RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZBED2Q9BTP6 218 aa19.15■□□□□ 0.66
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa19.14■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DLL1O00548 723 aa19.14■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CPLX1O14810 134 aa19.14■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DHX15O43143 795 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GJB5O95377 273 aa19.14■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MARK3P27448 753 aa19.14■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ANAPC15P60006 121 aa19.14■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DEFB103AP81534 67 aa19.14■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SETQ01105 290 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TAP1Q03518 808 aa19.14■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ADGRE1Q14246 886 aa19.14■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MARCH8Q5T0T0 291 aa19.14■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RAD9AQ99638 391 aa19.14■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TBC1D22BQ9NU19 505 aa19.14■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TUBE1Q9UJT0 475 aa19.14■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CHD7Q9P2D1 2997 aa19.14■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EYSQ5T1H1 3165 aa19.14■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 UNC80Q8N2C7 3258 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ADAMTS3O15072 1205 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DEXIO95424 95 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 INSRRP14616 1297 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 USP11P51784 963 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ABHD15Q6UXT9 468 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 APBB2Q92870 758 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 VPS54Q9P1Q0 977 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PPFIA3O75145 1194 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCNE2O96020 404 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CHRNA1P02708 482 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AMHP03971 560 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CTSHP09668 335 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IGFBP4P22692 258 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NLRP5P59047 1200 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PLCB4Q15147 1175 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RUFY4Q6ZNE9 571 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF577Q9BSK1 485 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C22orf23Q9BZE7 217 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 POTEB3A0JP26 581 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM160B1Q5W0V3 765 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GALNT17Q6IS24 598 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 POTEBQ6S5H4 581 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP19.11■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRPC6Q9Y210 931 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 INSL6Q9Y581 213 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MGAT3Q09327 533 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 STK3Q13188 491 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 USP38Q8NB14 1042 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RASGRP4Q8TDF6 673 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DNAJB3Q8WWF6 145 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TOP1MTQ969P6 601 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IL17RAQ96F46 866 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OSBPL7Q9BZF2 842 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PCDHA4Q9UN74 947 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SQORQ9Y6N5 450 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BACH1O14867 736 aa19.09■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HBP1O60381 514 aa19.09■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CDKL5O76039 1030 aa19.09■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ARHGEF15O94989 841 aa19.09■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IGBP1P78318 339 aa19.09■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRT76Q01546 638 aa19.09■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ANKRD1Q15327 319 aa19.09■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRR16Q569H4 304 aa19.09■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IER5Q5VY09 327 aa19.09■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NME8Q8N427 588 aa19.09■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF302Q9NR11 478 aa19.09■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PTPRSQ13332 1948 aa19.09■□□□□ 0.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa19.08■□□□□ 0.64
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LCHNA4D1U4 455 aa19.08■□□□□ 0.64
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EDIL3O43854 480 aa19.08■□□□□ 0.64
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SWSAP1Q6NVH7 229 aa19.08■□□□□ 0.64
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.64
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MYOCDQ8IZQ8 938 aa19.08■□□□□ 0.64
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BLIDQ8IZY5 108 aa19.08■□□□□ 0.64
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DAGLBQ8NCG7 672 aa19.08■□□□□ 0.64
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ATP8B4Q8TF62 1192 aa19.08■□□□□ 0.64
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PPM1EQ8WY54 764 aa19.08■□□□□ 0.64
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ARNTL2Q8WYA1 636 aa19.08■□□□□ 0.64
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LENG9Q96B70 501 aa19.08■□□□□ 0.64
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.64
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CERS4Q9HA82 394 aa19.08■□□□□ 0.64
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa19.08■□□□□ 0.64
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa19.08■□□□□ 0.64
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.64
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRANK1O15050 2925 aa19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.3 ms