RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492417.5

TRA2B-215, Transcript of transformer 2 beta homolog, human

TSL 1 (best)

Gene TRA2B, Length 4,141 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRA2B-215	ENST00000492417	CACNA1S	Q13698	1873 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	MSH4	O15457	936 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	TNNI1	P19237	187 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	CMA1	P23946	247 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	C1QTNF8	P60827	252 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	GRIN1	Q05586	938 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	TYRO3	Q06418	890 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	ST3GAL1	Q11201	340 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	PPFIA1	Q13136	1202 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	MAP2K5	Q13163	448 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	ACVR2B	Q13705	512 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	PGM5	Q15124	567 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	CCL14	Q16627	93 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	PADI6	Q6TGC4	694 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	DYDC1	Q8WWB3	177 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	ANKS1A	Q92625	1134 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	JAK3	P52333	1124 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	ABI1	Q8IZP0	508 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	TMEM150B	A6NC51	233 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	SMARCA1	P28370	1054 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	GRK4	P32298	578 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	GJA5	P36382	358 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	ACTR2	P61160	394 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	PSMC5	P62195	406 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	LRMP	Q12912	555 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	ODF2	Q5BJF6	829 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	LUZP1	Q86V48	1076 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	KRT222	Q8N1A0	295 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	DRC1	Q96MC2	740 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	VPS16	Q9H269	839 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	FAM86B1	E9PN63	330 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417		K7ERI5	159 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	LAD1	O00515	517 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	SLC16A4	O15374	487 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	FGR	P09769	529 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	HSPA6	P17066	643 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	PTPRE	P23469	700 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	MNAT1	P51948	309 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	DGKD	Q16760	1214 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	TLK2	Q86UE8	772 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	PAF1	Q8N7H5	531 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62

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