RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499624.3

GABPB1-AS1-202, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GABPB1-AS1, Length 16,182 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CHEK2O96017 543 aa4.88□□□□□ -1.63
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DENND1AQ8TEH3 1009 aa4.88□□□□□ -1.63
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DCTPP1Q9H773 170 aa4.88□□□□□ -1.63
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP4.88□□□□□ -1.63
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TNNC2P02585 160 aa4.88□□□□□ -1.63
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 KRT5P13647 590 aa4.88□□□□□ -1.63
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP4.88□□□□□ -1.635e-8■■■□□ 19.2
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GABPB1-AS1-202ENST00000499624 EDARQ9UNE0 448 aa4.88□□□□□ -1.63
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GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MAGEB2O15479 319 aa4.88□□□□□ -1.63
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GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PHF20L1A8MW92 1017 aa4.88□□□□□ -1.63
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GOLGA8RI6L899 631 aa4.88□□□□□ -1.63
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
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GABPB1-AS1-202ENST00000499624 KIFC2Q96AC6 838 aa4.88□□□□□ -1.63
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GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DIXDC1Q155Q3 683 aa4.88□□□□□ -1.63
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GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa4.88□□□□□ -1.63
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ESYT2A0FGR8 921 aa4.88□□□□□ -1.63
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GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CASP10Q92851 521 aa4.87□□□□□ -1.63
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GABPB1-AS1-202ENST00000499624 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa4.87□□□□□ -1.63
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MLYCDO95822 493 aa4.87□□□□□ -1.63
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 C4BPBP20851 252 aa4.87□□□□□ -1.63
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CCND2P30279 289 aa4.87□□□□□ -1.63
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GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TBC1D9BQ66K14 1250 aa4.87□□□□□ -1.63
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GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NEDD4P46934 1319 aa4.87□□□□□ -1.63
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GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RPN2P04844 631 aa4.87□□□□□ -1.63
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GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CCT2P78371 535 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ATP11AP98196 1134 aa4.87□□□□□ -1.63
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 BFSP2Q13515 415 aa4.87□□□□□ -1.63
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa4.87□□□□□ -1.63
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 USP17L12C9JPN9 530 aa4.87□□□□□ -1.63
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 USP17L21D6R901 530 aa4.87□□□□□ -1.63
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CHKAP35790 457 aa4.87□□□□□ -1.63
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TTC23LQ6PF05 361 aa4.87□□□□□ -1.63
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZHX3Q9H4I2 956 aa4.87□□□□□ -1.63
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 POLR3EQ9NVU0 708 aa4.87□□□□□ -1.63
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ECM29Q5VYK3 1845 aa4.87□□□□□ -1.63
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