RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518885.1

CNOT7-204, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 7, human

TSL 3

Gene CNOT7, Length 477 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT7-204	ENST00000518885	GUCD1	Q96NT3	240 aa		27.42	■■□□□ 1.98
CNOT7-204	ENST00000518885	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	27.42	■■□□□ 1.98
CNOT7-204	ENST00000518885	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	27.41	■■□□□ 1.98
CNOT7-204	ENST00000518885	NBN	O60934	754 aa		27.41	■■□□□ 1.98
CNOT7-204	ENST00000518885	ADAM17	P78536	824 aa		27.41	■■□□□ 1.98
CNOT7-204	ENST00000518885	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		27.41	■■□□□ 1.98
CNOT7-204	ENST00000518885	RPAIN	Q86UA6	219 aa		27.41	■■□□□ 1.98
CNOT7-204	ENST00000518885	WNT8B	Q93098	351 aa		27.41	■■□□□ 1.98
CNOT7-204	ENST00000518885	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	27.41	■■□□□ 1.98
CNOT7-204	ENST00000518885	SCN5A	Q14524	2016 aa		27.4	■■□□□ 1.98
CNOT7-204	ENST00000518885	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	27.4	■■□□□ 1.98
CNOT7-204	ENST00000518885	TBCK	Q8TEA7	893 aa		27.4	■■□□□ 1.98
CNOT7-204	ENST00000518885	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		27.4	■■□□□ 1.98
CNOT7-204	ENST00000518885	PSAP	P07602	524 aa		27.39	■■□□□ 1.98
CNOT7-204	ENST00000518885	PBX2	P40425	430 aa		27.39	■■□□□ 1.98
CNOT7-204	ENST00000518885	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		27.39	■■□□□ 1.98
CNOT7-204	ENST00000518885	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		27.39	■■□□□ 1.98
CNOT7-204	ENST00000518885	SEPT8	Q92599	483 aa		27.39	■■□□□ 1.98
CNOT7-204	ENST00000518885	GTF3C6	Q969F1	213 aa		27.39	■■□□□ 1.98
CNOT7-204	ENST00000518885	ZNF302	Q9NR11	478 aa		27.39	■■□□□ 1.98
CNOT7-204	ENST00000518885	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	27.39	■■□□□ 1.98
CNOT7-204	ENST00000518885	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		27.38	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		27.38	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	POTEB3	A0JP26	581 aa		27.38	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	27.38	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	SEC24B	O95487	1268 aa		27.38	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	POTEB	Q6S5H4	581 aa		27.38	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		27.38	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	PCYT2	Q99447	389 aa		27.38	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	RIT2	Q99578	217 aa		27.38	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	27.38	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		27.38	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	SAMM50	Q9Y512	469 aa		27.38	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	27.38	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	27.37	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	WDR64	B1ANS9	1081 aa		27.37	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	ADAMTS3	O15072	1205 aa		27.37	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	CCNE2	O96020	404 aa		27.37	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	CTSH	P09668	335 aa		27.37	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	INSRR	P14616	1297 aa		27.37	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	FOSL2	P15408	326 aa		27.37	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	27.37	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	IGBP1	P78318	339 aa		27.37	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	PLCB4	Q15147	1175 aa		27.37	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	FAM26D	Q5JW98	314 aa		27.37	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		27.37	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		27.37	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	APBB2	Q92870	758 aa		27.37	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		27.37	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	27.37	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		27.37	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885		M0QZ92	97 aa		27.36	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	HBP1	O60381	514 aa		27.36	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	GAS7	O60861	476 aa		27.36	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	TRIM29	Q14134	588 aa		27.36	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	GPNMB	Q14956	572 aa		27.36	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	ME3	Q16798	604 aa		27.36	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885		Q4G0T1	1027 aa		27.36	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		27.36	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		27.36	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	AIFM3	Q96NN9	605 aa		27.36	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	27.36	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		27.36	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	COL1A2	P08123	1366 aa		27.35	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		27.35	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885		M0R2N6	131 aa		27.35	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	CYP3A7	P24462	503 aa		27.35	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	SFN	P31947	248 aa		27.35	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	RABGGTB	P53611	331 aa		27.35	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	MBTPS1	Q14703	1052 aa		27.35	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		27.35	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	IER5	Q5VY09	327 aa		27.35	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		27.35	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		27.35	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		27.35	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		27.35	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		27.35	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	AMH	P03971	560 aa		27.34	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	JAK3	P52333	1124 aa		27.34	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	C8orf34	Q49A92	452 aa		27.34	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		27.34	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		27.34	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	NECAB1	Q8N987	351 aa		27.34	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	IL27	Q8NEV9	243 aa		27.34	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	MYLIP	Q8WY64	445 aa		27.34	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	LENG9	Q96B70	501 aa		27.34	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	FAM167A	Q96KS9	214 aa		27.34	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		27.34	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		27.34	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	KAT6A	Q92794	2004 aa		27.34	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	MSH4	O15457	936 aa		27.33	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	TLL1	O43897	1013 aa		27.33	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	27.33	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	GRIN2C	Q14957	1233 aa		27.33	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		27.33	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	27.33	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	NME8	Q8N427	588 aa		27.33	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		27.33	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	27.33	■■□□□ 1.97
CNOT7-204	ENST00000518885	SLC5A5	Q92911	643 aa		27.33	■■□□□ 1.97

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