RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568494.1

ZNRF1-208, Transcript of zinc and ring finger 1, human

TSL 2

Gene ZNRF1, Length 2,046 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNRF1-208	ENST00000568494	USP14	P54578	494 aa		14.7	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	WDR59	Q6PJI9	974 aa		14.7	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	RETREG2	Q8NC44	543 aa		14.7	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	ZBED4	O75132	1171 aa		14.7	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	PTPRA	P18433	802 aa		14.7	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	GHRHR	Q02643	423 aa		14.7	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		14.7	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		14.7	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	WRNIP1	Q96S55	665 aa		14.7	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		14.7	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	ZMYND15	Q9H091	742 aa		14.7	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		14.7	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		14.7	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	KIF20A	O95235	890 aa		14.69	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	MYB	P10242	640 aa		14.69	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	BACE1	P56817	501 aa		14.69	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	ZBED6	P86452	979 aa		14.69	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	EPHA7	Q15375	998 aa		14.69	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		14.69	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	CHADL	Q6NUI6	762 aa		14.69	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		14.69	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	ERO1A	Q96HE7	468 aa		14.69	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	WNK4	Q96J92	1243 aa		14.69	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	CEP63	Q96MT8	703 aa		14.69	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		14.69	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		14.69	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	PICK1	Q9NRD5	415 aa		14.69	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		14.69	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	MEA1	Q16626	185 aa		14.68	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	FIGN	Q5HY92	759 aa		14.68	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		14.68	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		14.68	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	ATG4C	Q96DT6	458 aa		14.68	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	CDCA5	Q96FF9	252 aa		14.68	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		14.68	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	14.68	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		14.68	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494		A0A1W2PQJ5	194 aa		14.68	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	SFI1	A8K8P3	1242 aa		14.68	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	VWA5A	O00534	786 aa		14.68	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	EPHB6	O15197	1021 aa		14.68	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	ABL1	P00519	1130 aa		14.68	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	HOXD13	P35453	343 aa		14.68	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		14.68	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		14.68	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		14.68	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	RIT2	Q99578	217 aa		14.68	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		14.68	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		14.68	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		14.68	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		14.68	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	NDUFA10	O95299	355 aa		14.67	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	BCR	P11274	1271 aa		14.67	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	ARHGAP25	P42331	645 aa		14.67	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	ADAM9	Q13443	819 aa		14.67	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	TKFC	Q3LXA3	575 aa		14.67	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	NACC1	Q96RE7	527 aa		14.67	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		14.67	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	GNA14	O95837	355 aa		14.66	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	MUT	P22033	750 aa		14.66	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	KCNMA1	Q12791	1236 aa		14.66	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	PRKG1	Q13976	671 aa		14.66	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		14.66	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		14.66	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		14.66	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	BANK1	Q8NDB2	785 aa		14.66	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	14.66	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	14.66	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	JADE2	Q9NQC1	790 aa		14.66	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	14.66	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	RIPK3	Q9Y572	518 aa		14.66	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	CETN3	O15182	167 aa		14.66	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
ZNRF1-208	ENST00000568494	TOMM70	O94826	608 aa		14.66	□□□□□ -0.06

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