RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520940.1

EXTL3-208, Transcript of exostosin like glycosyltransferase 3, human

TSL 4

Gene EXTL3, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EXTL3-208	ENST00000520940	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	AMH	P03971	560 aa		11.99	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	AR	P10275	920 aa		11.99	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	PSMA5	P28066	241 aa		11.99	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	ACTR2	P61160	394 aa		11.99	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	FAM26D	Q5JW98	314 aa		11.99	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		11.99	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		11.99	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		11.99	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	PCYT2	Q99447	389 aa		11.99	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	AZI2	Q9H6S1	392 aa		11.99	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	LINC01553	A4QN01	128 aa		11.98	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	MEIS1	O00470	390 aa		11.98	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	NEFL	P07196	543 aa		11.98	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	MGAT3	Q09327	533 aa		11.98	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	GRB10	Q13322	594 aa		11.98	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	PKN1	Q16512	942 aa		11.98	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	KRT40	Q6A162	431 aa		11.98	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		11.98	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	RPAIN	Q86UA6	219 aa		11.98	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	RSPH3	Q86UC2	560 aa		11.98	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	APBB2	Q92870	758 aa		11.98	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	PHKB	Q93100	1093 aa		11.98	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		11.98	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		11.98	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	MYO7A	Q13402	2215 aa		11.98	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		11.97	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	FAM86B1	E9PN63	330 aa		11.97	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	ADAMTS3	O15072	1205 aa		11.97	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	LPXN	O60711	386 aa		11.97	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	CHRNA1	P02708	482 aa		11.97	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		11.97	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	GHR	P10912	638 aa		11.97	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	ZNF76	P36508	570 aa		11.97	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	ERVK-21	P61565	698 aa		11.97	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	IGBP1	P78318	339 aa		11.97	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	NTRK3	Q16288	839 aa		11.97	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		11.97	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		11.97	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	ASB2	Q96Q27	587 aa		11.97	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	TRPC6	Q9Y210	931 aa		11.97	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	INSL6	Q9Y581	213 aa		11.97	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		11.96	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		11.96	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	CCNE2	O96020	404 aa		11.96	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	CYP3A4	P08684	503 aa		11.96	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	INSRR	P14616	1297 aa		11.96	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	IFNAR1	P17181	557 aa		11.96	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	STAT5B	P51692	787 aa		11.96	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	EVC	P57679	992 aa		11.96	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	LPIN1	Q14693	890 aa		11.96	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	PLCB4	Q15147	1175 aa		11.96	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	RUFY3	Q7L099	469 aa		11.96	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		11.96	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		11.96	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		11.96	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		11.96	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		11.96	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		11.96	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	C6orf50	Q9HD87	102 aa		11.96	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		11.96	□□□□□ -0.49
EXTL3-208	ENST00000520940	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		11.95	□□□□□ -0.5
EXTL3-208	ENST00000520940	POTEB3	A0JP26	581 aa		11.95	□□□□□ -0.5
EXTL3-208	ENST00000520940	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
EXTL3-208	ENST00000520940	PPFIA3	O75145	1194 aa		11.95	□□□□□ -0.5
EXTL3-208	ENST00000520940	ATG7	O95352	703 aa		11.95	□□□□□ -0.5
EXTL3-208	ENST00000520940	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
EXTL3-208	ENST00000520940	GNA11	P29992	359 aa		11.95	□□□□□ -0.5
EXTL3-208	ENST00000520940	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
EXTL3-208	ENST00000520940	SLC26A2	P50443	739 aa		11.95	□□□□□ -0.5
EXTL3-208	ENST00000520940	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
EXTL3-208	ENST00000520940	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
EXTL3-208	ENST00000520940	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		11.95	□□□□□ -0.5
EXTL3-208	ENST00000520940	MCTP2	Q6DN12	878 aa		11.95	□□□□□ -0.5
EXTL3-208	ENST00000520940	POTEB	Q6S5H4	581 aa		11.95	□□□□□ -0.5
EXTL3-208	ENST00000520940	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		11.95	□□□□□ -0.5
EXTL3-208	ENST00000520940	BICD2	Q8TD16	824 aa		11.95	□□□□□ -0.5
EXTL3-208	ENST00000520940	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		11.95	□□□□□ -0.5

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