RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567771.5

SPNS1-209, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS1, Length 829 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-209ENST00000567771 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
SPNS1-209ENST00000567771 SREBF1P36956 1147 aa29.05■■■□□ 2.24
SPNS1-209ENST00000567771 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
SPNS1-209ENST00000567771 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa29.05■■■□□ 2.24
SPNS1-209ENST00000567771 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa29.05■■■□□ 2.24
SPNS1-209ENST00000567771 APBB2Q92870 758 aa29.05■■■□□ 2.24
SPNS1-209ENST00000567771 TOP1MTQ969P6 601 aa29.05■■■□□ 2.24
SPNS1-209ENST00000567771 SDF4Q9BRK5 362 aa29.05■■■□□ 2.24
SPNS1-209ENST00000567771 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
SPNS1-209ENST00000567771 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
SPNS1-209ENST00000567771 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa29.04■■■□□ 2.24
SPNS1-209ENST00000567771 MEIS1O00470 390 aa29.04■■■□□ 2.24
SPNS1-209ENST00000567771 ACTR2P61160 394 aa29.04■■■□□ 2.24
SPNS1-209ENST00000567771 IGBP1P78318 339 aa29.04■■■□□ 2.24
SPNS1-209ENST00000567771 MGAT3Q09327 533 aa29.04■■■□□ 2.24
SPNS1-209ENST00000567771 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa29.04■■■□□ 2.24
SPNS1-209ENST00000567771 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
SPNS1-209ENST00000567771 DNAJB3Q8WWF6 145 aa29.04■■■□□ 2.24
SPNS1-209ENST00000567771 ZBTB10Q96DT7 871 aa29.04■■■□□ 2.24
SPNS1-209ENST00000567771 C17orf80Q9BSJ5 609 aa29.04■■■□□ 2.24
SPNS1-209ENST00000567771 AZI2Q9H6S1 392 aa29.04■■■□□ 2.24
SPNS1-209ENST00000567771 TNFRSF10AO00220 468 aa29.03■■■□□ 2.24
SPNS1-209ENST00000567771 UPP2O95045 317 aa29.03■■■□□ 2.24
SPNS1-209ENST00000567771 GHRP10912 638 aa29.03■■■□□ 2.24
SPNS1-209ENST00000567771 SCG2P13521 617 aa29.03■■■□□ 2.24
SPNS1-209ENST00000567771 INSRRP14616 1297 aa29.03■■■□□ 2.24
SPNS1-209ENST00000567771 LMCD1Q9NZU5 365 aa29.03■■■□□ 2.24
SPNS1-209ENST00000567771 REV3LO60673 3130 aa29.02■■■□□ 2.24
SPNS1-209ENST00000567771 ADAMTS3O15072 1205 aa29.02■■■□□ 2.24
SPNS1-209ENST00000567771 RPS6KB1P23443 525 aa29.02■■■□□ 2.24
SPNS1-209ENST00000567771 ZNF76P36508 570 aa29.02■■■□□ 2.24
SPNS1-209ENST00000567771 PKN1Q16512 942 aa29.02■■■□□ 2.24
SPNS1-209ENST00000567771 RSPH3Q86UC2 560 aa29.02■■■□□ 2.24
SPNS1-209ENST00000567771 IL27Q8NEV9 243 aa29.02■■■□□ 2.24
SPNS1-209ENST00000567771 RRN3P2A6NIE6 340 aa29.01■■■□□ 2.23
SPNS1-209ENST00000567771 BMP1P13497 986 aa29.01■■■□□ 2.23
SPNS1-209ENST00000567771 LPIN1Q14693 890 aa29.01■■■□□ 2.23
SPNS1-209ENST00000567771 PLCB4Q15147 1175 aa29.01■■■□□ 2.23
SPNS1-209ENST00000567771 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa29.01■■■□□ 2.23
SPNS1-209ENST00000567771 FBXL16Q8N461 479 aa29.01■■■□□ 2.23
SPNS1-209ENST00000567771 AGXT2Q9BYV1 514 aa29.01■■■□□ 2.23
SPNS1-209ENST00000567771 TRPC6Q9Y210 931 aa29.01■■■□□ 2.23
SPNS1-209ENST00000567771 NID2Q14112 1375 aa29.01■■■□□ 2.23
SPNS1-209ENST00000567771 FAM86B1E9PN63 330 aa29■■■□□ 2.23
SPNS1-209ENST00000567771 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
SPNS1-209ENST00000567771 ATG7O95352 703 aa29■■■□□ 2.23
SPNS1-209ENST00000567771 FAM86B2P0C5J1 330 aa29■■■□□ 2.23
SPNS1-209ENST00000567771 STAT5BP51692 787 aa29■■■□□ 2.23
SPNS1-209ENST00000567771 KCNQ1P51787 676 aa29■■■□□ 2.23
SPNS1-209ENST00000567771 AAK1Q2M2I8 961 aa29■■■□□ 2.23
SPNS1-209ENST00000567771 CRYGNQ8WXF5 182 aa29■■■□□ 2.23
SPNS1-209ENST00000567771 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
SPNS1-209ENST00000567771 YME1L1Q96TA2 773 aa29■■■□□ 2.23
SPNS1-209ENST00000567771 ZMYND12Q9H0C1 365 aa29■■■□□ 2.23
SPNS1-209ENST00000567771 COG5Q9UP83 839 aa29■■■□□ 2.23
SPNS1-209ENST00000567771 CDY2AQ9Y6F7 541 aa29■■■□□ 2.23
SPNS1-209ENST00000567771 SIP14410 1827 aa28.99■■■□□ 2.23
SPNS1-209ENST00000567771 ESYT2A0FGR8 921 aa28.99■■■□□ 2.23
SPNS1-209ENST00000567771 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
SPNS1-209ENST00000567771 REC8O95072 547 aa28.99■■■□□ 2.23
SPNS1-209ENST00000567771 FBXO47Q5MNV8 452 aa28.99■■■□□ 2.23
SPNS1-209ENST00000567771 NIPA1Q7RTP0 329 aa28.99■■■□□ 2.23
SPNS1-209ENST00000567771 PLA2G4DQ86XP0 818 aa28.99■■■□□ 2.23
SPNS1-209ENST00000567771 FBXO22Q8NEZ5 403 aa28.99■■■□□ 2.23
SPNS1-209ENST00000567771 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa28.99■■■□□ 2.23
SPNS1-209ENST00000567771 PHKBQ93100 1093 aa28.99■■■□□ 2.23
SPNS1-209ENST00000567771 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
SPNS1-209ENST00000567771 PPFIA3O75145 1194 aa28.98■■■□□ 2.23
SPNS1-209ENST00000567771 CCNE2O96020 404 aa28.98■■■□□ 2.23
SPNS1-209ENST00000567771 PSMA5P28066 241 aa28.98■■■□□ 2.23
SPNS1-209ENST00000567771 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
SPNS1-209ENST00000567771 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
SPNS1-209ENST00000567771 C6orf50Q9HD87 102 aa28.98■■■□□ 2.23
SPNS1-209ENST00000567771 CYP3A4P08684 503 aa28.97■■■□□ 2.23
SPNS1-209ENST00000567771 NTRK3Q16288 839 aa28.97■■■□□ 2.23
SPNS1-209ENST00000567771 HLA-CQ95604 372 aa28.97■■■□□ 2.23
SPNS1-209ENST00000567771 UIMC1Q96RL1 719 aa28.97■■■□□ 2.23
SPNS1-209ENST00000567771 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa28.96■■■□□ 2.23
SPNS1-209ENST00000567771 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa28.96■■■□□ 2.23
SPNS1-209ENST00000567771 DHX15O43143 795 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
SPNS1-209ENST00000567771 EPC2Q52LR7 807 aa28.96■■■□□ 2.23
SPNS1-209ENST00000567771 ABHD15Q6UXT9 468 aa28.96■■■□□ 2.23
SPNS1-209ENST00000567771 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
SPNS1-209ENST00000567771 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
SPNS1-209ENST00000567771 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa28.96■■■□□ 2.23
SPNS1-209ENST00000567771 XIRP2A4UGR9 3374 aa28.96■■■□□ 2.23
SPNS1-209ENST00000567771 POTEB3A0JP26 581 aa28.95■■■□□ 2.22
SPNS1-209ENST00000567771 ENPP3O14638 875 aa28.95■■■□□ 2.22
SPNS1-209ENST00000567771 POTEBQ6S5H4 581 aa28.95■■■□□ 2.22
SPNS1-209ENST00000567771 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa28.95■■■□□ 2.22
SPNS1-209ENST00000567771 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
SPNS1-209ENST00000567771 SAMD11Q96NU1 681 aa28.95■■■□□ 2.22
SPNS1-209ENST00000567771 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
SPNS1-209ENST00000567771 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
SPNS1-209ENST00000567771 MUC3AQ02505 3323 aa28.94■■■□□ 2.22
SPNS1-209ENST00000567771 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
SPNS1-209ENST00000567771 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
SPNS1-209ENST00000567771 CCT2P78371 535 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
SPNS1-209ENST00000567771 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
SPNS1-209ENST00000567771 TMEM62Q0P6H9 643 aa28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms