RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534198.1

RBM4B-208, Transcript of RNA binding motif protein 4B, human

TSL 3

Gene RBM4B, Length 431 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM4B-208	ENST00000534198	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	POF1B	Q8WVV4	589 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	SUSD6	Q92537	303 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	TMX1	Q9H3N1	280 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	PIK3CD	O00329	1044 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	ST18	O60284	1047 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	CSPG5	O95196	566 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	ITGB5	P18084	799 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	CD52	P31358	61 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	GATM	P50440	423 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	GRIK4	Q16099	956 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	PKN1	Q16512	942 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	FBXL6	Q8N531	539 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	S1PR5	Q9H228	398 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RBM4B-208	ENST00000534198	PER2	O15055	1255 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	IGHD	P01880	384 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	AVPR2	P30518	371 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	NRIP1	P48552	1158 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	NDUFV1	P49821	464 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	SP4	Q02446	784 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	TRAF1	Q13077	416 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	PPFIA1	Q13136	1202 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	PADI3	Q9ULW8	664 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	FSCN2	O14926	492 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	MGEA5	O60502	916 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	CYP21A2	P08686	494 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	INSRR	P14616	1297 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	MARK3	P27448	753 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	ERVFC1	P60507	584 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	NUCB1	Q02818	461 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	PRRX2	Q99811	253 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	PPFIA3	O75145	1194 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	SMARCA1	P28370	1054 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	ANTXR2	P58335	489 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	FAM189B	P81408	668 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	PTH1R	Q03431	593 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	DUSP6	Q16828	381 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	RSPH3	Q86UC2	560 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	NLRX1	Q86UT6	975 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	GPRASP2	Q96D09	838 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	TLE6	Q9H808	572 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	HCST	Q9UBK5	93 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	TTC3	P53804	2025 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	CFAP54	Q96N23	3096 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	PROB1	E7EW31	1015 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	GFRA3	O60609	400 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	SCG2	P13521	617 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	IGBP1	P78318	339 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	PLCB4	Q15147	1175 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	IER5	Q5VY09	327 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM4B-208	ENST00000534198	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81

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