RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568514.5

SNAP23-218, Transcript of synaptosome associated protein 23, humanhuman

TSL 3

Gene SNAP23, Length 1,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23-218ENST00000568514 GSTCDQ8NEC7 633 aa4.97□□□□□ -1.61
SNAP23-218ENST00000568514 NUDT10Q8NFP7 164 aa4.97□□□□□ -1.61
SNAP23-218ENST00000568514 MKL1Q969V6 931 aa4.97□□□□□ -1.61
SNAP23-218ENST00000568514 MBD6Q96DN6 1003 aa4.97□□□□□ -1.61
SNAP23-218ENST00000568514 NUDT11Q96G61 164 aa4.97□□□□□ -1.61
SNAP23-218ENST00000568514 DRC1Q96MC2 740 aa4.97□□□□□ -1.61
SNAP23-218ENST00000568514 PTPN18Q99952 460 aa4.97□□□□□ -1.61
SNAP23-218ENST00000568514 NTMQ9P121 344 aa4.97□□□□□ -1.61
SNAP23-218ENST00000568514 PLEKHD1A6NEE1 506 aa4.96□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 KRIT1O00522 736 aa4.96□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 EPHA5P54756 1037 aa4.96□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 PFKPQ01813 784 aa4.96□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 PAK1Q13153 545 aa4.96□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 CD276Q5ZPR3 534 aa4.96□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 KCTD1Q719H9 257 aa4.96□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 BRAPQ7Z569 592 aa4.96□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 SP8Q8IXZ3 490 aa4.96□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 DTX3Q8N9I9 347 aa4.96□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 TRIM39Q9HCM9 518 aa4.96□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 CATSPERZQ9NTU4 200 aa4.96□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 PTPN22Q9Y2R2 807 aa4.96□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 UACAQ9BZF9 1416 aa4.96□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 CCDC66A2RUB6 948 aa4.95□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 B8ZZF3 427 aa4.95□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa4.95□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 WNT9AO14904 365 aa4.95□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 B4GALT3O60512 393 aa4.95□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 SDSP20132 328 aa4.95□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 MC4RP32245 332 aa4.95□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 GABREP78334 506 aa4.95□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 CHRNA2Q15822 529 aa4.95□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 SKIDA1Q1XH10 827 aa4.95□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 C2orf27AQ580R0 203 aa4.95□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 BTBD8Q5XKL5 378 aa4.95□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 TTLL7Q6ZT98 887 aa4.95□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 LRP10Q7Z4F1 713 aa4.95□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 STPG3Q8N7X2 389 aa4.95□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 TTLL6Q8N841 843 aa4.95□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa4.95□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 FBXW5Q969U6 566 aa4.95□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa4.95□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa4.95□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa4.95□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 SRPK3Q9UPE1 567 aa4.95□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 INVSQ9Y283 1065 aa4.95□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 NCANO14594 1321 aa4.95□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 PRXQ9BXM0 1461 aa4.94□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa4.94□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 RASSF10A6NK89 507 aa4.94□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 AQP7O14520 342 aa4.94□□□□□ -1.62
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SNAP23-218ENST00000568514 SPIRE1Q08AE8 756 aa4.94□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa4.94□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 CYP4F22Q6NT55 531 aa4.94□□□□□ -1.62
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SNAP23-218ENST00000568514 FRMD5Q7Z6J6 570 aa4.94□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 TTLL11Q8NHH1 800 aa4.94□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 ALG1Q9BT22 464 aa4.94□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 BDH2Q9BUT1 245 aa4.94□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 RIC8BQ9NVN3 520 aa4.94□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 HSPBP1Q9NZL4 362 aa4.94□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 ESYT3A0FGR9 886 aa4.93□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 ZNF839A8K0R7 811 aa4.93□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 KLHL18O94889 574 aa4.93□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 KNG1P01042 644 aa4.93□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 ZNF460Q14592 562 aa4.93□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 GPR19Q15760 415 aa4.93□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 LONRF2Q1L5Z9 754 aa4.93□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 TRIM61Q5EBN2 209 aa4.93□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 ERCC6L2Q5T890 1561 aa4.93□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 LRSAM1Q6UWE0 723 aa4.93□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 C16orf59Q7L2K0 433 aa4.93□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 LIMS2Q7Z4I7 341 aa4.93□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 CXorf38Q8TB03 319 aa4.93□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 SH3TC2Q8TF17 1288 aa4.93□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 UBXN4Q92575 508 aa4.93□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 TEPSINQ96N21 525 aa4.93□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP4.93□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 KCND1Q9NSA2 647 aa4.93□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 USP40Q9NVE5 1235 aa4.93□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 ZFP69BQ9UJL9 534 aa4.93□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 FHOD3Q2V2M9 1422 aa4.92□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 MROH6A6NGR9 719 aa4.92□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 SCDO00767 359 aa4.92□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 DVL2O14641 736 aa4.92□□□□□ -1.62
SNAP23-218ENST00000568514 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
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