RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511412.1

ALYREF-203, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 3

Gene ALYREF, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-203ENST00000511412 Q6ZUG5 572 aa28.16■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 CYP2W1Q8TAV3 490 aa28.16■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 SUGCTQ9HAC7 445 aa28.16■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 TMEM260Q9NX78 707 aa28.16■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 LMCD1Q9NZU5 365 aa28.16■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 XIRP2A4UGR9 3374 aa28.15■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 APOBRQ0VD83 1088 aa28.15■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa28.15■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 BRF1Q92994 677 aa28.15■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 YME1L1Q96TA2 773 aa28.15■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 PCYT2Q99447 389 aa28.15■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 COG5Q9UP83 839 aa28.15■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 SNX14Q9Y5W7 946 aa28.15■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 MUC3AQ02505 3323 aa28.15■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 NID2Q14112 1375 aa28.14■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 CHRNA1P02708 482 aa28.14■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 ARP10275 920 aa28.14■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 GHRP10912 638 aa28.14■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 ADD1P35611 737 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 ACTR2P61160 394 aa28.14■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 IGBP1P78318 339 aa28.14■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 MGAT3Q09327 533 aa28.14■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 TOP1MTQ969P6 601 aa28.14■■■□□ 2.1
ALYREF-203ENST00000511412 SCG2P13521 617 aa28.13■■■□□ 2.09
ALYREF-203ENST00000511412 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
ALYREF-203ENST00000511412 MARCH8Q5T0T0 291 aa28.13■■■□□ 2.09
ALYREF-203ENST00000511412 FBXO22Q8NEZ5 403 aa28.13■■■□□ 2.09
ALYREF-203ENST00000511412 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
ALYREF-203ENST00000511412 C17orf80Q9BSJ5 609 aa28.13■■■□□ 2.09
ALYREF-203ENST00000511412 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
ALYREF-203ENST00000511412 TRPC6Q9Y210 931 aa28.13■■■□□ 2.09
ALYREF-203ENST00000511412 RRN3P2A6NIE6 340 aa28.12■■■□□ 2.09
ALYREF-203ENST00000511412 UPP2O95045 317 aa28.12■■■□□ 2.09
ALYREF-203ENST00000511412 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF76P36508 570 aa28.12■■■□□ 2.09
ALYREF-203ENST00000511412 DNAJB3Q8WWF6 145 aa28.12■■■□□ 2.09
ALYREF-203ENST00000511412 MEIS1O00470 390 aa28.11■■■□□ 2.09
ALYREF-203ENST00000511412 REC8O95072 547 aa28.11■■■□□ 2.09
ALYREF-203ENST00000511412 INSRRP14616 1297 aa28.11■■■□□ 2.09
ALYREF-203ENST00000511412 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa28.11■■■□□ 2.09
ALYREF-203ENST00000511412 NIPA1Q7RTP0 329 aa28.11■■■□□ 2.09
ALYREF-203ENST00000511412 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
ALYREF-203ENST00000511412 SAMD11Q96NU1 681 aa28.11■■■□□ 2.09
ALYREF-203ENST00000511412 CDY2AQ9Y6F7 541 aa28.11■■■□□ 2.09
ALYREF-203ENST00000511412 NLRC5Q86WI3 1866 aa28.1■■■□□ 2.09
ALYREF-203ENST00000511412 ESYT2A0FGR8 921 aa28.1■■■□□ 2.09
ALYREF-203ENST00000511412 RPS6KB1P23443 525 aa28.1■■■□□ 2.09
ALYREF-203ENST00000511412 STAT5BP51692 787 aa28.1■■■□□ 2.09
ALYREF-203ENST00000511412 KCNQ1P51787 676 aa28.1■■■□□ 2.09
ALYREF-203ENST00000511412 LPIN1Q14693 890 aa28.1■■■□□ 2.09
ALYREF-203ENST00000511412 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa28.1■■■□□ 2.09
ALYREF-203ENST00000511412 HLA-CQ95604 372 aa28.1■■■□□ 2.09
ALYREF-203ENST00000511412 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa28.1■■■□□ 2.09
ALYREF-203ENST00000511412 BMP1P13497 986 aa28.09■■■□□ 2.09
ALYREF-203ENST00000511412 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
ALYREF-203ENST00000511412 PLCB4Q15147 1175 aa28.09■■■□□ 2.09
ALYREF-203ENST00000511412 FBXL16Q8N461 479 aa28.09■■■□□ 2.09
ALYREF-203ENST00000511412 ZBTB10Q96DT7 871 aa28.09■■■□□ 2.09
ALYREF-203ENST00000511412 ZMYND12Q9H0C1 365 aa28.09■■■□□ 2.09
ALYREF-203ENST00000511412 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
ALYREF-203ENST00000511412 C6orf50Q9HD87 102 aa28.09■■■□□ 2.09
ALYREF-203ENST00000511412 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
ALYREF-203ENST00000511412 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
ALYREF-203ENST00000511412 PSMA5P28066 241 aa28.08■■■□□ 2.09
ALYREF-203ENST00000511412 FBXO47Q5MNV8 452 aa28.08■■■□□ 2.09
ALYREF-203ENST00000511412 MCTP2Q6DN12 878 aa28.08■■■□□ 2.09
ALYREF-203ENST00000511412 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa28.08■■■□□ 2.09
ALYREF-203ENST00000511412 PLA2G4DQ86XP0 818 aa28.08■■■□□ 2.09
ALYREF-203ENST00000511412 AGXT2Q9BYV1 514 aa28.08■■■□□ 2.09
ALYREF-203ENST00000511412 FAM86B1E9PN63 330 aa28.07■■■□□ 2.08
ALYREF-203ENST00000511412 M0QZ92 97 aa28.07■■■□□ 2.08
ALYREF-203ENST00000511412 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
ALYREF-203ENST00000511412 ATG7O95352 703 aa28.07■■■□□ 2.08
ALYREF-203ENST00000511412 FAM86B2P0C5J1 330 aa28.07■■■□□ 2.08
ALYREF-203ENST00000511412 SLC26A2P50443 739 aa28.07■■■□□ 2.08
ALYREF-203ENST00000511412 EPC2Q52LR7 807 aa28.07■■■□□ 2.08
ALYREF-203ENST00000511412 IER5Q5VY09 327 aa28.07■■■□□ 2.08
ALYREF-203ENST00000511412 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
ALYREF-203ENST00000511412 POTEB3A0JP26 581 aa28.06■■■□□ 2.08
ALYREF-203ENST00000511412 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
ALYREF-203ENST00000511412 PKN1Q16512 942 aa28.06■■■□□ 2.08
ALYREF-203ENST00000511412 POTEBQ6S5H4 581 aa28.06■■■□□ 2.08
ALYREF-203ENST00000511412 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa28.06■■■□□ 2.08
ALYREF-203ENST00000511412 CRYGNQ8WXF5 182 aa28.06■■■□□ 2.08
ALYREF-203ENST00000511412 PHKBQ93100 1093 aa28.06■■■□□ 2.08
ALYREF-203ENST00000511412 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa28.06■■■□□ 2.08
ALYREF-203ENST00000511412 TRPV2Q9Y5S1 764 aa28.06■■■□□ 2.08
ALYREF-203ENST00000511412 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa28.05■■■□□ 2.08
ALYREF-203ENST00000511412 BACH1O14867 736 aa28.05■■■□□ 2.08
ALYREF-203ENST00000511412 CCNE2O96020 404 aa28.05■■■□□ 2.08
ALYREF-203ENST00000511412 CYP3A4P08684 503 aa28.05■■■□□ 2.08
ALYREF-203ENST00000511412 GNA11P29992 359 aa28.05■■■□□ 2.08
ALYREF-203ENST00000511412 SETQ01105 290 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
ALYREF-203ENST00000511412 FAM160B1Q5W0V3 765 aa28.05■■■□□ 2.08
ALYREF-203ENST00000511412 IL17RAQ96F46 866 aa28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.8 ms