RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP16.32■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa16.32■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 GGA2Q9UJY4 613 aa16.32■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 FLT3P36888 993 aa16.31■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 ZNF543Q08ER8 600 aa16.31■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
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SYP-201ENST00000263233 CABS1Q96KC9 395 aa16.31■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 ZHX3Q9H4I2 956 aa16.31■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 NENFQ9UMX5 172 aa16.31■□□□□ 0.2
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SYP-201ENST00000263233 PON1P27169 355 aa16.31■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 SLC12A3P55017 1021 aa16.31■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 PPARDQ03181 441 aa16.31■□□□□ 0.2
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SYP-201ENST00000263233 CYFIP2Q96F07 1278 aa16.31■□□□□ 0.2
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SYP-201ENST00000263233 PRKCIP41743 596 aa16.3■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 GPSM2P81274 684 aa16.3■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
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SYP-201ENST00000263233 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
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SYP-201ENST00000263233 KRT18P05783 430 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
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SYP-201ENST00000263233 EXOC3L4Q17RC7 722 aa16.3■□□□□ 0.2
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SYP-201ENST00000263233 GMNCA6NCL1 334 aa16.29■□□□□ 0.2
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SYP-201ENST00000263233 HOXD13P35453 343 aa16.29■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 BIRC3Q13489 604 aa16.29■□□□□ 0.2
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SYP-201ENST00000263233 TRAPPC3O43617 180 aa16.29■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 FLOT1O75955 427 aa16.29■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 POTEIP0CG38 1075 aa16.29■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 IL1R1P14778 569 aa16.29■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 TMOD1P28289 359 aa16.29■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 MFSD14BQ5SR56 506 aa16.29■□□□□ 0.2
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SYP-201ENST00000263233 POTEGQ6S5H5 508 aa16.29■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 POTEEQ6S8J3 1075 aa16.29■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 RUFY4Q6ZNE9 571 aa16.29■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 PEX26Q7Z412 305 aa16.29■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
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SYP-201ENST00000263233 DDR1Q08345 913 aa16.28■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 PICALMQ13492 652 aa16.28■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 GIT2Q14161 759 aa16.28■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 EPHA7Q15375 998 aa16.28■□□□□ 0.2
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SYP-201ENST00000263233 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 ATP8B3O60423 1300 aa16.28■□□□□ 0.2
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SYP-201ENST00000263233 USP17L13C9JLJ4 530 aa16.28■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 USP17L11C9JVI0 530 aa16.28■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 USP17L18D6R9N7 530 aa16.28■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 USP17L22D6RA61 530 aa16.28■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 USP17L17D6RBQ6 530 aa16.28■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 USP17L19D6RCP7 530 aa16.28■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 USP17L20D6RJB6 530 aa16.28■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 UFL1O94874 794 aa16.28■□□□□ 0.2
SYP-201ENST00000263233 RFC4P35249 363 aa16.28■□□□□ 0.2
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