RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562199.1

CAPN3-211, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 5

Gene CAPN3, Length 385 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-211ENST00000562199 FANCAO15360 1455 aa6.14□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 ATP7AQ04656 1500 aa6.14□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 LMTK2Q8IWU2 1503 aa6.14□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa6.13□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 A0A0A0MRY4 1105 aa6.13□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 TSPY2A6NKD2 308 aa6.13□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF254O75437 659 aa6.13□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 GFPT2O94808 682 aa6.13□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 IL33O95760 270 aa6.13□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
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CAPN3-211ENST00000562199 TSPY8P0CW00 308 aa6.13□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 CENPAP49450 140 aa6.13□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 MAN2A2P49641 1150 aa6.13□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 PEX5P50542 639 aa6.13□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 NEK2P51955 445 aa6.13□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 ARHGAP4P98171 946 aa6.13□□□□□ -1.43
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CAPN3-211ENST00000562199 COG2Q14746 738 aa6.13□□□□□ -1.43
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CAPN3-211ENST00000562199 ELF2Q15723 593 aa6.13□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 RTN1Q16799 776 aa6.13□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 GFOD2Q3B7J2 385 aa6.13□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 CAVIN4Q5BKX8 364 aa6.13□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 NKAPLQ5M9Q1 402 aa6.13□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 FKBP15Q5T1M5 1219 aa6.13□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 FAM102BQ5T8I3 360 aa6.13□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 CCDC30Q5VVM6 783 aa6.13□□□□□ -1.43
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CAPN3-211ENST00000562199 SEPT14Q6ZU15 432 aa6.13□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 ANKMY2Q8IV38 441 aa6.13□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 MAGEB6Q8N7X4 407 aa6.13□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 SPERTQ8NA61 448 aa6.13□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 MSANTD4Q8NCY6 345 aa6.13□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 EPSTI1Q96J88 318 aa6.13□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 PRIMPOLQ96LW4 560 aa6.13□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 SARGQ9BW04 601 aa6.13□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa6.13□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 TNMDQ9H2S6 317 aa6.13□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 TMEM165Q9HC07 324 aa6.13□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 IL20Q9NYY1 176 aa6.13□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 GIMAP2Q9UG22 337 aa6.13□□□□□ -1.43
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CAPN3-211ENST00000562199 TACC3Q9Y6A5 838 aa6.13□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 EVC2Q86UK5 1308 aa6.13□□□□□ -1.43
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CAPN3-211ENST00000562199 ABCA9Q8IUA7 1624 aa6.13□□□□□ -1.43
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CAPN3-211ENST00000562199 USP17L22D6RA61 530 aa6.12□□□□□ -1.43
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CAPN3-211ENST00000562199 USP17L19D6RCP7 530 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 USP17L20D6RJB6 530 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 TGFBR3LH3BV60 316 aa6.12□□□□□ -1.43
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CAPN3-211ENST00000562199 MCF2LO15068 1137 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 KDM1AO60341 852 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 NMT2O60551 498 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 ADAMTS4O75173 837 aa6.12□□□□□ -1.43
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CAPN3-211ENST00000562199 CPB1P15086 417 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 MUTP22033 750 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 SEPHS1P49903 392 aa6.12□□□□□ -1.43
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CAPN3-211ENST00000562199 ICA1Q05084 483 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 USP17L24Q0WX57 530 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 IKQ13123 557 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 SQSTM1Q13501 440 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 DGKZQ13574 1117 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 MVPQ14764 893 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 RCN1Q15293 331 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 PROSER3Q2NL68 480 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 VWA3BQ502W6 1294 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 SPATA1Q5VX52 437 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 SHISA2Q6UWI4 295 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-211ENST00000562199 AFAP1Q8N556 730 aa6.12□□□□□ -1.43
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