RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262539.7

PTPN3-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPN3, Length 6,832 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3-201ENST00000262539 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 SPC25Q9HBM1 224 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 ODR4Q5SWX8 454 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 ARHGEF16Q5VV41 709 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF662Q6ZS27 426 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 CAPN11Q9UMQ6 739 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 CRCPO75575 148 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 H2AFZP0C0S5 128 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 NR2F2P24468 414 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 TNNC1P63316 161 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 H2AFVQ71UI9 128 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 C4orf19Q8IY42 314 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 C4orf32Q8N8J7 132 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 AFPP02771 609 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 SLC8A3P57103 927 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 STRN3Q13033 797 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 CCDC122Q5T0U0 273 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 NCAPGQ9BPX3 1015 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 CDC23Q9UJX2 597 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 PLAGL2Q9UPG8 496 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 M0R2N6 131 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 TDP2O95551 362 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 NR3C2P08235 984 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 CYP11B2P19099 503 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 MYCT1Q8N699 235 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 C2orf40Q9H1Z8 148 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 VPS16Q9H269 839 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 BHMT2Q9H2M3 363 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 INTUQ9ULD6 942 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 WNT10BO00744 389 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 SLC9A9Q8IVB4 645 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 C12orf56Q8IXR9 622 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 ASAP2O43150 1006 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 APBA1Q02410 837 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 PPATQ06203 517 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 MCM6Q14566 821 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 ARHGEF6Q15052 776 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 SPATA24Q86W54 205 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 CPXCR1Q8N123 301 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 ANKRD35Q8N283 1001 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 RMDN3Q96TC7 470 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 SLC16A2P36021 539 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 KLHL30Q0D2K2 578 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 TTI2Q6NXR4 508 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 SLC5A5Q92911 643 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 WRNIP1Q96S55 665 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 TMEM60Q9H2L4 133 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 STK25O00506 426 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 COASYQ13057 564 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 PCNX4Q63HM2 1172 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 FAM186BQ8IYM0 893 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 RUNDC3BQ96NL0 473 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 MROH8Q9H579 483 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP8.97□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 VAV2P52735 878 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 KIAA0753Q2KHM9 967 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 USP17L6PQ6QN14 398 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 CCT6BQ92526 530 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 PDCD2LQ9BRP1 358 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 ARFGAP3Q9NP61 516 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 CCDC66A2RUB6 948 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 CLK2P49760 499 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 MARSP56192 900 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 SPP2Q13103 211 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 XXYLT1Q8NBI6 393 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 BLZF1Q9H2G9 400 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 MXRA7P84157 204 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 PPP2R5CQ13362 524 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 EXOC3L4Q17RC7 722 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 USH1GQ495M9 461 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 MAATS1Q7Z4T9 603 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 GIMAP7Q8NHV1 300 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 FRMPD4Q14CM0 1322 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 KRT5P13647 590 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 ITIH3Q06033 890 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 GRB10Q13322 594 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 MTMR1Q13613 665 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 CFAP58Q5T655 872 aa8.97□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms