RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000212355.8

TGFBR3-201, Transcript of transforming growth factor beta receptor 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TGFBR3, Length 6,465 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR3-201ENST00000212355 KRT26Q7Z3Y9 468 aa14.67□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 IKBKBO14920 756 aa14.66□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 GALNT17Q6IS24 598 aa14.66□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 FAF2Q96CS3 445 aa14.66□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 SPC25Q9HBM1 224 aa14.66□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 BAG5Q9UL15 447 aa14.66□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 PFDN1O60925 122 aa14.66□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 S100BP04271 92 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 KDM5CP41229 1560 aa14.66□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa14.66□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 RESP18Q5W5W9 173 aa14.66□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 MTRQ99707 1265 aa14.66□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 KIF28PB7ZC32 967 aa14.66□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 CUL4AQ13619 759 aa14.66□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 IQCB1Q15051 598 aa14.66□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 DYDC2Q96IM9 177 aa14.66□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 MSTO1Q9BUK6 570 aa14.66□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 SLC24A3Q9HC58 644 aa14.66□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 SERPINB13Q9UIV8 391 aa14.66□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 PEG3Q9GZU2 1588 aa14.66□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 PLEKHG3A1L390 1219 aa14.66□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 PSMA2P25787 234 aa14.66□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 KCTD2Q14681 263 aa14.66□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 MS4A14Q96JA4 679 aa14.66□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 DCTN4Q9UJW0 460 aa14.66□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 GOLGA8CPA6NN73 597 aa14.66□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 IRAK4Q9NWZ3 460 aa14.66□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 SLC8A1P32418 973 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 TNFAIP1Q13829 316 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 FAM8A1Q9UBU6 413 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 POTEB3A0JP26 581 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 POTECB2RU33 542 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 PRPSAP2O60256 369 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 GH2P01242 217 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 PDXDC2PQ6P474 469 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 POTEBQ6S5H4 581 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 CYFIP1Q7L576 1253 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 KRT27Q7Z3Y8 459 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 SFR1Q86XK3 245 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 FAM167BQ9BTA0 163 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 PCSK1NQ9UHG2 260 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 ERVK-7P63135 1459 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 E2F8A0AVK6 867 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 USP17L10C9JJH3 530 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 GUCY1A2P33402 732 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 TRAPPC10P48553 1259 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 MXI1P50539 228 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 SDCCAG3Q96C92 435 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 IQCDQ96DY2 449 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 THAP9Q9H5L6 903 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 ANAPC7Q9UJX3 599 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 SLC16A4O15374 487 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 SOX11P35716 441 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 INPP1P49441 399 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 ART3Q13508 389 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 SZRD1Q7Z422 152 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 PYROXD1Q8WU10 500 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 SAAL1Q96ER3 474 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 ABHD10Q9NUJ1 306 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 DNAJC12Q9UKB3 198 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 SOX5P35711 763 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBR3-201ENST00000212355 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa14.65□□□□□ -0.06
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TGFBR3-201ENST00000212355 C21orf2O43822 256 aa14.64□□□□□ -0.07
TGFBR3-201ENST00000212355 TTC4O95801 387 aa14.64□□□□□ -0.07
TGFBR3-201ENST00000212355 POTEIP0CG38 1075 aa14.64□□□□□ -0.07
TGFBR3-201ENST00000212355 CA4P22748 312 aa14.64□□□□□ -0.07
TGFBR3-201ENST00000212355 POTEGQ6S5H5 508 aa14.64□□□□□ -0.07
TGFBR3-201ENST00000212355 POTEEQ6S8J3 1075 aa14.64□□□□□ -0.07
TGFBR3-201ENST00000212355 OR6B3Q8NGW1 331 aa14.64□□□□□ -0.07
TGFBR3-201ENST00000212355 POLIQ9UNA4 740 aa14.64□□□□□ -0.07
TGFBR3-201ENST00000212355 ZBTB22O15209 634 aa14.64□□□□□ -0.07
TGFBR3-201ENST00000212355 FCER1AP12319 257 aa14.64□□□□□ -0.07
TGFBR3-201ENST00000212355 MTM1Q13496 603 aa14.64□□□□□ -0.07
TGFBR3-201ENST00000212355 KIF19Q2TAC6 998 aa14.64□□□□□ -0.07
TGFBR3-201ENST00000212355 HVCN1Q96D96 273 aa14.64□□□□□ -0.07
TGFBR3-201ENST00000212355 NACC1Q96RE7 527 aa14.64□□□□□ -0.07
TGFBR3-201ENST00000212355 ATP10AO60312 1499 aa14.64□□□□□ -0.07
TGFBR3-201ENST00000212355 GUCY2CP25092 1073 aa14.64□□□□□ -0.07
TGFBR3-201ENST00000212355 ABI1Q8IZP0 508 aa14.64□□□□□ -0.07
TGFBR3-201ENST00000212355 FAM213AQ9BRX8 229 aa14.64□□□□□ -0.07
TGFBR3-201ENST00000212355 CREB3O43889 395 aa14.64□□□□□ -0.07
TGFBR3-201ENST00000212355 MMEP08473 750 aa14.64□□□□□ -0.07
TGFBR3-201ENST00000212355 MAP7D3Q8IWC1 876 aa14.64□□□□□ -0.07
TGFBR3-201ENST00000212355 VCX3AQ9NNX9 186 aa14.64□□□□□ -0.07
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