RNA–Protein interactions for RNA: YDR365C

ESF1, Transcript of Nucleolar protein involved in pre-rRNA processing, yeast

Gene ESF1, Length 1,887 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ESF1	YDR365C	SSY1	Q03770	852 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	FMP42	Q04991	504 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	TAF9	Q05027	157 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	COQ9	Q05779	260 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	YOL159C	Q08300	171 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	MUM3	Q08750	479 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	DNF1	P32660	1571 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	TY1B-H	O13535	1793 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	TY1B-DR5	P0C2I2	1755 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	TY1B-DR6	P0C2I3	1755 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	TY1B-LR2	P0C2I5	1755 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	TY1B-LR3	P0C2I6	1755 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	TY1B-PR1	P0C2I9	1755 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	TY1B-PR2	P0C2J0	1756 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	TY1B-PR3	P0C2J1	1755 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	TY1B-JR1	P47098	1755 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	TY1B-ML2	Q03434	1755 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	TY1B-ER1	Q03612	1755 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	TY1B-ML1	Q04711	1755 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	TY1B-GR2	Q12269	1755 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	TY1B-OL	Q12273	1755 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	TY1B-PL	Q12414	1755 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	CDC25	P04821	1589 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	ABF1	P14164	731 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	PTC6	P25646	442 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	YUR1	P26725	428 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	PMT2	P31382	759 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	VAM7	P32912	316 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	YBR144C	P34215	104 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	NAT2	P37293	288 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	SAF1	P38352	637 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	VMA7	P39111	118 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	SEN34	P39707	275 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	FRT2	P39734	528 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	YMR134W	P40207	237 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	FMP32	P43557	207 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	FMP33	P46998	180 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	YJL118W	P47022	219 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	YHC3	P47040	408 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	ROG1	P53118	685 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	YGR079W	P53249	370 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	SOL4	P53315	255 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	EFM6	P53970	246 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	ORC3	P54790	616 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	MUK1	Q02866	612 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	YPL034W	Q03083	165 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	GIM5	Q04493	163 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	RTT103	Q05543	409 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	MHR1	Q06630	226 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	YPR091C	Q06833	770 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	YDL114W	Q07530	308 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	ATG34	Q12292	412 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	MTR10	Q99189	972 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	TY3B-G	Q99315	1547 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	AAC1	P04710	309 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	PHO13	P19881	312 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	ATG22	P25568	528 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	STE14	P32584	239 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	DSS4	P32601	143 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	FRE1	P32791	686 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	CLG1	P35190	452 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	NUP133	P36161	1157 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	MRPL7	P36519	292 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	UFE1	P41834	346 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	TOS3	P43637	560 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	MPS3	P47069	682 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	SAM50	P53969	484 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	YAT1	P80235	687 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	NHP10	Q03435	203 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	GPN3	Q06543	272 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	GRS2	Q06817	618 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.56	□□□□□ -1.68	not detected
ESF1	YDR365C	VAM3	Q12241	283 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	RRD2	Q12461	358 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	YSP2	Q06681	1438 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	CHS2	P14180	963 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	TFC1	P32367	649 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	GPI16	P38875	610 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	TAF6	P53040	516 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	VOA1	P53262	265 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	MRPS35	P53292	345 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	CAF40	P53829	373 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	YMR027W	Q04371	470 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	ARO10	Q06408	635 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ESF1	YDR365C	RAX1	Q08760	435 aa		4.55	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.9 ms