RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP31.46■■■□□ 2.63
CAPNS1-217ENST00000629983 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP31.46■■■□□ 2.63
CAPNS1-217ENST00000629983 GPRASP2Q96D09 838 aa31.46■■■□□ 2.63
CAPNS1-217ENST00000629983 CDHR1Q96JP9 859 aa31.46■■■□□ 2.63
CAPNS1-217ENST00000629983 PLAGL2Q9UPG8 496 aa31.46■■■□□ 2.63
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP9AO75110 1047 aa31.45■■■□□ 2.63
CAPNS1-217ENST00000629983 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP31.45■■■□□ 2.63
CAPNS1-217ENST00000629983 MEIS2O14770 477 aa31.44■■■□□ 2.62
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNA2P16389 499 aa31.44■■■□□ 2.62
CAPNS1-217ENST00000629983 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP31.44■■■□□ 2.62
CAPNS1-217ENST00000629983 ADAM15Q13444 863 aa31.44■■■□□ 2.62
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC01599Q8WXQ3 324 aa31.44■■■□□ 2.62
CAPNS1-217ENST00000629983 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa31.44■■■□□ 2.62
CAPNS1-217ENST00000629983 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP31.43■■■□□ 2.62
CAPNS1-217ENST00000629983 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa31.43■■■□□ 2.62
CAPNS1-217ENST00000629983 E7EWF7 191 aa31.43■■■□□ 2.62
CAPNS1-217ENST00000629983 M0QZ92 97 aa31.43■■■□□ 2.62
CAPNS1-217ENST00000629983 PIK3CDO00329 1044 aa31.43■■■□□ 2.62
CAPNS1-217ENST00000629983 NPAS4Q8IUM7 802 aa31.43■■■□□ 2.62
CAPNS1-217ENST00000629983 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP31.43■■■□□ 2.62
CAPNS1-217ENST00000629983 RUFY2Q8WXA3 655 aa31.43■■■□□ 2.62
CAPNS1-217ENST00000629983 P2RX5Q93086 422 aa31.43■■■□□ 2.62
CAPNS1-217ENST00000629983 ZBTB10Q96DT7 871 aa31.43■■■□□ 2.62
CAPNS1-217ENST00000629983 MYL10Q9BUA6 226 aa31.43■■■□□ 2.62
CAPNS1-217ENST00000629983 SPZ1Q9BXG8 430 aa31.43■■■□□ 2.62
CAPNS1-217ENST00000629983 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP31.43■■■□□ 2.62
CAPNS1-217ENST00000629983 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP31.42■■■□□ 2.62
CAPNS1-217ENST00000629983 KIF5BP33176 963 aa31.42■■■□□ 2.62
CAPNS1-217ENST00000629983 PTH1RQ03431 593 aa31.42■■■□□ 2.62
CAPNS1-217ENST00000629983 IER5Q5VY09 327 aa31.42■■■□□ 2.62
CAPNS1-217ENST00000629983 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa31.42■■■□□ 2.62
CAPNS1-217ENST00000629983 EDAQ92838 391 aa31.42■■■□□ 2.62
CAPNS1-217ENST00000629983 TAF6LQ9Y6J9 622 aa31.42■■■□□ 2.62
CAPNS1-217ENST00000629983 DOCK5Q9H7D0 1870 aa31.42■■■□□ 2.62
CAPNS1-217ENST00000629983 ITGB1P05556 798 aa31.41■■■□□ 2.62
CAPNS1-217ENST00000629983 STAG3L1P0CL83 205 aa31.41■■■□□ 2.62
CAPNS1-217ENST00000629983 MTMR1Q13613 665 aa31.41■■■□□ 2.62
CAPNS1-217ENST00000629983 CAMK1Q14012 370 aa31.41■■■□□ 2.62
CAPNS1-217ENST00000629983 MARCH8Q5T0T0 291 aa31.41■■■□□ 2.62
CAPNS1-217ENST00000629983 KLHL23Q8NBE8 558 aa31.41■■■□□ 2.62
CAPNS1-217ENST00000629983 FTHL17Q9BXU8 183 aa31.41■■■□□ 2.62
CAPNS1-217ENST00000629983 TRPC6Q9Y210 931 aa31.41■■■□□ 2.62
CAPNS1-217ENST00000629983 TRPV2Q9Y5S1 764 aa31.41■■■□□ 2.62
CAPNS1-217ENST00000629983 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP31.4■■■□□ 2.62
CAPNS1-217ENST00000629983 DNAJB1P25685 340 aa31.4■■■□□ 2.62
CAPNS1-217ENST00000629983 NRIP1P48552 1158 aa31.4■■■□□ 2.62
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM62Q0P6H9 643 aa31.4■■■□□ 2.62
CAPNS1-217ENST00000629983 NAALADL2Q58DX5 795 aa31.4■■■□□ 2.62
CAPNS1-217ENST00000629983 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP31.4■■■□□ 2.62
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF654Q8IZM8 581 aa31.4■■■□□ 2.62
CAPNS1-217ENST00000629983 SPPL3Q8TCT6 385 aa31.4■■■□□ 2.62
CAPNS1-217ENST00000629983 POF1BQ8WVV4 589 aa31.4■■■□□ 2.62
CAPNS1-217ENST00000629983 MSLNLQ96KJ4 702 aa31.4■■■□□ 2.62
CAPNS1-217ENST00000629983 PSTPIP2Q9H939 334 aa31.4■■■□□ 2.62
CAPNS1-217ENST00000629983 LRFN2Q9ULH4 789 aa31.4■■■□□ 2.62
CAPNS1-217ENST00000629983 RRN3P2A6NIE6 340 aa31.39■■■□□ 2.62
CAPNS1-217ENST00000629983 INSRRP14616 1297 aa31.39■■■□□ 2.62
CAPNS1-217ENST00000629983 ITGB5P18084 799 aa31.39■■■□□ 2.62
CAPNS1-217ENST00000629983 PAK2Q13177 524 aa31.39■■■□□ 2.62
CAPNS1-217ENST00000629983 EFHBQ8N7U6 833 aa31.39■■■□□ 2.62
CAPNS1-217ENST00000629983 AZI2Q9H6S1 392 aa31.39■■■□□ 2.62
CAPNS1-217ENST00000629983 DDAH1O94760 285 aa31.38■■■□□ 2.61
CAPNS1-217ENST00000629983 SCG2P13521 617 aa31.38■■■□□ 2.61
CAPNS1-217ENST00000629983 ANTXR2P58335 489 aa31.38■■■□□ 2.61
CAPNS1-217ENST00000629983 UBE2SQ16763 222 aa31.38■■■□□ 2.61
CAPNS1-217ENST00000629983 NFXL1Q6ZNB6 911 aa31.38■■■□□ 2.61
CAPNS1-217ENST00000629983 PBXIP1Q96AQ6 731 aa31.38■■■□□ 2.61
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM221A6NGB7 291 aa31.37■■■□□ 2.61
CAPNS1-217ENST00000629983 SPDYE3A6NKU9 549 aa31.37■■■□□ 2.61
CAPNS1-217ENST00000629983 M0R296 226 aa31.37■■■□□ 2.61
CAPNS1-217ENST00000629983 PPFIA3O75145 1194 aa31.37■■■□□ 2.61
CAPNS1-217ENST00000629983 EYA4O95677 639 aa31.37■■■□□ 2.61
CAPNS1-217ENST00000629983 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP31.37■■■□□ 2.61
CAPNS1-217ENST00000629983 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP31.37■■■□□ 2.61
CAPNS1-217ENST00000629983 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP31.37■■■□□ 2.61
CAPNS1-217ENST00000629983 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa31.37■■■□□ 2.61
CAPNS1-217ENST00000629983 LZTS2Q9BRK4 669 aa31.37■■■□□ 2.61
CAPNS1-217ENST00000629983 CLEC1BQ9P126 229 aa31.37■■■□□ 2.61
CAPNS1-217ENST00000629983 PADI3Q9ULW8 664 aa31.37■■■□□ 2.61
CAPNS1-217ENST00000629983 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP31.37■■■□□ 2.61
CAPNS1-217ENST00000629983 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa31.37■■■□□ 2.61
CAPNS1-217ENST00000629983 PLEKHA8P1O95397 391 aa31.36■■■□□ 2.61
CAPNS1-217ENST00000629983 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP31.36■■■□□ 2.61
CAPNS1-217ENST00000629983 GNAQP50148 359 aa31.36■■■□□ 2.61
CAPNS1-217ENST00000629983 CASC1Q6TDU7 716 aa31.36■■■□□ 2.61
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIM67Q6ZTA4 783 aa31.36■■■□□ 2.61
CAPNS1-217ENST00000629983 SMRP1Q8NCR6 262 aa31.36■■■□□ 2.61
CAPNS1-217ENST00000629983 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa31.36■■■□□ 2.61
CAPNS1-217ENST00000629983 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP31.36■■■□□ 2.61
CAPNS1-217ENST00000629983 MAP3K14Q99558 947 aa31.36■■■□□ 2.61
CAPNS1-217ENST00000629983 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP31.36■■■□□ 2.61
CAPNS1-217ENST00000629983 GATMP50440 423 aa31.35■■■□□ 2.61
CAPNS1-217ENST00000629983 TTC22Q5TAA0 569 aa31.35■■■□□ 2.61
CAPNS1-217ENST00000629983 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP31.35■■■□□ 2.61
CAPNS1-217ENST00000629983 PRSS33Q8NF86 280 aa31.35■■■□□ 2.61
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa31.35■■■□□ 2.61
CAPNS1-217ENST00000629983 LY9Q9HBG7 655 aa31.35■■■□□ 2.61
CAPNS1-217ENST00000629983 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP31.35■■■□□ 2.61
CAPNS1-217ENST00000629983 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa31.35■■■□□ 2.61
CAPNS1-217ENST00000629983 SQORQ9Y6N5 450 aa31.35■■■□□ 2.61
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