RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514495.1

CTBP1-214, Transcript of C-terminal binding protein 1, human

TSL 2

Gene CTBP1, Length 564 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTBP1-214	ENST00000514495	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	31.5	■■■□□ 2.63
CTBP1-214	ENST00000514495	THEG	Q9P2T0	379 aa		31.5	■■■□□ 2.63
CTBP1-214	ENST00000514495	TRPC6	Q9Y210	931 aa		31.5	■■■□□ 2.63
CTBP1-214	ENST00000514495	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	31.49	■■■□□ 2.63
CTBP1-214	ENST00000514495	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	31.49	■■■□□ 2.63
CTBP1-214	ENST00000514495	GNA11	P29992	359 aa		31.49	■■■□□ 2.63
CTBP1-214	ENST00000514495	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	31.49	■■■□□ 2.63
CTBP1-214	ENST00000514495	FAM26D	Q5JW98	314 aa		31.49	■■■□□ 2.63
CTBP1-214	ENST00000514495	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		31.49	■■■□□ 2.63
CTBP1-214	ENST00000514495	RSPH3	Q86UC2	560 aa		31.49	■■■□□ 2.63
CTBP1-214	ENST00000514495	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		31.49	■■■□□ 2.63
CTBP1-214	ENST00000514495	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	31.49	■■■□□ 2.63
CTBP1-214	ENST00000514495	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	31.49	■■■□□ 2.63
CTBP1-214	ENST00000514495	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		31.49	■■■□□ 2.63
CTBP1-214	ENST00000514495	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		31.49	■■■□□ 2.63
CTBP1-214	ENST00000514495	TRANK1	O15050	2925 aa		31.49	■■■□□ 2.63
CTBP1-214	ENST00000514495	ADAMTS3	O15072	1205 aa		31.48	■■■□□ 2.63
CTBP1-214	ENST00000514495	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	31.48	■■■□□ 2.63
CTBP1-214	ENST00000514495	NTRK3	Q16288	839 aa		31.48	■■■□□ 2.63
CTBP1-214	ENST00000514495	MCTP2	Q6DN12	878 aa		31.48	■■■□□ 2.63
CTBP1-214	ENST00000514495	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		31.48	■■■□□ 2.63
CTBP1-214	ENST00000514495	SI	P14410	1827 aa		31.47	■■■□□ 2.63
CTBP1-214	ENST00000514495	FAM86B1	E9PN63	330 aa		31.47	■■■□□ 2.63
CTBP1-214	ENST00000514495	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		31.47	■■■□□ 2.63
CTBP1-214	ENST00000514495	INSRR	P14616	1297 aa		31.47	■■■□□ 2.63
CTBP1-214	ENST00000514495	IFNAR1	P17181	557 aa		31.47	■■■□□ 2.63
CTBP1-214	ENST00000514495	STAT5B	P51692	787 aa		31.47	■■■□□ 2.63
CTBP1-214	ENST00000514495	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	31.47	■■■□□ 2.63
CTBP1-214	ENST00000514495	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		31.47	■■■□□ 2.63
CTBP1-214	ENST00000514495	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		31.47	■■■□□ 2.63
CTBP1-214	ENST00000514495	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		31.47	■■■□□ 2.63
CTBP1-214	ENST00000514495	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		31.47	■■■□□ 2.63
CTBP1-214	ENST00000514495	APBB2	Q92870	758 aa		31.47	■■■□□ 2.63
CTBP1-214	ENST00000514495	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	31.47	■■■□□ 2.63
CTBP1-214	ENST00000514495	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	31.47	■■■□□ 2.63
CTBP1-214	ENST00000514495	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		31.47	■■■□□ 2.63
CTBP1-214	ENST00000514495	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	31.46	■■■□□ 2.63
CTBP1-214	ENST00000514495	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		31.46	■■■□□ 2.63
CTBP1-214	ENST00000514495	CHRNA1	P02708	482 aa		31.46	■■■□□ 2.63
CTBP1-214	ENST00000514495	CYP3A4	P08684	503 aa		31.46	■■■□□ 2.63
CTBP1-214	ENST00000514495	EVC	P57679	992 aa		31.46	■■■□□ 2.63
CTBP1-214	ENST00000514495	PLCB4	Q15147	1175 aa		31.46	■■■□□ 2.63
CTBP1-214	ENST00000514495	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		31.46	■■■□□ 2.63
CTBP1-214	ENST00000514495	RPAIN	Q86UA6	219 aa		31.46	■■■□□ 2.63
CTBP1-214	ENST00000514495	BICD2	Q8TD16	824 aa		31.46	■■■□□ 2.63
CTBP1-214	ENST00000514495	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	31.46	■■■□□ 2.63
CTBP1-214	ENST00000514495	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	31.46	■■■□□ 2.63
CTBP1-214	ENST00000514495	INSL6	Q9Y581	213 aa		31.46	■■■□□ 2.63
CTBP1-214	ENST00000514495	GHR	P10912	638 aa		31.45	■■■□□ 2.63
CTBP1-214	ENST00000514495	GRB10	Q13322	594 aa		31.45	■■■□□ 2.63
CTBP1-214	ENST00000514495	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	31.45	■■■□□ 2.63
CTBP1-214	ENST00000514495	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		31.45	■■■□□ 2.63
CTBP1-214	ENST00000514495	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		31.45	■■■□□ 2.63
CTBP1-214	ENST00000514495	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		31.45	■■■□□ 2.63
CTBP1-214	ENST00000514495	UIMC1	Q96RL1	719 aa		31.45	■■■□□ 2.63
CTBP1-214	ENST00000514495	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	31.45	■■■□□ 2.63
CTBP1-214	ENST00000514495	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		31.45	■■■□□ 2.63
CTBP1-214	ENST00000514495	LINC01553	A4QN01	128 aa		31.44	■■■□□ 2.62
CTBP1-214	ENST00000514495	BACH1	O14867	736 aa		31.44	■■■□□ 2.62
CTBP1-214	ENST00000514495	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	31.44	■■■□□ 2.62
CTBP1-214	ENST00000514495	MGAT3	Q09327	533 aa		31.44	■■■□□ 2.62
CTBP1-214	ENST00000514495	KRT40	Q6A162	431 aa		31.44	■■■□□ 2.62
CTBP1-214	ENST00000514495	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	31.44	■■■□□ 2.62
CTBP1-214	ENST00000514495	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	31.44	■■■□□ 2.62
CTBP1-214	ENST00000514495	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	31.44	■■■□□ 2.62
CTBP1-214	ENST00000514495	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		31.44	■■■□□ 2.62
CTBP1-214	ENST00000514495	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	31.44	■■■□□ 2.62
CTBP1-214	ENST00000514495	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	31.43	■■■□□ 2.62
CTBP1-214	ENST00000514495	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		31.43	■■■□□ 2.62
CTBP1-214	ENST00000514495	UPP2	O95045	317 aa		31.43	■■■□□ 2.62
CTBP1-214	ENST00000514495	ATG7	O95352	703 aa		31.43	■■■□□ 2.62
CTBP1-214	ENST00000514495	CCNE2	O96020	404 aa		31.43	■■■□□ 2.62
CTBP1-214	ENST00000514495	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	31.43	■■■□□ 2.62
CTBP1-214	ENST00000514495	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		31.43	■■■□□ 2.62
CTBP1-214	ENST00000514495	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	31.43	■■■□□ 2.62
CTBP1-214	ENST00000514495	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		31.43	■■■□□ 2.62
CTBP1-214	ENST00000514495	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		31.43	■■■□□ 2.62
CTBP1-214	ENST00000514495	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	31.42	■■■□□ 2.62
CTBP1-214	ENST00000514495	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	31.42	■■■□□ 2.62
CTBP1-214	ENST00000514495	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		31.42	■■■□□ 2.62
CTBP1-214	ENST00000514495	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		31.42	■■■□□ 2.62
CTBP1-214	ENST00000514495	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		31.42	■■■□□ 2.62
CTBP1-214	ENST00000514495	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		31.42	■■■□□ 2.62
CTBP1-214	ENST00000514495	POTEB3	A0JP26	581 aa		31.41	■■■□□ 2.62
CTBP1-214	ENST00000514495	CPLX1	O14810	134 aa		31.41	■■■□□ 2.62
CTBP1-214	ENST00000514495	ERVK-21	P61565	698 aa		31.41	■■■□□ 2.62
CTBP1-214	ENST00000514495	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	31.41	■■■□□ 2.62
CTBP1-214	ENST00000514495	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	31.41	■■■□□ 2.62
CTBP1-214	ENST00000514495	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	31.41	■■■□□ 2.62
CTBP1-214	ENST00000514495	POTEB	Q6S5H4	581 aa		31.41	■■■□□ 2.62
CTBP1-214	ENST00000514495	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		31.41	■■■□□ 2.62
CTBP1-214	ENST00000514495	TOP1MT	Q969P6	601 aa		31.41	■■■□□ 2.62
CTBP1-214	ENST00000514495	YME1L1	Q96TA2	773 aa		31.41	■■■□□ 2.62
CTBP1-214	ENST00000514495	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	31.4	■■■□□ 2.62
CTBP1-214	ENST00000514495	SLC26A2	P50443	739 aa		31.4	■■■□□ 2.62
CTBP1-214	ENST00000514495	NLRP5	P59047	1200 aa		31.4	■■■□□ 2.62
CTBP1-214	ENST00000514495	STK3	Q13188	491 aa		31.4	■■■□□ 2.62
CTBP1-214	ENST00000514495	LPIN1	Q14693	890 aa		31.4	■■■□□ 2.62
CTBP1-214	ENST00000514495	PRR16	Q569H4	304 aa		31.4	■■■□□ 2.62
CTBP1-214	ENST00000514495	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		31.4	■■■□□ 2.62

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