□□ 1.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 CCDC125Q86Z20 511 aa22.99■■□□□ 1.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 CCDC170Q8IYT3 715 aa22.99■■□□□ 1.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 UNC45AQ9H3U1 944 aa22.99■■□□□ 1.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 PLAGL2Q9UPG8 496 aa22.99■■□□□ 1.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa22.99■■□□□ 1.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 A0A1W2PQJ5 194 aa22.99■■□□□ 1.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 PHF20L1A8MW92 1017 aa22.99■■□□□ 1.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 SLC26A4O43511 780 aa22.99■■□□□ 1.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 KSR1Q8IVT5 923 aa22.99■■□□□ 1.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 HSD17B14Q9BPX1 270 aa22.99■■□□□ 1.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 HDAC6Q9UBN7 1215 aa22.99■■□□□ 1.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 RCCD1A6NED2 376 aa22.98■■□□□ 1.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 NMT1P30419 496 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 MTFR1LQ9H019 292 aa22.98■■□□□ 1.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.5 ms