RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560983.1

HERC1-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, humanhuman

TSL 2

Gene HERC1, Length 457 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1-211ENST00000560983 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
HERC1-211ENST00000560983 SIN3AQ96ST3 1273 aa5.1□□□□□ -1.59
HERC1-211ENST00000560983 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
HERC1-211ENST00000560983 KLHL3Q9UH77 587 aa5.1□□□□□ -1.59
HERC1-211ENST00000560983 AKAP11Q9UKA4 1901 aa5.1□□□□□ -1.59
HERC1-211ENST00000560983 ZNF652Q9Y2D9 606 aa5.1□□□□□ -1.59
HERC1-211ENST00000560983 RIC1Q4ADV7 1423 aa5.09□□□□□ -1.59
HERC1-211ENST00000560983 TCAF2A6NFQ2 919 aa5.09□□□□□ -1.59
HERC1-211ENST00000560983 SLC22A31A6NKX4 558 aa5.09□□□□□ -1.59
HERC1-211ENST00000560983 SEMA7AO75326 666 aa5.09□□□□□ -1.59
HERC1-211ENST00000560983 BBOX1O75936 387 aa5.09□□□□□ -1.59
HERC1-211ENST00000560983 LINC00310P59036 64 aa5.09□□□□□ -1.59
HERC1-211ENST00000560983 FAM160A1Q05DH4 1040 aa5.09□□□□□ -1.59
HERC1-211ENST00000560983 DUSP4Q13115 394 aa5.09□□□□□ -1.59
HERC1-211ENST00000560983 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
HERC1-211ENST00000560983 SNAP47Q5SQN1 464 aa5.09□□□□□ -1.59
HERC1-211ENST00000560983 SUSD4Q5VX71 490 aa5.09□□□□□ -1.59
HERC1-211ENST00000560983 RNF111Q6ZNA4 994 aa5.09□□□□□ -1.59
HERC1-211ENST00000560983 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
HERC1-211ENST00000560983 SPPL2CQ8IUH8 684 aa5.09□□□□□ -1.59
HERC1-211ENST00000560983 TTC5Q8N0Z6 440 aa5.09□□□□□ -1.59
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HERC1-211ENST00000560983 DBNDD1Q9H9R9 158 aa5.09□□□□□ -1.59
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HERC1-211ENST00000560983 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa5.08□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 GJB1P08034 283 aa5.08□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 IL13P35225 146 aa5.08□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 TCIRG1Q13488 830 aa5.08□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 SLC10A5Q5PT55 438 aa5.08□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 CDCP2Q5VXM1 449 aa5.08□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 FBXL19Q6PCT2 694 aa5.08□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 NLRX1Q86UT6 975 aa5.08□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 TDHQ8IZJ6 230 aa5.08□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 DAGLBQ8NCG7 672 aa5.08□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 IL17REQ8NFR9 667 aa5.08□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 KCNN1Q92952 543 aa5.08□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 GMLQ99445 158 aa5.08□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.08□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa5.08□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 NYXQ9GZU5 481 aa5.08□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 EHMT1Q9H9B1 1298 aa5.08□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 KBTBD4Q9NVX7 518 aa5.08□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 VTI1BQ9UEU0 232 aa5.08□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 FZD1Q9UP38 647 aa5.08□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 ABCC4O15439 1325 aa5.07□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 UBN2Q6ZU65 1347 aa5.07□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa5.07□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 HRKO00198 91 aa5.07□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 PSPNO60542 156 aa5.07□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 TNNI2P48788 182 aa5.07□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 RNF4P78317 190 aa5.07□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 DLG4P78352 724 aa5.07□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 PRKG1Q13976 671 aa5.07□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 NBPF9Q3BBW0 867 aa5.07□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 PHACTR4Q8IZ21 702 aa5.07□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 WNK4Q96J92 1243 aa5.07□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
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HERC1-211ENST00000560983 CNNM2Q9H8M5 875 aa5.07□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 COPRSQ9NQ92 184 aa5.07□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 GMIPQ9P107 970 aa5.07□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 POLLQ9UGP5 575 aa5.07□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 XIRP2A4UGR9 3374 aa5.07□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 SCN7AQ01118 1682 aa5.07□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 IRS2Q9Y4H2 1338 aa5.06□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 TMEM82A0PJX8 343 aa5.06□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 MINDY4BA8MYZ0 360 aa5.06□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 ERVV-1B6SEH8 477 aa5.06□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 NRDCO43847 1150 aa5.06□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 ECE2O60344 883 aa5.06□□□□□ -1.6
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HERC1-211ENST00000560983 CCL5P13501 91 aa5.06□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 CTGFP29279 349 aa5.06□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 ARHGEF6Q15052 776 aa5.06□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 ARSHQ5FYA8 562 aa5.06□□□□□ -1.6
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HERC1-211ENST00000560983 ARMC9Q7Z3E5 817 aa5.06□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 ZNF34Q8IZ26 560 aa5.06□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 CLMNQ96JQ2 1002 aa5.06□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 BRMS1Q9HCU9 246 aa5.06□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 MYOZ2Q9NPC6 264 aa5.06□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa5.06□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 ZFHX4Q86UP3 3567 aa5.06□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 MEIS3P2A8K0S8 358 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 GPTP24298 496 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 GBP1P32455 592 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC1-211ENST00000560983 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
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