RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533872.5

RPS2-215, Transcript of ribosomal protein S2, human

TSL 5

Gene RPS2, Length 1,114 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS2-215	ENST00000533872	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	27.64	■■■□□ 2.02
RPS2-215	ENST00000533872	PTGDR	Q13258	359 aa		27.64	■■■□□ 2.02
RPS2-215	ENST00000533872	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		27.64	■■■□□ 2.02
RPS2-215	ENST00000533872	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		27.64	■■■□□ 2.02
RPS2-215	ENST00000533872	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	27.64	■■■□□ 2.02
RPS2-215	ENST00000533872	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		27.63	■■■□□ 2.01
RPS2-215	ENST00000533872	PKP1	Q13835	747 aa		27.63	■■■□□ 2.01
RPS2-215	ENST00000533872	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		27.63	■■■□□ 2.01
RPS2-215	ENST00000533872	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		27.63	■■■□□ 2.01
RPS2-215	ENST00000533872	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		27.63	■■■□□ 2.01
RPS2-215	ENST00000533872	EML1	O00423	815 aa		27.62	■■■□□ 2.01
RPS2-215	ENST00000533872	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	27.62	■■■□□ 2.01
RPS2-215	ENST00000533872	CD4	P01730	458 aa		27.62	■■■□□ 2.01
RPS2-215	ENST00000533872	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		27.62	■■■□□ 2.01
RPS2-215	ENST00000533872	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		27.62	■■■□□ 2.01
RPS2-215	ENST00000533872	MARK3	P27448	753 aa		27.62	■■■□□ 2.01
RPS2-215	ENST00000533872	HOXC8	P31273	242 aa		27.62	■■■□□ 2.01
RPS2-215	ENST00000533872	PRPH	P41219	470 aa		27.62	■■■□□ 2.01
RPS2-215	ENST00000533872	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	27.62	■■■□□ 2.01
RPS2-215	ENST00000533872	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		27.62	■■■□□ 2.01
RPS2-215	ENST00000533872	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		27.62	■■■□□ 2.01
RPS2-215	ENST00000533872	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		27.62	■■■□□ 2.01
RPS2-215	ENST00000533872	B4GALT4	O60513	344 aa		27.61	■■■□□ 2.01
RPS2-215	ENST00000533872	BMP15	O95972	392 aa		27.61	■■■□□ 2.01
RPS2-215	ENST00000533872	F13A1	P00488	732 aa		27.61	■■■□□ 2.01
RPS2-215	ENST00000533872	FAAP100	Q0VG06	881 aa		27.61	■■■□□ 2.01
RPS2-215	ENST00000533872	PLCB4	Q15147	1175 aa		27.61	■■■□□ 2.01
RPS2-215	ENST00000533872	EPHA7	Q15375	998 aa		27.61	■■■□□ 2.01
RPS2-215	ENST00000533872	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		27.61	■■■□□ 2.01
RPS2-215	ENST00000533872	CLTB	P09497	229 aa		27.6	■■■□□ 2.01
RPS2-215	ENST00000533872	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		27.6	■■■□□ 2.01
RPS2-215	ENST00000533872	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		27.6	■■■□□ 2.01
RPS2-215	ENST00000533872	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	27.6	■■■□□ 2.01
RPS2-215	ENST00000533872	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		27.6	■■■□□ 2.01
RPS2-215	ENST00000533872	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		27.6	■■■□□ 2.01
RPS2-215	ENST00000533872	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	27.6	■■■□□ 2.01
RPS2-215	ENST00000533872	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		27.6	■■■□□ 2.01
RPS2-215	ENST00000533872	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		27.6	■■■□□ 2.01
RPS2-215	ENST00000533872	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	27.6	■■■□□ 2.01
RPS2-215	ENST00000533872	KAT6A	Q92794	2004 aa		27.59	■■■□□ 2.01
RPS2-215	ENST00000533872	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	27.59	■■■□□ 2.01
RPS2-215	ENST00000533872	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		27.59	■■■□□ 2.01
RPS2-215	ENST00000533872	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	27.59	■■■□□ 2.01
RPS2-215	ENST00000533872	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		27.59	■■■□□ 2.01
RPS2-215	ENST00000533872	TRPC6	Q9Y210	931 aa		27.59	■■■□□ 2.01
RPS2-215	ENST00000533872	NRCAM	Q92823	1304 aa		27.59	■■■□□ 2.01
RPS2-215	ENST00000533872	POTEB3	A0JP26	581 aa		27.58	■■■□□ 2.01
RPS2-215	ENST00000533872	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		27.58	■■■□□ 2.01
RPS2-215	ENST00000533872	POTEM	A6NI47	508 aa		27.58	■■■□□ 2.01
RPS2-215	ENST00000533872	BRD1	O95696	1058 aa		27.58	■■■□□ 2.01
RPS2-215	ENST00000533872	ATP4A	P20648	1035 aa		27.58	■■■□□ 2.01
RPS2-215	ENST00000533872	TEC	P42680	631 aa		27.58	■■■□□ 2.01
RPS2-215	ENST00000533872	PPFIA1	Q13136	1202 aa		27.58	■■■□□ 2.01
RPS2-215	ENST00000533872	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
RPS2-215	ENST00000533872	PTGIS	Q16647	500 aa		27.58	■■■□□ 2.01
RPS2-215	ENST00000533872	UGCG	Q16739	394 aa		27.58	■■■□□ 2.01
RPS2-215	ENST00000533872	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
RPS2-215	ENST00000533872	POTEB	Q6S5H4	581 aa		27.58	■■■□□ 2.01
RPS2-215	ENST00000533872	FAM167A	Q96KS9	214 aa		27.58	■■■□□ 2.01
RPS2-215	ENST00000533872	ZNF862	O60290	1169 aa		27.57	■■■□□ 2
RPS2-215	ENST00000533872	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
RPS2-215	ENST00000533872	GNAT1	P11488	350 aa		27.57	■■■□□ 2
RPS2-215	ENST00000533872	PSMC5	P62195	406 aa		27.57	■■■□□ 2
RPS2-215	ENST00000533872	HIC1	Q14526	733 aa		27.57	■■■□□ 2
RPS2-215	ENST00000533872	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
RPS2-215	ENST00000533872	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		27.57	■■■□□ 2
RPS2-215	ENST00000533872	BANK1	Q8NDB2	785 aa		27.57	■■■□□ 2
RPS2-215	ENST00000533872	NEK9	Q8TD19	979 aa		27.57	■■■□□ 2
RPS2-215	ENST00000533872	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		27.57	■■■□□ 2
RPS2-215	ENST00000533872	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
RPS2-215	ENST00000533872	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
RPS2-215	ENST00000533872	SETD4	Q9NVD3	440 aa		27.57	■■■□□ 2
RPS2-215	ENST00000533872	TBX21	Q9UL17	535 aa		27.57	■■■□□ 2
RPS2-215	ENST00000533872	HBP1	O60381	514 aa		27.56	■■■□□ 2
RPS2-215	ENST00000533872	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	27.56	■■■□□ 2	not detected	■■■□□ 17.7
RPS2-215	ENST00000533872	OAT	P04181	439 aa		27.56	■■■□□ 2
RPS2-215	ENST00000533872	INSRR	P14616	1297 aa		27.56	■■■□□ 2
RPS2-215	ENST00000533872	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
RPS2-215	ENST00000533872	ADAM17	P78536	824 aa		27.56	■■■□□ 2
RPS2-215	ENST00000533872	PRKCE	Q02156	737 aa		27.56	■■■□□ 2
RPS2-215	ENST00000533872	GRIK4	Q16099	956 aa		27.56	■■■□□ 2
RPS2-215	ENST00000533872	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		27.56	■■■□□ 2
RPS2-215	ENST00000533872	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		27.56	■■■□□ 2
RPS2-215	ENST00000533872	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		27.56	■■■□□ 2
RPS2-215	ENST00000533872	RAB34	Q9BZG1	259 aa		27.56	■■■□□ 2
RPS2-215	ENST00000533872	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		27.56	■■■□□ 2
RPS2-215	ENST00000533872	NOD1	Q9Y239	953 aa		27.56	■■■□□ 2
RPS2-215	ENST00000533872	CLIC4	Q9Y696	253 aa		27.56	■■■□□ 2
RPS2-215	ENST00000533872	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
RPS2-215	ENST00000533872	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		27.55	■■■□□ 2
RPS2-215	ENST00000533872	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		27.55	■■■□□ 2
RPS2-215	ENST00000533872	KIAA0355	O15063	1070 aa		27.55	■■■□□ 2
RPS2-215	ENST00000533872	DDIT3	P35638	169 aa		27.55	■■■□□ 2
RPS2-215	ENST00000533872	PDIA5	Q14554	519 aa		27.55	■■■□□ 2
RPS2-215	ENST00000533872	USP28	Q96RU2	1077 aa		27.55	■■■□□ 2
RPS2-215	ENST00000533872	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		27.55	■■■□□ 2
RPS2-215	ENST00000533872	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
RPS2-215	ENST00000533872	LXN	Q9BS40	222 aa		27.55	■■■□□ 2
RPS2-215	ENST00000533872	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	27.55	■■■□□ 2
RPS2-215	ENST00000533872	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2

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