RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM126BQ8IXS8 530 aa37.29■■■■□ 3.56
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CTDNEP1-209ENST00000574205 RNPEPQ9H4A4 650 aa37.28■■■■□ 3.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP37.28■■■■□ 3.56
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CTDNEP1-209ENST00000574205 MARK3P27448 753 aa37.27■■■■□ 3.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 HDAC6Q9UBN7 1215 aa37.27■■■■□ 3.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 GABBR1Q9UBS5 961 aa37.27■■■■□ 3.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa37.27■■■■□ 3.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP37.26■■■■□ 3.56
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CTDNEP1-209ENST00000574205 PDXDC2PQ6P474 469 aa37.26■■■■□ 3.56
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa37.25■■■■□ 3.55
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CTDNEP1-209ENST00000574205 C7orf61Q8IZ16 206 aa37.25■■■■□ 3.55
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CTDNEP1-209ENST00000574205 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP37.24■■■■□ 3.55
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM266Q2M3C6 531 aa37.23■■■■□ 3.55
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CTDNEP1-209ENST00000574205 POTEB3A0JP26 581 aa37.21■■■■□ 3.55
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CTDNEP1-209ENST00000574205 POTEBQ6S5H4 581 aa37.21■■■■□ 3.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 CKAP2LQ8IYA6 745 aa37.21■■■■□ 3.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATP8B4Q8TF62 1192 aa37.21■■■■□ 3.55
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CTDNEP1-209ENST00000574205 C17orf102A2RUQ5 167 aa37.2■■■■□ 3.55
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CTDNEP1-209ENST00000574205 UGCGQ16739 394 aa37.2■■■■□ 3.55
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CTDNEP1-209ENST00000574205 NOD1Q9Y239 953 aa37.2■■■■□ 3.55
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CTDNEP1-209ENST00000574205 PSMC5P62195 406 aa37.19■■■■□ 3.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 PPFIA1Q13136 1202 aa37.19■■■■□ 3.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 DTHD1Q6ZMT9 781 aa37.19■■■■□ 3.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 BANK1Q8NDB2 785 aa37.19■■■■□ 3.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP37.19■■■■□ 3.54
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CTDNEP1-209ENST00000574205 RAB34Q9BZG1 259 aa37.19■■■■□ 3.54
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CTDNEP1-209ENST00000574205 NEK9Q8TD19 979 aa37.18■■■■□ 3.54
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TBX21Q9UL17 535 aa37.16■■■■□ 3.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZDHHC9Q9Y397 364 aa37.16■■■■□ 3.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 OATP04181 439 aa37.15■■■■□ 3.54
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP37.15■■■■□ 3.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 CTAGE1Q96RT6 745 aa37.15■■■■□ 3.54
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