RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577827.5

PTPRM-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 2

Gene PTPRM, Length 4,640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-205	ENST00000577827	GUCY1A3	Q02108	690 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PTPRM-205	ENST00000577827	SLC20A2	Q08357	652 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PTPRM-205	ENST00000577827	KCNH2	Q12809	1159 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PTPRM-205	ENST00000577827	GRM4	Q14833	912 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PTPRM-205	ENST00000577827	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PTPRM-205	ENST00000577827	DPH6	Q7L8W6	267 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PTPRM-205	ENST00000577827	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PTPRM-205	ENST00000577827	ACCS	Q96QU6	501 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PTPRM-205	ENST00000577827	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PTPRM-205	ENST00000577827	TRIM9	Q9C026	710 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PTPRM-205	ENST00000577827	MIS12	Q9H081	205 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PTPRM-205	ENST00000577827	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PTPRM-205	ENST00000577827	BARHL2	Q9NY43	387 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PTPRM-205	ENST00000577827	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PTPRM-205	ENST00000577827	GGPS1	O95749	300 aa		11.21	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	BAG2	O95816	211 aa		11.21	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	CD19	P15391	556 aa		11.21	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	PRLR	P16471	622 aa		11.21	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	MECOM	Q03112	1051 aa		11.21	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	SCARF1	Q14162	830 aa		11.21	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	PLCB4	Q15147	1175 aa		11.21	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	PDCD7	Q8N8D1	485 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	PNKP	Q96T60	521 aa		11.21	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	THEG	Q9P2T0	379 aa		11.21	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	SNX24	Q9Y343	169 aa		11.21	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	XDH	P47989	1333 aa		11.21	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	EXOC1L	A0A1B0GW35	172 aa		11.21	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	INHBA	P08476	426 aa		11.21	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		11.21	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	FAM107A	O95990	144 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	USP17L8	P0C7I0	530 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	SPARCL1	Q14515	664 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	TMED2	Q15363	201 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	SLC18A3	Q16572	532 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	YY1AP1	Q9H869	796 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	TRPC6	Q9Y210	931 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	PFAS	O15067	1338 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	RFX1	P22670	979 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	SIK1	P57059	783 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	CCDC93	Q567U6	631 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	NUF2	Q9BZD4	464 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	STOML1	Q9UBI4	398 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	PPP1R3G	B7ZBB8	358 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	LRRN2	O75325	713 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	ABCD1	P33897	745 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	MXI1	P50539	228 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	ICA1	Q05084	483 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	COASY	Q13057	564 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	AP3B2	Q13367	1082 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	LRRC31	Q6UY01	552 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	ZNF185	O15231	689 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	CLIC2	O15247	247 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	11.2	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	NLRX1	Q86UT6	975 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	COA7	Q96BR5	231 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	FOXP2	O15409	715 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	MAP3K7	O43318	606 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	SLC8A3	P57103	927 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	GTF2I	P78347	998 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	ST3GAL1	Q11201	340 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	RFFL	Q8WZ73	363 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	STAM2	O75886	525 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	AGT	P01019	485 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	CA4	P22748	312 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	PDIA5	Q14554	519 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	TSC22D3	Q99576	134 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	DNAJC7	Q99615	494 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	GMNN	O75496	209 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	ZNF18	P17022	549 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	MSH2	P43246	934 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PTPRM-205	ENST00000577827	TPD52	P55327	224 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62

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