RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569270.5

CHTF18-218, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 5

Gene CHTF18, Length 711 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-218ENST00000569270 TOP1MTQ969P6 601 aa22.07■■□□□ 1.12
CHTF18-218ENST00000569270 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CHTF18-218ENST00000569270 SNX14Q9Y5W7 946 aa22.07■■□□□ 1.12
CHTF18-218ENST00000569270 BMP1P13497 986 aa22.06■■□□□ 1.12
CHTF18-218ENST00000569270 INSRRP14616 1297 aa22.06■■□□□ 1.12
CHTF18-218ENST00000569270 HSPA4P34932 840 aa22.06■■□□□ 1.12
CHTF18-218ENST00000569270 ZNF76P36508 570 aa22.06■■□□□ 1.12
CHTF18-218ENST00000569270 SREBF1P36956 1147 aa22.06■■□□□ 1.12
CHTF18-218ENST00000569270 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CHTF18-218ENST00000569270 AP3B2Q13367 1082 aa22.06■■□□□ 1.12
CHTF18-218ENST00000569270 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa22.06■■□□□ 1.12
CHTF18-218ENST00000569270 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa22.06■■□□□ 1.12
CHTF18-218ENST00000569270 FBXO22Q8NEZ5 403 aa22.06■■□□□ 1.12
CHTF18-218ENST00000569270 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CHTF18-218ENST00000569270 KCNB2Q92953 911 aa22.06■■□□□ 1.12
CHTF18-218ENST00000569270 HLA-CQ95604 372 aa22.06■■□□□ 1.12
CHTF18-218ENST00000569270 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CHTF18-218ENST00000569270 GLT8D2Q9H1C3 349 aa22.06■■□□□ 1.12
CHTF18-218ENST00000569270 LMCD1Q9NZU5 365 aa22.06■■□□□ 1.12
CHTF18-218ENST00000569270 COG5Q9UP83 839 aa22.06■■□□□ 1.12
CHTF18-218ENST00000569270 TRPC6Q9Y210 931 aa22.06■■□□□ 1.12
CHTF18-218ENST00000569270 NFASCO94856 1347 aa22.06■■□□□ 1.12
CHTF18-218ENST00000569270 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa22.05■■□□□ 1.12
CHTF18-218ENST00000569270 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
CHTF18-218ENST00000569270 CLK2P49760 499 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CHTF18-218ENST00000569270 MGAT3Q09327 533 aa22.05■■□□□ 1.12
CHTF18-218ENST00000569270 LPIN1Q14693 890 aa22.05■■□□□ 1.12
CHTF18-218ENST00000569270 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
CHTF18-218ENST00000569270 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
CHTF18-218ENST00000569270 RRN3P2A6NIE6 340 aa22.04■■□□□ 1.12
CHTF18-218ENST00000569270 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CHTF18-218ENST00000569270 MEIS1O00470 390 aa22.04■■□□□ 1.12
CHTF18-218ENST00000569270 SCG2P13521 617 aa22.04■■□□□ 1.12
CHTF18-218ENST00000569270 STAT5BP51692 787 aa22.04■■□□□ 1.12
CHTF18-218ENST00000569270 CDY2AQ9Y6F7 541 aa22.04■■□□□ 1.12
CHTF18-218ENST00000569270 MYH7BA7E2Y1 1941 aa22.04■■□□□ 1.12
CHTF18-218ENST00000569270 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
CHTF18-218ENST00000569270 PLCB4Q15147 1175 aa22.03■■□□□ 1.12
CHTF18-218ENST00000569270 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa22.03■■□□□ 1.12
CHTF18-218ENST00000569270 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
CHTF18-218ENST00000569270 UIMC1Q96RL1 719 aa22.03■■□□□ 1.12
CHTF18-218ENST00000569270 ADAMTS3O15072 1205 aa22.02■■□□□ 1.12
CHTF18-218ENST00000569270 RPS6KB1P23443 525 aa22.02■■□□□ 1.12
CHTF18-218ENST00000569270 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
CHTF18-218ENST00000569270 EPC2Q52LR7 807 aa22.02■■□□□ 1.12
CHTF18-218ENST00000569270 FBXO47Q5MNV8 452 aa22.02■■□□□ 1.12
CHTF18-218ENST00000569270 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa22.02■■□□□ 1.12
CHTF18-218ENST00000569270 PLA2G4DQ86XP0 818 aa22.02■■□□□ 1.12
CHTF18-218ENST00000569270 TTC28Q96AY4 2481 aa22.01■■□□□ 1.11
CHTF18-218ENST00000569270 FAM86B1E9PN63 330 aa22.01■■□□□ 1.11
CHTF18-218ENST00000569270 BACH1O14867 736 aa22.01■■□□□ 1.11
CHTF18-218ENST00000569270 PPFIA3O75145 1194 aa22.01■■□□□ 1.11
CHTF18-218ENST00000569270 CCNE2O96020 404 aa22.01■■□□□ 1.11
CHTF18-218ENST00000569270 FAM86B2P0C5J1 330 aa22.01■■□□□ 1.11
CHTF18-218ENST00000569270 TMEM62Q0P6H9 643 aa22.01■■□□□ 1.11
CHTF18-218ENST00000569270 NIPA1Q7RTP0 329 aa22.01■■□□□ 1.11
CHTF18-218ENST00000569270 PHKBQ93100 1093 aa22.01■■□□□ 1.11
CHTF18-218ENST00000569270 IL17RAQ96F46 866 aa22.01■■□□□ 1.11
CHTF18-218ENST00000569270 SAMD11Q96NU1 681 aa22.01■■□□□ 1.11
CHTF18-218ENST00000569270 C6orf50Q9HD87 102 aa22.01■■□□□ 1.11
CHTF18-218ENST00000569270 POTEB3A0JP26 581 aa22■■□□□ 1.11
CHTF18-218ENST00000569270 REC8O95072 547 aa22■■□□□ 1.11
CHTF18-218ENST00000569270 ATG7O95352 703 aa22■■□□□ 1.11
CHTF18-218ENST00000569270 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
CHTF18-218ENST00000569270 PKN1Q16512 942 aa22■■□□□ 1.11
CHTF18-218ENST00000569270 IER5Q5VY09 327 aa22■■□□□ 1.11
CHTF18-218ENST00000569270 POTEBQ6S5H4 581 aa22■■□□□ 1.11
CHTF18-218ENST00000569270 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa22■■□□□ 1.11
CHTF18-218ENST00000569270 TMEM192Q8IY95 271 aa22■■□□□ 1.11
CHTF18-218ENST00000569270 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
CHTF18-218ENST00000569270 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
CHTF18-218ENST00000569270 ZMYND12Q9H0C1 365 aa22■■□□□ 1.11
CHTF18-218ENST00000569270 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
CHTF18-218ENST00000569270 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa22■■□□□ 1.11
CHTF18-218ENST00000569270 XIRP2A4UGR9 3374 aa21.99■■□□□ 1.11
CHTF18-218ENST00000569270 ESYT2A0FGR8 921 aa21.99■■□□□ 1.11
CHTF18-218ENST00000569270 M0QZ92 97 aa21.99■■□□□ 1.11
CHTF18-218ENST00000569270 ENPP3O14638 875 aa21.99■■□□□ 1.11
CHTF18-218ENST00000569270 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
CHTF18-218ENST00000569270 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
CHTF18-218ENST00000569270 PSMA5P28066 241 aa21.99■■□□□ 1.11
CHTF18-218ENST00000569270 CD52P31358 61 aa21.99■■□□□ 1.11
CHTF18-218ENST00000569270 GPM6BQ13491 265 aa21.99■■□□□ 1.11
CHTF18-218ENST00000569270 TRPV2Q9Y5S1 764 aa21.99■■□□□ 1.11
CHTF18-218ENST00000569270 PTPRSQ13332 1948 aa21.99■■□□□ 1.11
CHTF18-218ENST00000569270 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa21.98■■□□□ 1.11
CHTF18-218ENST00000569270 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
CHTF18-218ENST00000569270 CYP3A4P08684 503 aa21.98■■□□□ 1.11
CHTF18-218ENST00000569270 SLC26A2P50443 739 aa21.98■■□□□ 1.11
CHTF18-218ENST00000569270 PTPROQ16827 1216 aa21.98■■□□□ 1.11
CHTF18-218ENST00000569270 FAM160B1Q5W0V3 765 aa21.98■■□□□ 1.11
CHTF18-218ENST00000569270 MCTP2Q6DN12 878 aa21.98■■□□□ 1.11
CHTF18-218ENST00000569270 ABHD15Q6UXT9 468 aa21.98■■□□□ 1.11
CHTF18-218ENST00000569270 FIBCD1Q8N539 461 aa21.98■■□□□ 1.11
CHTF18-218ENST00000569270 CRYGNQ8WXF5 182 aa21.98■■□□□ 1.11
CHTF18-218ENST00000569270 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
CHTF18-218ENST00000569270 ZNF577Q9BSK1 485 aa21.98■■□□□ 1.11
CHTF18-218ENST00000569270 SLC26A6Q9BXS9 759 aa21.98■■□□□ 1.11
CHTF18-218ENST00000569270 NID2Q14112 1375 aa21.98■■□□□ 1.11
CHTF18-218ENST00000569270 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms