RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 MTFR1LQ9H019 292 aa8.62□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 DEFB129Q9H1M3 183 aa8.62□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 RGL1Q9NZL6 768 aa8.62□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 MCM8Q9UJA3 840 aa8.62□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 ZBED4O75132 1171 aa8.62□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 CAP2P40123 477 aa8.62□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 LMAN1P49257 510 aa8.62□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 DNM2P50570 870 aa8.62□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 ETF1P62495 437 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 GRB10Q13322 594 aa8.62□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 SPDYE2Q495Y8 402 aa8.62□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF569Q5MCW4 686 aa8.62□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 ANKRD40Q6AI12 368 aa8.62□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 TATDN1Q6P1N9 297 aa8.62□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 LRRC31Q6UY01 552 aa8.62□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 UNC13DQ70J99 1090 aa8.62□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 MYCT1Q8N699 235 aa8.62□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 C7orf43Q8WVR3 580 aa8.62□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 NLRC4Q9NPP4 1024 aa8.62□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 FZD1Q9UP38 647 aa8.62□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa8.62□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 ZHX2Q9Y6X8 837 aa8.62□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 UBR3Q6ZT12 1888 aa8.62□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 RREB1Q92766 1687 aa8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 TIAM2Q8IVF5 1701 aa8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 RHOBTB3O94955 611 aa8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 DNA2P51530 1060 aa8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 MTMR2Q13614 643 aa8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 MTF1Q14872 753 aa8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 PPP4R3AQ6IN85 833 aa8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 FAM160B2Q86V87 743 aa8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 OR8K1Q8NGG5 319 aa8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 GMCL1Q96IK5 515 aa8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC42Q96M95 316 aa8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 AGBL1Q96MI9 1066 aa8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP8.61□□□□□ -1.03
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TRPS1-208ENST00000519076 MYH1P12882 1939 aa8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 SBF2Q86WG5 1849 aa8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 A0A1B0GTH6 734 aa8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 ARHGEF35A5YM69 484 aa8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 CETN3O15182 167 aa8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 SLU7O95391 586 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF18P17022 549 aa8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 INPP5BP32019 993 aa8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 GCKP35557 465 aa8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 PMS1P54277 932 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 TGFB2P61812 414 aa8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 KCNB1Q14721 858 aa8.61□□□□□ -1.03
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TRPS1-208ENST00000519076 ARMC3Q5W041 872 aa8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 CAGE1Q8TC20 777 aa8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 BICD1Q96G01 975 aa8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 TMOD4Q9NZQ9 345 aa8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 LMCD1Q9NZU5 365 aa8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 ABCB11O95342 1321 aa8.61□□□□□ -1.03
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TRPS1-208ENST00000519076 RTN2O75298 545 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 JAG1P78504 1218 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 ELF2Q15723 593 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 DBN1Q16643 649 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
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TRPS1-208ENST00000519076 TMTC1Q8IUR5 882 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 TRIM42Q8IWZ5 723 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 SPAG5Q96R06 1193 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 HACL1Q9UJ83 578 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 BRWD3Q6RI45 1802 aa8.6□□□□□ -1.03
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TRPS1-208ENST00000519076 M0R2N6 131 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 ERLIN2O94905 339 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 TRIM14Q14142 442 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 HS2ST1Q7LGA3 356 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 KCNK18Q7Z418 384 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 REXO1L1PQ8IX06 675 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 RDH13Q8NBN7 331 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 SPATA20Q8TB22 786 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 TCP11Q8WWU5 503 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
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