RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000271857.6

SLC27A3-201, Transcript of solute carrier family 27 member 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC27A3, Length 3,351 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3-201ENST00000271857 NEBLO76041 1014 aa16.06■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 TNFRSF8P28908 595 aa16.06■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 PDIA5Q14554 519 aa16.06■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 CCDC38Q502W7 563 aa16.06■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 KRT79Q5XKE5 535 aa16.06■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 RIC8AQ9NPQ8 531 aa16.06■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 STK38LQ9Y2H1 464 aa16.06■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 LEMD3Q9Y2U8 911 aa16.06■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa16.06■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 SLC16A2P36021 539 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 COASYQ13057 564 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 PSMD2Q13200 908 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 ZCWPW2Q504Y3 356 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 MYOCDQ8IZQ8 938 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 RAB34Q9BZG1 259 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 KLC4Q9NSK0 619 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 SFI1A8K8P3 1242 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 DCDC2CA8MYV0 355 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 FAM83BQ5T0W9 1011 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 DNAJC19Q96DA6 116 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 EDEM3Q9BZQ6 932 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 CEP72Q9P209 647 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa16.05■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 CHRNA5P30532 468 aa16.04■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 OTUD6AQ7L8S5 288 aa16.04■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 PROM2Q8N271 834 aa16.04■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 ZNF831Q5JPB2 1677 aa16.04■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa16.04■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 EPB41P11171 864 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 ALS2CLQ60I27 953 aa16.04■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 CCDC13Q8IYE1 715 aa16.04■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa16.04■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 FBXL5Q9UKA1 691 aa16.04■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 CLIC2O15247 247 aa16.04■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 ITGA4P13612 1032 aa16.04■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 NOVP48745 357 aa16.04■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 TNNC1P63316 161 aa16.04■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 PEX26Q7Z412 305 aa16.04■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 SERPING1P05155 500 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 FLT3P36888 993 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP16.03■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 E9PMD0 336 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 hCG_1984214I3L0E3 225 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 MDH1P40925 334 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 RHBDL3P58872 404 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 GJB7Q6PEY0 223 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 TRIM51Q9BSJ1 452 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 LRRC27Q9C0I9 530 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 GDF3Q9NR23 364 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 PANK4Q9NVE7 773 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 TSKSQ9UJT2 592 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 MYBL1P10243 752 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 PSEN1P49768 467 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 CYP4A11Q02928 519 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 LRRC14Q15048 493 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 SLC30A10Q6XR72 485 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 HAS1Q92839 578 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 EPN3Q9H201 632 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 SUFUQ9UMX1 484 aa16.03■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 PLTPP55058 493 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 ADAM9Q13443 819 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 PPP2R5AQ15172 486 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 NAB2Q15742 525 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 ASIC2Q16515 512 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 QPCTQ16769 361 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 FAM26FQ5R3K3 315 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 FOXR2Q6PJQ5 311 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 MAEAQ7L5Y9 396 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 TBC1D16Q8TBP0 767 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 KIAA1024Q9UPX6 916 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 PTPN22Q9Y2R2 807 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa16.02■□□□□ 0.16
SLC27A3-201ENST00000271857 TTI1O43156 1089 aa16.02■□□□□ 0.15
SLC27A3-201ENST00000271857 SNAP25P60880 206 aa16.02■□□□□ 0.15
SLC27A3-201ENST00000271857 PTGISQ16647 500 aa16.02■□□□□ 0.15
SLC27A3-201ENST00000271857 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms