RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256474.2

VHL-201, Transcript of von Hippel-Lindau tumor suppressor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VHL, Length 3,737 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VHL-201ENST00000256474 ZNF233A6NK53 670 aa14.76□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 PSMD2Q13200 908 aa14.76□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 ARSHQ5FYA8 562 aa14.76□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 TRIM59Q8IWR1 403 aa14.76□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 RUSC1Q9BVN2 902 aa14.76□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa14.76□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 TTI1O43156 1089 aa14.75□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 CDK17Q00537 523 aa14.75□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 TMEM119Q4V9L6 283 aa14.75□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 TAX1BP1Q86VP1 789 aa14.75□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 CCDC25Q86WR0 208 aa14.75□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 GPATCH11Q8N954 259 aa14.75□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa14.75□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa14.75□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa14.75□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 SART1O43290 800 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 NR3C1P04150 777 aa14.75□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 H2AFZP0C0S5 128 aa14.75□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 CORO7P57737 925 aa14.75□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 KRT71Q3SY84 523 aa14.75□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 H2AFVQ71UI9 128 aa14.75□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa14.75□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 TADA2BQ86TJ2 420 aa14.75□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 TMOD4Q9NZQ9 345 aa14.75□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 PLCH1Q4KWH8 1693 aa14.74□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 FLT3P36888 993 aa14.74□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 ERVK-9P63128 1117 aa14.74□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 FBXO11Q86XK2 927 aa14.74□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 METTL13Q8N6R0 699 aa14.74□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa14.74□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 FAM86B1E9PN63 330 aa14.74□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 F5H6K3 240 aa14.74□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 FLOT1O75955 427 aa14.74□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 FGGP02679 453 aa14.74□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 FAM86B2P0C5J1 330 aa14.74□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 KLRC3Q07444 240 aa14.74□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 GBP6Q6ZN66 633 aa14.74□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 PROM2Q8N271 834 aa14.74□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 SELENOSQ9BQE4 189 aa14.74□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 ESYT2A0FGR8 921 aa14.74□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 KIF4AO95239 1232 aa14.74□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 MYZAPP0CAP1 466 aa14.74□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 AADACL2Q6P093 401 aa14.74□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 BARGINQ6ZT62 677 aa14.74□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 NAGPAQ9UK23 515 aa14.74□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 MYO1FO00160 1098 aa14.73□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 TRIM37O94972 964 aa14.73□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 GH2P01242 217 aa14.73□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 GYS1P13807 737 aa14.73□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 PON1P27169 355 aa14.73□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 SLCO1A2P46721 670 aa14.73□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 USP38Q8NB14 1042 aa14.73□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 FBXL5Q9UKA1 691 aa14.73□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 CLRN2A0PK11 232 aa14.73□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 POLD1P28340 1107 aa14.73□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 GIT2Q14161 759 aa14.73□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 PPP4R3AQ6IN85 833 aa14.73□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 EML1O00423 815 aa14.73□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 CALUO43852 315 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 SORBS3O60504 671 aa14.73□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 MEI1Q5TIA1 1274 aa14.73□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 FAM186BQ8IYM0 893 aa14.73□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 TSKSQ9UJT2 592 aa14.73□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 EXOC3O60645 756 aa14.72□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 GNA14O95837 355 aa14.72□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 LSP1P33241 339 aa14.72□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 STAT1P42224 750 aa14.72□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 NBPF9Q3BBW0 867 aa14.72□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 ZCWPW2Q504Y3 356 aa14.72□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 ALS2CLQ60I27 953 aa14.72□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 HOOK2Q96ED9 719 aa14.72□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 DYDC2Q96IM9 177 aa14.72□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 CEP63Q96MT8 703 aa14.72□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 AMNQ9BXJ7 453 aa14.72□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 HOMER2Q9NSB8 354 aa14.72□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 PTPN22Q9Y2R2 807 aa14.72□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 A0A1B0GUL6 1792 aa14.72□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 TCP10L2B9ZVM9 353 aa14.72□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
VHL-201ENST00000256474 CRKP46108 304 aa14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms