RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564966.5

PPP4C-208, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 2

Gene PPP4C, Length 1,122 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-208	ENST00000564966	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	28.9	■■■□□ 2.22
PPP4C-208	ENST00000564966	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		28.89	■■■□□ 2.22
PPP4C-208	ENST00000564966	GHR	P10912	638 aa		28.89	■■■□□ 2.22
PPP4C-208	ENST00000564966	PSMA5	P28066	241 aa		28.89	■■■□□ 2.22
PPP4C-208	ENST00000564966	ACTR2	P61160	394 aa		28.89	■■■□□ 2.22
PPP4C-208	ENST00000564966	TFF2	Q03403	129 aa		28.89	■■■□□ 2.22
PPP4C-208	ENST00000564966	AAK1	Q2M2I8	961 aa		28.89	■■■□□ 2.22
PPP4C-208	ENST00000564966	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	28.89	■■■□□ 2.22
PPP4C-208	ENST00000564966	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	28.89	■■■□□ 2.22
PPP4C-208	ENST00000564966	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	28.89	■■■□□ 2.22
PPP4C-208	ENST00000564966	C6orf50	Q9HD87	102 aa		28.89	■■■□□ 2.22
PPP4C-208	ENST00000564966	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	28.89	■■■□□ 2.21
PPP4C-208	ENST00000564966	NFASC	O94856	1347 aa		28.89	■■■□□ 2.21
PPP4C-208	ENST00000564966	TRANK1	O15050	2925 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PPP4C-208	ENST00000564966	PPFIA3	O75145	1194 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PPP4C-208	ENST00000564966	CHRNA1	P02708	482 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PPP4C-208	ENST00000564966	NEFL	P07196	543 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PPP4C-208	ENST00000564966	INSRR	P14616	1297 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PPP4C-208	ENST00000564966	RPS6KB1	P23443	525 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PPP4C-208	ENST00000564966	SREBF1	P36956	1147 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PPP4C-208	ENST00000564966	ERVK-21	P61565	698 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PPP4C-208	ENST00000564966	FAM26D	Q5JW98	314 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PPP4C-208	ENST00000564966	KCNB2	Q92953	911 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PPP4C-208	ENST00000564966	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PPP4C-208	ENST00000564966	TNFRSF10A	O00220	468 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PPP4C-208	ENST00000564966	STAT5B	P51692	787 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PPP4C-208	ENST00000564966	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	28.87	■■■□□ 2.21
PPP4C-208	ENST00000564966	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PPP4C-208	ENST00000564966	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PPP4C-208	ENST00000564966	UIMC1	Q96RL1	719 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PPP4C-208	ENST00000564966	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PPP4C-208	ENST00000564966	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PPP4C-208	ENST00000564966	TTC28	Q96AY4	2481 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PPP4C-208	ENST00000564966	BACH1	O14867	736 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PPP4C-208	ENST00000564966	LPXN	O60711	386 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PPP4C-208	ENST00000564966	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PPP4C-208	ENST00000564966	PHKB	Q93100	1093 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PPP4C-208	ENST00000564966	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	28.86	■■■□□ 2.21
PPP4C-208	ENST00000564966	PCYT2	Q99447	389 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PPP4C-208	ENST00000564966		M0QZ92	97 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PPP4C-208	ENST00000564966	MEIS1	O00470	390 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PPP4C-208	ENST00000564966	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
PPP4C-208	ENST00000564966	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PPP4C-208	ENST00000564966	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
PPP4C-208	ENST00000564966	TOP1MT	Q969P6	601 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PPP4C-208	ENST00000564966	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PPP4C-208	ENST00000564966	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PPP4C-208	ENST00000564966	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21
PPP4C-208	ENST00000564966	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
PPP4C-208	ENST00000564966	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21
PPP4C-208	ENST00000564966	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21
PPP4C-208	ENST00000564966	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
PPP4C-208	ENST00000564966	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
PPP4C-208	ENST00000564966	PLCB4	Q15147	1175 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PPP4C-208	ENST00000564966	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PPP4C-208	ENST00000564966	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PPP4C-208	ENST00000564966	COG5	Q9UP83	839 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PPP4C-208	ENST00000564966	POTEB3	A0JP26	581 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PPP4C-208	ENST00000564966	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	28.83	■■■□□ 2.21
PPP4C-208	ENST00000564966	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
PPP4C-208	ENST00000564966	GNA11	P29992	359 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PPP4C-208	ENST00000564966	KCNQ1	P51787	676 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PPP4C-208	ENST00000564966	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PPP4C-208	ENST00000564966	LPIN1	Q14693	890 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PPP4C-208	ENST00000564966	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PPP4C-208	ENST00000564966	POTEB	Q6S5H4	581 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PPP4C-208	ENST00000564966	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PPP4C-208	ENST00000564966	RPAIN	Q86UA6	219 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PPP4C-208	ENST00000564966	HLA-C	Q95604	372 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PPP4C-208	ENST00000564966	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PPP4C-208	ENST00000564966	FAM86B1	E9PN63	330 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PPP4C-208	ENST00000564966	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PPP4C-208	ENST00000564966	MGAT3	Q09327	533 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PPP4C-208	ENST00000564966	IER5	Q5VY09	327 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PPP4C-208	ENST00000564966	MCTP2	Q6DN12	878 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PPP4C-208	ENST00000564966	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PPP4C-208	ENST00000564966	SI	P14410	1827 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PPP4C-208	ENST00000564966	ESYT2	A0FGR8	921 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PPP4C-208	ENST00000564966	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	28.81	■■■□□ 2.2
PPP4C-208	ENST00000564966	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PPP4C-208	ENST00000564966	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PPP4C-208	ENST00000564966	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
PPP4C-208	ENST00000564966	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PPP4C-208	ENST00000564966	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PPP4C-208	ENST00000564966	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	28.81	■■■□□ 2.2
PPP4C-208	ENST00000564966	CCNE2	O96020	404 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PPP4C-208	ENST00000564966	PKN1	Q16512	942 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PPP4C-208	ENST00000564966	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PPP4C-208	ENST00000564966	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PPP4C-208	ENST00000564966	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PPP4C-208	ENST00000564966	BICD2	Q8TD16	824 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PPP4C-208	ENST00000564966	IL17RA	Q96F46	866 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PPP4C-208	ENST00000564966	SAMD11	Q96NU1	681 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PPP4C-208	ENST00000564966	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	28.79	■■■□□ 2.2
PPP4C-208	ENST00000564966	SLC26A2	P50443	739 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PPP4C-208	ENST00000564966	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	28.79	■■■□□ 2.2
PPP4C-208	ENST00000564966	EPC2	Q52LR7	807 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PPP4C-208	ENST00000564966	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	28.79	■■■□□ 2.2
PPP4C-208	ENST00000564966	FIBCD1	Q8N539	461 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PPP4C-208	ENST00000564966	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		28.79	■■■□□ 2.2

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