RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249330.2

VGF-201, Transcript of VGF nerve growth factor inducible, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VGF, Length 2,575 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGF-201ENST00000249330 TUBB8Q3ZCM7 444 aa22.17■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 HAUS3Q68CZ6 603 aa22.17■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 CAVIN3Q969G5 261 aa22.17■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 C7orf25Q9BPX7 421 aa22.17■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 GLT8D2Q9H1C3 349 aa22.17■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 RABEP2Q9H5N1 569 aa22.17■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 TNFRSF8P28908 595 aa22.16■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 SKOR1P84550 965 aa22.16■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 PRKG1Q13976 671 aa22.16■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 C8orf74Q6P047 294 aa22.16■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 AK8Q96MA6 479 aa22.16■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 WRNIP1Q96S55 665 aa22.16■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 PSMB7Q99436 277 aa22.16■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 LCA5LO95447 670 aa22.16■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 CFBP00751 764 aa22.16■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 FCER1AP12319 257 aa22.16■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 MTMR2Q13614 643 aa22.16■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 CNNM4Q6P4Q7 775 aa22.16■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 NUDT12Q9BQG2 462 aa22.16■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 ATAD5Q96QE3 1844 aa22.16■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 CXCR5P32302 372 aa22.15■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 TTMPQ5BVD1 217 aa22.15■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 MYH10P35580 1976 aa22.15■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 ARHGAP4P98171 946 aa22.15■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 AMPD3Q01432 767 aa22.15■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 SPP2Q13103 211 aa22.15■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 NNTQ13423 1086 aa22.15■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 VWA3BQ502W6 1294 aa22.15■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 ARL8AQ96BM9 186 aa22.15■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa22.15■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 FEM1BQ9UK73 627 aa22.15■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 SBF1O95248 1867 aa22.14■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 SPDYE3A6NKU9 549 aa22.14■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 MAGEA1P43355 309 aa22.14■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 CCDC155Q8N6L0 562 aa22.14■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 SIK3Q9Y2K2 1263 aa22.14■■□□□ 1.14
VGF-201ENST00000249330 MARCH6O60337 910 aa22.14■■□□□ 1.13
VGF-201ENST00000249330 AP3B2Q13367 1082 aa22.14■■□□□ 1.13
VGF-201ENST00000249330 CRYGNQ8WXF5 182 aa22.14■■□□□ 1.13
VGF-201ENST00000249330 AGBL1Q96MI9 1066 aa22.14■■□□□ 1.13
VGF-201ENST00000249330 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa22.14■■□□□ 1.13
VGF-201ENST00000249330 MMRN2Q9H8L6 949 aa22.14■■□□□ 1.13
VGF-201ENST00000249330 EHD2Q9NZN4 543 aa22.14■■□□□ 1.13
VGF-201ENST00000249330 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.13
VGF-201ENST00000249330 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
VGF-201ENST00000249330 DCAF15Q66K64 600 aa22.13■■□□□ 1.13
VGF-201ENST00000249330 FAM160B2Q86V87 743 aa22.13■■□□□ 1.13
VGF-201ENST00000249330 NDST4Q9H3R1 872 aa22.13■■□□□ 1.13
VGF-201ENST00000249330 EMILIN3Q9NT22 766 aa22.13■■□□□ 1.13
VGF-201ENST00000249330 EPHB6O15197 1021 aa22.13■■□□□ 1.13
VGF-201ENST00000249330 NCK2O43639 380 aa22.13■■□□□ 1.13
VGF-201ENST00000249330 USP11P51784 963 aa22.13■■□□□ 1.13
VGF-201ENST00000249330 COBLL1Q53SF7 1204 aa22.13■■□□□ 1.13
VGF-201ENST00000249330 LDHDQ86WU2 507 aa22.13■■□□□ 1.13
VGF-201ENST00000249330 CYP2W1Q8TAV3 490 aa22.13■■□□□ 1.13
VGF-201ENST00000249330 SEMA6BQ9H3T3 888 aa22.13■■□□□ 1.13
VGF-201ENST00000249330 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
VGF-201ENST00000249330 TMEM266Q2M3C6 531 aa22.12■■□□□ 1.13
VGF-201ENST00000249330 PRR16Q569H4 304 aa22.12■■□□□ 1.13
VGF-201ENST00000249330 MCTP2Q6DN12 878 aa22.12■■□□□ 1.13
VGF-201ENST00000249330 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa22.12■■□□□ 1.13
VGF-201ENST00000249330 RRAGAQ7L523 313 aa22.12■■□□□ 1.13
VGF-201ENST00000249330 IFT20Q8IY31 132 aa22.12■■□□□ 1.13
VGF-201ENST00000249330 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
VGF-201ENST00000249330 PCDHA12Q9UN75 941 aa22.12■■□□□ 1.13
VGF-201ENST00000249330 SAMM50Q9Y512 469 aa22.12■■□□□ 1.13
VGF-201ENST00000249330 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
VGF-201ENST00000249330 LRRC53A6NM62 1247 aa22.12■■□□□ 1.13
VGF-201ENST00000249330 FAM86B1E9PN63 330 aa22.12■■□□□ 1.13
VGF-201ENST00000249330 NDUFAB1O14561 156 aa22.12■■□□□ 1.13
VGF-201ENST00000249330 PJA2O43164 708 aa22.12■■□□□ 1.13
VGF-201ENST00000249330 PLA2G6O60733 806 aa22.12■■□□□ 1.13
VGF-201ENST00000249330 FAM86B2P0C5J1 330 aa22.12■■□□□ 1.13
VGF-201ENST00000249330 MAN2A1Q16706 1144 aa22.12■■□□□ 1.13
VGF-201ENST00000249330 KIAA0895Q8NCT3 520 aa22.12■■□□□ 1.13
VGF-201ENST00000249330 KAT2BQ92831 832 aa22.12■■□□□ 1.13
VGF-201ENST00000249330 ZIM3Q96PE6 472 aa22.12■■□□□ 1.13
VGF-201ENST00000249330 NOX5Q96PH1 765 aa22.12■■□□□ 1.13
VGF-201ENST00000249330 TANGO6Q9C0B7 1094 aa22.12■■□□□ 1.13
VGF-201ENST00000249330 TSKSQ9UJT2 592 aa22.12■■□□□ 1.13
VGF-201ENST00000249330 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
VGF-201ENST00000249330 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
VGF-201ENST00000249330 VCAM1P19320 739 aa22.11■■□□□ 1.13
VGF-201ENST00000249330 UBXN2AP68543 259 aa22.11■■□□□ 1.13
VGF-201ENST00000249330 APBA1Q02410 837 aa22.11■■□□□ 1.13
VGF-201ENST00000249330 PDCLQ13371 301 aa22.11■■□□□ 1.13
VGF-201ENST00000249330 CFAP221Q4G0U5 840 aa22.11■■□□□ 1.13
VGF-201ENST00000249330 CENPPQ6IPU0 288 aa22.11■■□□□ 1.13
VGF-201ENST00000249330 SCYL3Q8IZE3 742 aa22.11■■□□□ 1.13
VGF-201ENST00000249330 CPXCR1Q8N123 301 aa22.11■■□□□ 1.13
VGF-201ENST00000249330 ZNF112Q9UJU3 913 aa22.11■■□□□ 1.13
VGF-201ENST00000249330 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
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