RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215919.3

PATZ1-201, Transcript of POZ/BTB and AT hook containing zinc finger 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PATZ1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATZ1-201ENST00000215919 RCCD1A6NED2 376 aa22.12■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 AP3B2Q13367 1082 aa22.12■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa22.12■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 SH3GL3Q99963 347 aa22.12■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 AMNQ9BXJ7 453 aa22.12■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa22.12■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 EPHB6O15197 1021 aa22.12■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 NDUFB10O96000 172 aa22.12■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 GUCY1A3Q02108 690 aa22.12■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 CCDC122Q5T0U0 273 aa22.12■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 SPDL1Q96EA4 605 aa22.12■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 PLAGL2Q9UPG8 496 aa22.12■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 ATRNL1Q5VV63 1379 aa22.11■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 PLA2G4BP0C869 781 aa22.11■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 ARHGAP4P98171 946 aa22.11■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 POTEAQ6S8J7 498 aa22.11■■□□□ 1.13
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PATZ1-201ENST00000215919 LACRTQ9GZZ8 138 aa22.11■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 POTEB3A0JP26 581 aa22.11■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 POTECB2RU33 542 aa22.11■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 SLC26A4O43511 780 aa22.11■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 ENTPD3O75355 529 aa22.11■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 SKOR1P84550 965 aa22.11■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 SPIRE1Q08AE8 756 aa22.11■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 FAM26FQ5R3K3 315 aa22.11■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 POTEBQ6S5H4 581 aa22.11■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 ETNPPLQ8TBG4 499 aa22.11■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 ZBTB10Q96DT7 871 aa22.11■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa22.11■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 HAUS2Q9NVX0 235 aa22.11■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 MED24O75448 989 aa22.1■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 STAT3P40763 770 aa22.1■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 SEC24CP53992 1094 aa22.1■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 SLFN12Q8IYM2 578 aa22.1■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa22.1■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 TSG101Q99816 390 aa22.1■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa22.1■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 ENO4A6NNW6 628 aa22.1■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 LSP1P33241 339 aa22.1■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 FBXO11Q86XK2 927 aa22.1■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 ZNF263O14978 683 aa22.09■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 GH2P01242 217 aa22.09■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 CYP11B2P19099 503 aa22.09■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
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PATZ1-201ENST00000215919 KIAA1328Q86T90 577 aa22.09■■□□□ 1.13
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PATZ1-201ENST00000215919 CNKSR1Q969H4 720 aa22.09■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 JAKMIP2Q96AA8 810 aa22.09■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 LENG9Q96B70 501 aa22.09■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 IRAK4Q9NWZ3 460 aa22.09■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 FAM184BQ9ULE4 1060 aa22.09■■□□□ 1.13
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PATZ1-201ENST00000215919 KRT86O43790 486 aa22.09■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 C2orf54Q08AI8 447 aa22.09■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 Q4G0T1 1027 aa22.09■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 CAGE1Q8TC20 777 aa22.09■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa22.09■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 A0A1W2PRG0 241 aa22.08■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 CYP27A1Q02318 531 aa22.08■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 APBA1Q02410 837 aa22.08■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 PPARDQ03181 441 aa22.08■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 SPRED3Q2MJR0 410 aa22.08■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 PRR16Q569H4 304 aa22.08■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 ARSHQ5FYA8 562 aa22.08■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 BTNL9Q6UXG8 535 aa22.08■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 GPBP1Q86WP2 473 aa22.08■■□□□ 1.13
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PATZ1-201ENST00000215919 MMRN2Q9H8L6 949 aa22.08■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 TBC1D7Q9P0N9 293 aa22.08■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PATZ1-201ENST00000215919 YDJCA8MPS7 323 aa22.08■■□□□ 1.12
PATZ1-201ENST00000215919 OPA1O60313 960 aa22.08■■□□□ 1.12
PATZ1-201ENST00000215919 BMP3P12645 472 aa22.08■■□□□ 1.12
PATZ1-201ENST00000215919 SLC12A3P55017 1021 aa22.08■■□□□ 1.12
PATZ1-201ENST00000215919 SNX1Q13596 522 aa22.08■■□□□ 1.12
PATZ1-201ENST00000215919 USH1GQ495M9 461 aa22.08■■□□□ 1.12
PATZ1-201ENST00000215919 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
PATZ1-201ENST00000215919 CATSPER3Q86XQ3 398 aa22.08■■□□□ 1.12
PATZ1-201ENST00000215919 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
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