RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585084.5

GPS1-225, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 997 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-225	ENST00000585084	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		32.5	■■■□□ 2.79
GPS1-225	ENST00000585084	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		32.49	■■■□□ 2.79
GPS1-225	ENST00000585084	IGBP1	P78318	339 aa		32.49	■■■□□ 2.79
GPS1-225	ENST00000585084	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	32.49	■■■□□ 2.79
GPS1-225	ENST00000585084	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	32.49	■■■□□ 2.79
GPS1-225	ENST00000585084	MEIS1	O00470	390 aa		32.48	■■■□□ 2.79
GPS1-225	ENST00000585084	LPXN	O60711	386 aa		32.48	■■■□□ 2.79
GPS1-225	ENST00000585084	CHRNA1	P02708	482 aa		32.48	■■■□□ 2.79
GPS1-225	ENST00000585084	RPS6KB1	P23443	525 aa		32.48	■■■□□ 2.79
GPS1-225	ENST00000585084	ACTR2	P61160	394 aa		32.48	■■■□□ 2.79
GPS1-225	ENST00000585084	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		32.48	■■■□□ 2.79
GPS1-225	ENST00000585084	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		32.48	■■■□□ 2.79
GPS1-225	ENST00000585084	PCYT2	Q99447	389 aa		32.48	■■■□□ 2.79
GPS1-225	ENST00000585084	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	32.48	■■■□□ 2.79
GPS1-225	ENST00000585084	TRPC6	Q9Y210	931 aa		32.48	■■■□□ 2.79
GPS1-225	ENST00000585084	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	32.47	■■■□□ 2.79
GPS1-225	ENST00000585084	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	32.47	■■■□□ 2.79
GPS1-225	ENST00000585084	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	32.47	■■■□□ 2.79
GPS1-225	ENST00000585084	AAK1	Q2M2I8	961 aa		32.47	■■■□□ 2.79
GPS1-225	ENST00000585084	FBXL16	Q8N461	479 aa		32.47	■■■□□ 2.79
GPS1-225	ENST00000585084	TOP1MT	Q969P6	601 aa		32.47	■■■□□ 2.79
GPS1-225	ENST00000585084	C6orf50	Q9HD87	102 aa		32.47	■■■□□ 2.79
GPS1-225	ENST00000585084	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		32.47	■■■□□ 2.79
GPS1-225	ENST00000585084	TRANK1	O15050	2925 aa		32.46	■■■□□ 2.79
GPS1-225	ENST00000585084	UPP2	O95045	317 aa		32.46	■■■□□ 2.79
GPS1-225	ENST00000585084	INSRR	P14616	1297 aa		32.46	■■■□□ 2.79
GPS1-225	ENST00000585084	STAT5B	P51692	787 aa		32.46	■■■□□ 2.79
GPS1-225	ENST00000585084	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	32.46	■■■□□ 2.79
GPS1-225	ENST00000585084	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		32.46	■■■□□ 2.79
GPS1-225	ENST00000585084	MCTP2	Q6DN12	878 aa		32.46	■■■□□ 2.79
GPS1-225	ENST00000585084	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		32.46	■■■□□ 2.79
GPS1-225	ENST00000585084	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		32.46	■■■□□ 2.79
GPS1-225	ENST00000585084	YME1L1	Q96TA2	773 aa		32.46	■■■□□ 2.79
GPS1-225	ENST00000585084	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		32.46	■■■□□ 2.79
GPS1-225	ENST00000585084	ESYT2	A0FGR8	921 aa		32.45	■■■□□ 2.79
GPS1-225	ENST00000585084	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	32.45	■■■□□ 2.79
GPS1-225	ENST00000585084	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	32.45	■■■□□ 2.79
GPS1-225	ENST00000585084	GHR	P10912	638 aa		32.45	■■■□□ 2.79
GPS1-225	ENST00000585084	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		32.45	■■■□□ 2.79
GPS1-225	ENST00000585084	NID2	Q14112	1375 aa		32.45	■■■□□ 2.78
GPS1-225	ENST00000585084	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	32.44	■■■□□ 2.78
GPS1-225	ENST00000585084	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		32.44	■■■□□ 2.78
GPS1-225	ENST00000585084	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	32.44	■■■□□ 2.78
GPS1-225	ENST00000585084	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		32.44	■■■□□ 2.78
GPS1-225	ENST00000585084	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		32.44	■■■□□ 2.78
GPS1-225	ENST00000585084	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		32.44	■■■□□ 2.78
GPS1-225	ENST00000585084	COG5	Q9UP83	839 aa		32.44	■■■□□ 2.78
GPS1-225	ENST00000585084	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	32.43	■■■□□ 2.78
GPS1-225	ENST00000585084	TNFRSF10A	O00220	468 aa		32.43	■■■□□ 2.78
GPS1-225	ENST00000585084	GNA11	P29992	359 aa		32.43	■■■□□ 2.78
GPS1-225	ENST00000585084	TFF2	Q03403	129 aa		32.43	■■■□□ 2.78
GPS1-225	ENST00000585084	MGAT3	Q09327	533 aa		32.43	■■■□□ 2.78
GPS1-225	ENST00000585084	PLCB4	Q15147	1175 aa		32.43	■■■□□ 2.78
GPS1-225	ENST00000585084	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
GPS1-225	ENST00000585084	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		32.43	■■■□□ 2.78
GPS1-225	ENST00000585084	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
GPS1-225	ENST00000585084	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	32.42	■■■□□ 2.78
GPS1-225	ENST00000585084	CYP3A4	P08684	503 aa		32.42	■■■□□ 2.78
GPS1-225	ENST00000585084	LPIN1	Q14693	890 aa		32.42	■■■□□ 2.78
GPS1-225	ENST00000585084	PKN1	Q16512	942 aa		32.42	■■■□□ 2.78
GPS1-225	ENST00000585084	PHKB	Q93100	1093 aa		32.42	■■■□□ 2.78
GPS1-225	ENST00000585084	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		32.42	■■■□□ 2.78
GPS1-225	ENST00000585084	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	32.42	■■■□□ 2.78
GPS1-225	ENST00000585084	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		32.42	■■■□□ 2.78
GPS1-225	ENST00000585084	SI	P14410	1827 aa		32.42	■■■□□ 2.78
GPS1-225	ENST00000585084	FAM86B1	E9PN63	330 aa		32.41	■■■□□ 2.78
GPS1-225	ENST00000585084	ATG7	O95352	703 aa		32.41	■■■□□ 2.78
GPS1-225	ENST00000585084	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		32.41	■■■□□ 2.78
GPS1-225	ENST00000585084	SLC26A2	P50443	739 aa		32.41	■■■□□ 2.78
GPS1-225	ENST00000585084	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	32.41	■■■□□ 2.78
GPS1-225	ENST00000585084	IER5	Q5VY09	327 aa		32.41	■■■□□ 2.78
GPS1-225	ENST00000585084	SAMD11	Q96NU1	681 aa		32.41	■■■□□ 2.78
GPS1-225	ENST00000585084	POTEB3	A0JP26	581 aa		32.4	■■■□□ 2.78
GPS1-225	ENST00000585084		M0QZ92	97 aa		32.4	■■■□□ 2.78
GPS1-225	ENST00000585084	BACH1	O14867	736 aa		32.4	■■■□□ 2.78
GPS1-225	ENST00000585084	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	32.4	■■■□□ 2.78
GPS1-225	ENST00000585084	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		32.4	■■■□□ 2.78
GPS1-225	ENST00000585084	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		32.4	■■■□□ 2.78
GPS1-225	ENST00000585084	POTEB	Q6S5H4	581 aa		32.4	■■■□□ 2.78
GPS1-225	ENST00000585084	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		32.4	■■■□□ 2.78
GPS1-225	ENST00000585084	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	32.4	■■■□□ 2.78
GPS1-225	ENST00000585084	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	32.4	■■■□□ 2.78
GPS1-225	ENST00000585084	NEFL	P07196	543 aa		32.39	■■■□□ 2.78
GPS1-225	ENST00000585084	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		32.39	■■■□□ 2.78
GPS1-225	ENST00000585084	BICD2	Q8TD16	824 aa		32.39	■■■□□ 2.78
GPS1-225	ENST00000585084	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		32.39	■■■□□ 2.78
GPS1-225	ENST00000585084	HLA-C	Q95604	372 aa		32.39	■■■□□ 2.78
GPS1-225	ENST00000585084	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		32.39	■■■□□ 2.78
GPS1-225	ENST00000585084	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		32.39	■■■□□ 2.78
GPS1-225	ENST00000585084	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	32.38	■■■□□ 2.77
GPS1-225	ENST00000585084	CCNE2	O96020	404 aa		32.38	■■■□□ 2.77
GPS1-225	ENST00000585084	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	32.38	■■■□□ 2.77
GPS1-225	ENST00000585084	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	32.38	■■■□□ 2.77
GPS1-225	ENST00000585084	NTRK3	Q16288	839 aa		32.38	■■■□□ 2.77
GPS1-225	ENST00000585084	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		32.38	■■■□□ 2.77
GPS1-225	ENST00000585084	RUFY3	Q7L099	469 aa		32.38	■■■□□ 2.77
GPS1-225	ENST00000585084	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		32.38	■■■□□ 2.77
GPS1-225	ENST00000585084	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		32.38	■■■□□ 2.77
GPS1-225	ENST00000585084	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		32.37	■■■□□ 2.77
GPS1-225	ENST00000585084	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		32.37	■■■□□ 2.77

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