RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589550.1

PIK3C3-211, Transcript of phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

TSL 3

Gene PIK3C3, Length 597 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3-211ENST00000589550 KRIT1O00522 736 aa6.71□□□□□ -1.34
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PIK3C3-211ENST00000589550 SH3BP5O60239 455 aa6.71□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 CEACAM5P06731 702 aa6.71□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 AGXTP21549 392 aa6.71□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 GJA4P35212 333 aa6.71□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 CORO7P57737 925 aa6.71□□□□□ -1.34
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PIK3C3-211ENST00000589550 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa6.71□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 CYP4F22Q6NT55 531 aa6.71□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa6.71□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 WAPLQ7Z5K2 1190 aa6.71□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 EVI5LQ96CN4 794 aa6.71□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 C7orf69Q9H7B7 122 aa6.71□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 FAM204AQ9H8W3 233 aa6.71□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 SLC6A20Q9NP91 592 aa6.71□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 MARCH2Q9P0N8 246 aa6.71□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 DSEQ9UL01 958 aa6.71□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 FAM50BQ9Y247 325 aa6.71□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 CCDC189A1A4V9 331 aa6.7□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 FAM170BA6NMN3 283 aa6.7□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 WASH4PA8MWX3 477 aa6.7□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 C22orf46C9J442 243 aa6.7□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 KCNK3O14649 394 aa6.7□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 PMM2O15305 246 aa6.7□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 MAFKO60675 156 aa6.7□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 HRGP04196 525 aa6.7□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 COL6A2P12110 1019 aa6.7□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 MTHFD2P13995 350 aa6.7□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 RHCEP18577 417 aa6.7□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 FPR2P25090 351 aa6.7□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 RPL10P27635 214 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 MTNR1BP49286 362 aa6.7□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 RHDQ02161 417 aa6.7□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 EGR3Q06889 387 aa6.7□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 RAPGEF1Q13905 1077 aa6.7□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 ATAT1Q5SQI0 421 aa6.7□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 FSTL4Q6MZW2 842 aa6.7□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 CREG2Q8IUH2 290 aa6.7□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 TEX2Q8IWB9 1127 aa6.7□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 TMEM52Q8NDY8 209 aa6.7□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 SH3RF2Q8TEC5 729 aa6.7□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 DCAF5Q96JK2 942 aa6.7□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 MS4A5Q9H3V2 200 aa6.7□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 KLHL11Q9NVR0 708 aa6.7□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa6.7□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 GULP1Q9UBP9 304 aa6.7□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 MSRAQ9UJ68 235 aa6.7□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 PHTF1Q9UMS5 762 aa6.7□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 RAXQ9Y2V3 346 aa6.7□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 ZNF281Q9Y2X9 895 aa6.7□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa6.7□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 SNX11Q9Y5W9 270 aa6.7□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 ZBED1O96006 694 aa6.69□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 SDHAP31040 664 aa6.69□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 USP14P54578 494 aa6.69□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 CHRNA2Q15822 529 aa6.69□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 NLGN2Q8NFZ4 835 aa6.69□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa6.69□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa6.69□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 HPS3Q969F9 1004 aa6.69□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 TNIP3Q96KP6 325 aa6.69□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 C16orf92Q96LL3 132 aa6.69□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 WNT8AQ9H1J5 351 aa6.69□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 SEMA3GQ9NS98 782 aa6.69□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 STOML1Q9UBI4 398 aa6.69□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 DNM3Q9UQ16 869 aa6.69□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 HMX2A2RU54 273 aa6.68□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 TPP1O14773 563 aa6.68□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 POU2F2P09086 479 aa6.68□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 SLC5A3P53794 718 aa6.68□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 KRT72Q14CN4 511 aa6.68□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 EMC4Q5J8M3 183 aa6.68□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 CPZQ66K79 652 aa6.68□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 LILRA6Q6PI73 481 aa6.68□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 ZPBP2Q6X784 338 aa6.68□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa6.68□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 KCTD1Q719H9 257 aa6.68□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 RAX2Q96IS3 184 aa6.68□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 MAML3Q96JK9 1138 aa6.68□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 MAP3K14Q99558 947 aa6.68□□□□□ -1.34
PIK3C3-211ENST00000589550 NLRC4Q9NPP4 1024 aa6.68□□□□□ -1.34
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