RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616306.1

UBXN8-208, Transcript of UBX domain protein 8, humanhuman

TSL 5

Gene UBXN8, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8-208ENST00000616306 CCDC82Q8N4S0 544 aa11.64□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 EHBP1Q8NDI1 1231 aa11.64□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 TCEANC2Q96MN5 208 aa11.64□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 KATNAL1Q9BW62 490 aa11.64□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 IL23AQ9NPF7 189 aa11.64□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 MTMR10Q9NXD2 777 aa11.64□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 SNX14Q9Y5W7 946 aa11.64□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa11.63□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa11.63□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa11.63□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa11.63□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 hCG_1984214I3L0E3 225 aa11.63□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 J3QL48 77 aa11.63□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 FIBPO43427 364 aa11.63□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 GGPS1O95749 300 aa11.63□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 F2P00734 622 aa11.63□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 PSMA5P28066 241 aa11.63□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 FGD1P98174 961 aa11.63□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 SP2Q02086 613 aa11.63□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 NEDD9Q14511 834 aa11.63□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 RASIP1Q5U651 963 aa11.63□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 LYPD8Q6UX82 237 aa11.63□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 Q7L0L9 218 aa11.63□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 BAP1Q92560 729 aa11.63□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 KAT2BQ92831 832 aa11.63□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 SPATA33Q96N06 139 aa11.63□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 AGXT2Q9BYV1 514 aa11.63□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 UMODL1Q5DID0 1318 aa11.62□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 TANC1Q9C0D5 1861 aa11.62□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 DOCK5Q9H7D0 1870 aa11.62□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 TMEM265A0A087WTH1 108 aa11.62□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa11.62□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 GOLGA8AA7E2F4 631 aa11.62□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 GOLGA8BA8MQT2 603 aa11.62□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 HAS3O00219 553 aa11.62□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 PFKMP08237 780 aa11.62□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 CYP2C9P11712 490 aa11.62□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 CCL23P55773 120 aa11.62□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 SH3BP2P78314 561 aa11.62□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 HSDL1Q3SXM5 330 aa11.62□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 ZNF365Q70YC5 407 aa11.62□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa11.62□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 HERVK_113Q902F9 699 aa11.62□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 SENP7Q9BQF6 1050 aa11.62□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 FAM117AQ9C073 453 aa11.62□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 WNT8AQ9H1J5 351 aa11.62□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 MLXIPQ9HAP2 919 aa11.62□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 AAASQ9NRG9 546 aa11.62□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 SCN5AQ14524 2016 aa11.61□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 SPDYE3A6NKU9 549 aa11.61□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 LILRB3O75022 631 aa11.61□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 FGBP02675 491 aa11.61□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 ACRP10323 421 aa11.61□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 CPA1P15085 419 aa11.61□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 RPS6KB1P23443 525 aa11.61□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 RFC2P35250 354 aa11.61□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 SEMA3FQ13275 785 aa11.61□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 BFSP2Q13515 415 aa11.61□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 PTGISQ16647 500 aa11.61□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 WWC2Q6AWC2 1192 aa11.61□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 METTL7BQ6UX53 244 aa11.61□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 Q6ZUG5 572 aa11.61□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 NLRX1Q86UT6 975 aa11.61□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 CCDC155Q8N6L0 562 aa11.61□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 C7orf31Q8N865 590 aa11.61□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 RETREG2Q8NC44 543 aa11.61□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 CAGE1Q8TC20 777 aa11.61□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP11.61□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 BRF1Q92994 677 aa11.61□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 GPRASP2Q96D09 838 aa11.61□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 CDHR1Q96JP9 859 aa11.61□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 GLT8D2Q9H1C3 349 aa11.61□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 EHMT1Q9H9B1 1298 aa11.61□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 RTEL1Q9NZ71 1219 aa11.61□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 MAP10Q9P2G4 905 aa11.61□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa11.61□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 NOD1Q9Y239 953 aa11.61□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa11.61□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 NID2Q14112 1375 aa11.61□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 MAFGO15525 162 aa11.6□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 FOSP01100 380 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 ZNF286BP0CG31 522 aa11.6□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 CDC27P30260 824 aa11.6□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 ADD1P35611 737 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP11.6□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 NAPAP54920 295 aa11.6□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 EVCP57679 992 aa11.6□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 CHMP4BP1P59074 171 aa11.6□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 RBL2Q08999 1139 aa11.6□□□□□ -0.55
UBXN8-208ENST00000616306 APOBRQ0VD83 1088 aa11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms