RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574099.1

CCDC40-211, Transcript of coiled-coil domain containing 40, humanhuman

TSL 4

Gene CCDC40, Length 537 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC40-211ENST00000574099 PTPN5P54829 565 aa20.21■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 IGBP1P78318 339 aa20.21■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa20.21■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa20.21■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa20.21■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 IL25Q9H293 177 aa20.21■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
CCDC40-211ENST00000574099 EYA4O95677 639 aa20.2■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 PCNX4Q63HM2 1172 aa20.2■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 USP17L6PQ6QN14 398 aa20.2■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa20.2■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 KLHL23Q8NBE8 558 aa20.2■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 SMRP1Q8NCR6 262 aa20.2■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 SPPL3Q8TCT6 385 aa20.2■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 POF1BQ8WVV4 589 aa20.2■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 P2RX5Q93086 422 aa20.2■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 PKD2L1Q9P0L9 805 aa20.2■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 LOC730098B7Z3J9 87 aa20.19■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 HIP1O00291 1037 aa20.19■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 ATP9AO75110 1047 aa20.19■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 GLP2RO95838 553 aa20.19■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 GATMP50440 423 aa20.19■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 ZXDAP98168 799 aa20.19■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 NLRX1Q86UT6 975 aa20.19■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 EFHBQ8N7U6 833 aa20.19■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 SENP7Q9BQF6 1050 aa20.19■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 FAM86C1Q9NVL1 165 aa20.19■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 PPFIA3O75145 1194 aa20.18■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 TMEM62Q0P6H9 643 aa20.18■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 TCF15Q12870 199 aa20.18■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 TRDNQ13061 729 aa20.18■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 MARCH8Q5T0T0 291 aa20.18■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 NPAS4Q8IUM7 802 aa20.18■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 GLG1Q92896 1179 aa20.18■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 CUL5Q93034 780 aa20.18■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 ERAP1Q9NZ08 941 aa20.18■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 USP34Q70CQ2 3546 aa20.18■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa20.17■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 ERICH2A1L162 156 aa20.17■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 KCNA2P16389 499 aa20.17■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 RBM10P98175 930 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 COASYQ13057 564 aa20.17■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 WTAPQ15007 396 aa20.17■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 CHD1LQ86WJ1 897 aa20.17■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 FBXL6Q8N531 539 aa20.17■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa20.17■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 OSBPL3Q9H4L5 887 aa20.17■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 VCPP55072 806 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 TROAPQ12815 778 aa20.16■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 NAALADL2Q58DX5 795 aa20.16■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 SMC5Q8IY18 1101 aa20.16■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 SEPT1Q8WYJ6 367 aa20.16■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 MEIS2O14770 477 aa20.15■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 PER2O15055 1255 aa20.15■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 ST18O60284 1047 aa20.15■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 SCG2P13521 617 aa20.15■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 XRRA1Q6P2D8 792 aa20.15■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 GPRASP2Q96D09 838 aa20.15■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 PRRX2Q99811 253 aa20.15■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 TLE6Q9H808 572 aa20.15■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 PADI3Q9ULW8 664 aa20.15■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 TRPV2Q9Y5S1 764 aa20.15■□□□□ 0.82
CCDC40-211ENST00000574099 M0QZ92 97 aa20.14■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 STAG3L1P0CL83 205 aa20.14■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 INSRRP14616 1297 aa20.14■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 PAK2Q13177 524 aa20.14■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 PKN1Q16512 942 aa20.14■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 IER5Q5VY09 327 aa20.14■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 CATIPQ7Z7H3 387 aa20.14■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 CRIPAKQ8N1N5 446 aa20.14■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa20.14■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa20.14■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 MYL10Q9BUA6 226 aa20.14■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 FTHL17Q9BXU8 183 aa20.14■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa20.14■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 LRFN2Q9ULH4 789 aa20.14■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 TAF6LQ9Y6J9 622 aa20.14■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 GFRA3O60609 400 aa20.13■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 CYP21A2P08686 494 aa20.13■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 ITGB5P18084 799 aa20.13■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 SIGLEC14Q08ET2 396 aa20.13■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 TMEM266Q2M3C6 531 aa20.13■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 TRPC6Q9Y210 931 aa20.13■□□□□ 0.81
CCDC40-211ENST00000574099 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms