RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597259.1

HERC3-212, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 313 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-212ENST00000597259 CYFIP1Q7L576 1253 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 ZNF804AQ7Z570 1209 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 CLMNQ96JQ2 1002 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 HSPA12BQ96MM6 686 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 PPP1R16BQ96T49 567 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 MEIS3Q99687 375 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 MCOLN1Q9GZU1 580 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 DEFB129Q9H1M3 183 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 KCNK12Q9HB15 430 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 SEMA3GQ9NS98 782 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 SMC4Q9NTJ3 1288 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 SAGE1Q9NXZ1 904 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 TLR6Q9Y2C9 796 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 MROH5Q6ZUA9 1318 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 EYA2O00167 538 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 CA12O43570 354 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 USP2O75604 605 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 BCAR3O75815 825 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 KCNJ4P48050 445 aa6.67□□□□□ -1.34
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HERC3-212ENST00000597259 LIG3P49916 1009 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 PRKG1Q13976 671 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 SEPT6Q14141 434 aa6.67□□□□□ -1.34
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HERC3-212ENST00000597259 DLGAP5Q15398 846 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 MFSD14BQ5SR56 506 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 LMCD1Q9NZU5 365 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 PCDHA4Q9UN74 947 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 SAMM50Q9Y512 469 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 KIF16BQ96L93 1317 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 SIPA1L1O43166 1804 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 PHIPQ8WWQ0 1821 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 MYH2Q9UKX2 1941 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 SLITRK5O94991 958 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
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HERC3-212ENST00000597259 CACNB3P54284 484 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 INPP5AQ14642 412 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 RASA3Q14644 834 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 TAF7LQ5H9L4 462 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 TMEM67Q5HYA8 995 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 METTL24Q5JXM2 366 aa6.66□□□□□ -1.34
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HERC3-212ENST00000597259 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
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HERC3-212ENST00000597259 DIRC2Q96SL1 478 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 PTPN18Q99952 460 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.66□□□□□ -1.34
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HERC3-212ENST00000597259 RFX7Q2KHR2 1363 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 DOCK2Q92608 1830 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 FANCGO15287 622 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 CIAO1O76071 339 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 TBC1D8O95759 1140 aa6.65□□□□□ -1.34
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HERC3-212ENST00000597259 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 ADORA1P30542 326 aa6.65□□□□□ -1.34
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HERC3-212ENST00000597259 MTX1Q13505 466 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 LRRC14Q15048 493 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 LRFN4Q6PJG9 635 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 ARHGAP45Q92619 1136 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 WNK4Q96J92 1243 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 TMEM39BQ9GZU3 492 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC3-212ENST00000597259 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
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HERC3-212ENST00000597259 CYP8B1Q9UNU6 501 aa6.65□□□□□ -1.34
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HERC3-212ENST00000597259 PTPRFP10586 1907 aa6.65□□□□□ -1.34
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HERC3-212ENST00000597259 H3BS24 57 aa6.64□□□□□ -1.35
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HERC3-212ENST00000597259 PHKA1P46020 1223 aa6.64□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
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HERC3-212ENST00000597259 AGMOQ6ZNB7 445 aa6.64□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 PHC3Q8NDX5 983 aa6.64□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 PLPPR2Q96GM1 343 aa6.64□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 ZDHHC15Q96MV8 337 aa6.64□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 MRIQ9BWK5 157 aa6.64□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 SIL1Q9H173 461 aa6.64□□□□□ -1.35
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