RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 GRID2IPA4D2P6 1211 aa16.63■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 USP17L5A8MUK1 530 aa16.63■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 ZNF844Q08AG5 666 aa16.63■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 SEL1L2Q5TEA6 688 aa16.63■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 MYH13Q9UKX3 1938 aa16.63■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa16.62■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 PRLRP16471 622 aa16.62■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 FECHP22830 423 aa16.62■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 STAT3P40763 770 aa16.62■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa16.62■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 ISCUQ9H1K1 167 aa16.62■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 NOD2Q9HC29 1040 aa16.62■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 FAM114A2Q9NRY5 505 aa16.62■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 STK17AQ9UEE5 414 aa16.62■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 STXBP3O00186 592 aa16.62■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 PLA2G4BP0C869 781 aa16.62■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 DGKHQ86XP1 1220 aa16.62■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 RAD54LQ92698 747 aa16.62■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 TNFRSF25Q93038 417 aa16.62■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 SETDB2Q96T68 719 aa16.62■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 DONSONQ9NYP3 566 aa16.62■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 SIK3Q9Y2K2 1263 aa16.62■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 RPL13P26373 211 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 CENPPQ6IPU0 288 aa16.62■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 KCTD1Q719H9 257 aa16.62■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 TAOK1Q7L7X3 1001 aa16.62■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 MYCT1Q8N699 235 aa16.62■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa16.62■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 MINPP1Q9UNW1 487 aa16.62■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa16.61■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 RASSF10A6NK89 507 aa16.61■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 RASGRF2O14827 1237 aa16.61■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 RIMBP2O15034 1052 aa16.61■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 SLC37A4O43826 429 aa16.61■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 AFPP02771 609 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 PCP11498 1178 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa16.61■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 GALNT17Q6IS24 598 aa16.61■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 IFT74Q96LB3 600 aa16.61■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 PLCG2P16885 1265 aa16.61■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 FBF1Q8TES7 1133 aa16.61■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 TTYH3Q9C0H2 523 aa16.61■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 PLCB1Q9NQ66 1216 aa16.61■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 POTEFA5A3E0 1075 aa16.61■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 POTEIP0CG38 1075 aa16.61■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 POTEGQ6S5H5 508 aa16.61■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 POTEEQ6S8J3 1075 aa16.61■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 HS2ST1Q7LGA3 356 aa16.61■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 LRRC34Q8IZ02 419 aa16.61■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 GDF3Q9NR23 364 aa16.61■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 DNM3Q9UQ16 869 aa16.61■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 DNM1LO00429 736 aa16.6■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 GNA14O95837 355 aa16.6■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 GRB10Q13322 594 aa16.6■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 ERMNQ8TAM6 284 aa16.6■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 HOMER3Q9NSC5 361 aa16.6■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 USP17L15C9J2P7 530 aa16.6■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 USP17L13C9JLJ4 530 aa16.6■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 USP17L11C9JVI0 530 aa16.6■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 USP17L18D6R9N7 530 aa16.6■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 USP17L22D6RA61 530 aa16.6■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 USP17L17D6RBQ6 530 aa16.6■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 USP17L19D6RCP7 530 aa16.6■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 USP17L20D6RJB6 530 aa16.6■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 CYTH3O43739 400 aa16.6■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 PMS2P54278 862 aa16.6■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 USP17L24Q0WX57 530 aa16.6■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 ZNF449Q6P9G9 518 aa16.6■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 USP17L6PQ6QN14 398 aa16.6■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 GSTA5Q7RTV2 222 aa16.6■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 KCNK18Q7Z418 384 aa16.6■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 PDHA1P08559 390 aa16.6■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 SNAP25P60880 206 aa16.6■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 SLC29A2Q14542 456 aa16.6■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 PSTPIP2Q9H939 334 aa16.6■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 OSGEPQ9NPF4 335 aa16.6■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 MTUS1Q9ULD2 1270 aa16.6■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa16.59■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 GRM4Q14833 912 aa16.59■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 SETDB1Q15047 1291 aa16.59■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 FIGNQ5HY92 759 aa16.59■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 MEI1Q5TIA1 1274 aa16.59■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 CEP95Q96GE4 821 aa16.59■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 OSBPL7Q9BZF2 842 aa16.59■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 SH3GLB2Q9NR46 395 aa16.59■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 CCDC188H7C350 402 aa16.59■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 HIP1RO75146 1068 aa16.59■□□□□ 0.25
USP25-201ENST00000285679 UBL4BQ8N7F7 174 aa16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms