RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258148.11

MDM2-201, Transcript of MDM2 proto-oncogene, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MDM2, Length 1,361 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2-201ENST00000258148 SIRT2Q8IXJ6 389 aa7.31□□□□□ -1.24
MDM2-201ENST00000258148 TOP6BLQ8N6T0 577 aa7.31□□□□□ -1.24
MDM2-201ENST00000258148 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP7.31□□□□□ -1.24
MDM2-201ENST00000258148 CCT6BQ92526 530 aa7.31□□□□□ -1.24
MDM2-201ENST00000258148 GCC1Q96CN9 775 aa7.31□□□□□ -1.24
MDM2-201ENST00000258148 C16orf92Q96LL3 132 aa7.31□□□□□ -1.24
MDM2-201ENST00000258148 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
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MDM2-201ENST00000258148 LGR6Q9HBX8 967 aa7.31□□□□□ -1.24
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MDM2-201ENST00000258148 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
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MDM2-201ENST00000258148 GJD2Q9UKL4 321 aa7.3□□□□□ -1.24
MDM2-201ENST00000258148 EDARQ9UNE0 448 aa7.3□□□□□ -1.24
MDM2-201ENST00000258148 A0A1B0GVC2 190 aa7.29□□□□□ -1.24
MDM2-201ENST00000258148 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa7.29□□□□□ -1.24
MDM2-201ENST00000258148 C7orf72A4D263 438 aa7.29□□□□□ -1.24
MDM2-201ENST00000258148 CAPN8A6NHC0 703 aa7.29□□□□□ -1.24
MDM2-201ENST00000258148 SHISA8B8ZZ34 492 aa7.29□□□□□ -1.24
MDM2-201ENST00000258148 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.241e-15■■□□□ 12.4
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MDM2-201ENST00000258148 NFICP08651 508 aa7.29□□□□□ -1.24
MDM2-201ENST00000258148 CLEC2LP0C7M8 214 aa7.29□□□□□ -1.24
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MDM2-201ENST00000258148 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
MDM2-201ENST00000258148 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
MDM2-201ENST00000258148 PTCHD1Q96NR3 888 aa7.29□□□□□ -1.24
MDM2-201ENST00000258148 CGRRF1Q99675 332 aa7.29□□□□□ -1.24
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MDM2-201ENST00000258148 SRPK3Q9UPE1 567 aa7.29□□□□□ -1.24
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MDM2-201ENST00000258148 PRR33A8MZF0 331 aa7.28□□□□□ -1.24
MDM2-201ENST00000258148 H7BY64 318 aa7.28□□□□□ -1.24
MDM2-201ENST00000258148 SCDO00767 359 aa7.28□□□□□ -1.24
MDM2-201ENST00000258148 KPNA5O15131 536 aa7.28□□□□□ -1.24
MDM2-201ENST00000258148 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
MDM2-201ENST00000258148 HIP1RO75146 1068 aa7.28□□□□□ -1.24
MDM2-201ENST00000258148 CBX7O95931 251 aa7.28□□□□□ -1.24
MDM2-201ENST00000258148 BCRP11274 1271 aa7.28□□□□□ -1.24
MDM2-201ENST00000258148 TNK2Q07912 1038 aa7.28□□□□□ -1.24
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MDM2-201ENST00000258148 SNX17Q15036 470 aa7.28□□□□□ -1.24
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MDM2-201ENST00000258148 DUSP23Q9BVJ7 150 aa7.28□□□□□ -1.24
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MDM2-201ENST00000258148 PRDM12Q9H4Q4 367 aa7.28□□□□□ -1.24
MDM2-201ENST00000258148 ADGRE2Q9UHX3 823 aa7.28□□□□□ -1.24
MDM2-201ENST00000258148 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
MDM2-201ENST00000258148 DYTNA2CJ06 578 aa7.27□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 J3KRW8 73 aa7.27□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 GFRA3O60609 400 aa7.27□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
MDM2-201ENST00000258148 LEFTY1O75610 366 aa7.27□□□□□ -1.25
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