RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545204.1

MDM2-233, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 5 BASIC

Gene MDM2, Length 398 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-233	ENST00000545204	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	SDS	P20132	328 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	IL13	P35225	146 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	HERVK_113	P62684	666 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	TCEA2	Q15560	299 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	TKFC	Q3LXA3	575 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	RGL3	Q3MIN7	710 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	TM4SF20	Q53R12	229 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	PHF19	Q5T6S3	580 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	CPZ	Q66K79	652 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	MCTP2	Q6DN12	878 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	APPBP2	Q92624	585 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	KCND1	Q9NSA2	647 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	SLC12A8	A0AV02	714 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	PRAMEF25	A6NGN4	478 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	C9orf118	A6NHY6	69 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204		M0R2C6	588 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	OPA1	O60313	960 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	CDC45	O75419	566 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	IL18BP	O95998	194 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	KNG1	P01042	644 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	CHGB	P05060	677 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	AOAH	P28039	575 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	GLRB	P48167	497 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	CTSW	P56202	376 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	TEPSIN	Q96N21	525 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	USP40	Q9NVE5	1235 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	BTBD7	Q9P203	1132 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	ADAMTS20	P59510	1910 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	MROH6	A6NGR9	719 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	SCD	O00767	359 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	KLHL18	O94889	574 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	FBXO21	O94952	628 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	IRF9	Q00978	393 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	NFIX	Q14938	502 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	LILRA6	Q6PI73	481 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	STPG3	Q8N7X2	389 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	CHST14	Q8NCH0	376 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	DLG3	Q92796	817 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	MBD6	Q96DN6	1003 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	LCOR	Q96JN0	433 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	FEZ1	Q99689	392 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	BOC	Q9BWV1	1114 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	TBX22	Q9Y458	520 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	TRAF5	O00463	557 aa		4.47	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	ENPP3	O14638	875 aa		4.47	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	4.47	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	HIP1R	O75146	1068 aa		4.47	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	MPIG6B	O95866	241 aa		4.47	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	4.47	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	MME	P08473	750 aa		4.47	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	JMJD7	P0C870	316 aa		4.47	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	4.47	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	PTGS1	P23219	599 aa		4.47	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	MC4R	P32245	332 aa		4.47	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	FLT3	P36888	993 aa		4.47	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		4.47	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		4.47	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		4.47	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		4.47	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		4.47	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	4.47	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	FAM124A	Q86V42	546 aa		4.47	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		4.47	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	ASB15	Q8WXK1	588 aa		4.47	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	NINJ1	Q92982	152 aa		4.47	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	NUDT11	Q96G61	164 aa		4.47	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.47	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	INCENP	Q9NQS7	918 aa		4.47	□□□□□ -1.69
MDM2-233	ENST00000545204	FAM83G	A6ND36	823 aa		4.46	□□□□□ -1.7
MDM2-233	ENST00000545204	RASSF10	A6NK89	507 aa		4.46	□□□□□ -1.7

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