RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533897.1

CTSC-208, Transcript of cathepsin C, human

TSL 2

Gene CTSC, Length 4,344 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTSC-208	ENST00000533897	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	PPFIA2	O75334	1257 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	PPP1R37	O75864	691 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	AKR1B1	P15121	316 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	HSD17B3	P37058	310 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	LRRC41	Q15345	812 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	VPS72	Q15906	364 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	CCDC96	Q2M329	555 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	WHAMM	Q8TF30	809 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	SLC35C1	Q96A29	364 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	COA7	Q96BR5	231 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	ATP6V1G3	Q96LB4	118 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	NLRP3	Q96P20	1036 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	NOX5	Q96PH1	765 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	NFU1	Q9UMS0	254 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897		A6NNZ2	444 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	VGLL3	A8MV65	326 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	TRAPPC3	O43617	180 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	KIF4A	O95239	1232 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	GNA14	O95837	355 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	TXK	P42681	527 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	MAGEA1	P43355	309 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF131	P52739	623 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	PLCB4	Q15147	1175 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	ZBTB9	Q96C00	473 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	CEP89	Q96ST8	783 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	JADE2	Q9NQC1	790 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	JAG2	Q9Y219	1238 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897		F8W031	263 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	PLSCR1	O15162	318 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	TRIM37	O94972	964 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	UCHL3	P15374	230 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	CCT5	P48643	541 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	ADCY7	P51828	1080 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	PSMC6	P62333	389 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	KLRC3	Q07444	240 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	CCDC142	Q17RM4	750 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	CD101	Q93033	1021 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	PANK4	Q9NVE7	773 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	NR2E1	Q9Y466	385 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	ANK1	P16157	1881 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	WDR90	Q96KV7	1748 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	TBX3	O15119	743 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	BUB1	O43683	1085 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	AKAP3	O75969	853 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	CYP3A4	P08684	503 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	PTGIR	P43119	386 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	GNGT1	P63211	74 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	QPCT	Q16769	361 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	WLS	Q5T9L3	541 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	DYM	Q7RTS9	669 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	METTL13	Q8N6R0	699 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	CALML4	Q96GE6	196 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	COL4A5	P29400	1685 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		4.85	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms