RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559357.5

USP3-AS1-202, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 455 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-202ENST00000559357 CAP1Q01518 475 aa6.91□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 CYP2R1Q6VVX0 501 aa6.91□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 NAT16Q8N8M0 369 aa6.91□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 TMEM87AQ8NBN3 555 aa6.91□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 CCDC136Q96JN2 1154 aa6.91□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 TM9SF2Q99805 663 aa6.91□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 FHOD1Q9Y613 1164 aa6.91□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa6.91□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 KIF16BQ96L93 1317 aa6.91□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa6.91□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 DISP2A7MBM2 1401 aa6.91□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 SRGAP3O43295 1099 aa6.9□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 DBHP09172 617 aa6.9□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 TRIM27P14373 513 aa6.9□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 KRTAP10-2P60368 255 aa6.9□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 SLC39A6Q13433 755 aa6.9□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa6.9□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 ITPRIPQ8IWB1 547 aa6.9□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 BCL11AQ9H165 835 aa6.9□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 SLC52A2Q9HAB3 445 aa6.9□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 BABAM1Q9NWV8 329 aa6.9□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa6.9□□□□□ -1.3
USP3-AS1-202ENST00000559357 TNS2Q63HR2 1409 aa6.9□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 UBR2Q8IWV8 1755 aa6.9□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 CACNA1FO60840 1977 aa6.89□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 FFAR3O14843 346 aa6.89□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 CYBBP04839 570 aa6.89□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 CD247P20963 164 aa6.89□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF76P36508 570 aa6.89□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 PAQR3Q6TCH7 311 aa6.89□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 JAMLQ86YT9 394 aa6.89□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 UNC5CLQ8IV45 518 aa6.89□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa6.89□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 TTC5Q8N0Z6 440 aa6.89□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 BRF1Q92994 677 aa6.89□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF428Q96B54 188 aa6.89□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 FERD3LQ96RJ6 166 aa6.89□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 STK31Q9BXU1 1019 aa6.89□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa6.89□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa6.89□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa6.89□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 KAT6BQ8WYB5 2073 aa6.88□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 GLI3P10071 1580 aa6.88□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 BCL9LQ86UU0 1499 aa6.88□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 A0A1W2PQ27 194 aa6.88□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 A0A1W2PQ64 194 aa6.88□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 A0A1W2PQC6 194 aa6.88□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 A0A1W2PQD8 194 aa6.88□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa6.88□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 EXOC5O00471 708 aa6.88□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 LIMS1P48059 325 aa6.88□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 CORO7P57737 925 aa6.88□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 FANCCQ00597 558 aa6.88□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 MVPQ14764 893 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 CCDC30Q5VVM6 783 aa6.88□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 UNC5AQ6ZN44 842 aa6.88□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 USP48Q86UV5 1035 aa6.88□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 FIBCD1Q8N539 461 aa6.88□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 TMEM57Q8N5G2 664 aa6.88□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 TEPSINQ96N21 525 aa6.88□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 PDLIM7Q9NR12 457 aa6.88□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.88□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa6.88□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 AFF2P51816 1311 aa6.87□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 ANXA1P04083 346 aa6.87□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 TP53P04637 393 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 PFKLP17858 780 aa6.87□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 GUCY2CP25092 1073 aa6.87□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 NOP2P46087 812 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 DDB1Q16531 1140 aa6.87□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF394Q53GI3 561 aa6.87□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF790Q6PG37 636 aa6.87□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 RUFY4Q6ZNE9 571 aa6.87□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 G2E3Q7L622 706 aa6.87□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 PTCHD1Q96NR3 888 aa6.87□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 ADAM7Q9H2U9 754 aa6.87□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 TMOD3Q9NYL9 352 aa6.87□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 PPT2Q9UMR5 302 aa6.87□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 KCPQ6ZWJ8 1503 aa6.86□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 RGS12O14924 1447 aa6.86□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 ERVV-2B6SEH9 535 aa6.86□□□□□ -1.31
USP3-AS1-202ENST00000559357 CBFA2T2O43439 604 aa6.86□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms