RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 FAHP16930 419 aa6.81□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 SLC9A1P19634 815 aa6.81□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 SDHAP31040 664 aa6.81□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 VIPR1P32241 457 aa6.81□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 FAPQ12884 760 aa6.81□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 TMEM132BQ14DG7 1078 aa6.81□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 IQSEC1Q6DN90 963 aa6.81□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 ETV3LQ6ZN32 361 aa6.81□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 ZNF605Q86T29 641 aa6.81□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 SLC5A5Q92911 643 aa6.81□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 SLC38A3Q99624 504 aa6.81□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 BCAS3Q9H6U6 928 aa6.81□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 TOMM22Q9NS69 142 aa6.81□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 HSPBP1Q9NZL4 362 aa6.81□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 PRAMEF25A6NGN4 478 aa6.8□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 ACOT7O00154 380 aa6.8□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 TGM5O43548 720 aa6.8□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 RAB11FIP3O75154 756 aa6.8□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 FNTBP49356 437 aa6.8□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 SESN3P58005 492 aa6.8□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 HERVK_113P62684 666 aa6.8□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 PHC1P78364 1004 aa6.8□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 MESP2Q0VG99 397 aa6.8□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 DDB1Q16531 1140 aa6.8□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 GPR158Q5T848 1215 aa6.8□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 ZZZ3Q8IYH5 903 aa6.8□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 DDX11Q96FC9 970 aa6.8□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 CEP89Q96ST8 783 aa6.8□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa6.8□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa6.79□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 FOXP2O15409 715 aa6.79□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 LRG1P02750 347 aa6.79□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 ASGR2P07307 311 aa6.79□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 LSP1P33241 339 aa6.79□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 TERF2Q15554 542 aa6.79□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 CPA5Q8WXQ8 436 aa6.79□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 PPP1R16BQ96T49 567 aa6.79□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 RNF38Q9H0F5 515 aa6.79□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 SIRT5Q9NXA8 310 aa6.79□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 SEMA7AO75326 666 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 KATNA1O75449 491 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 NCAM1P13591 858 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 FBLN1P23142 703 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 LRRC32Q14392 662 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 PLEKHG6Q3KR16 790 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 CATSPEREQ5SY80 951 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 BROXQ5VW32 411 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 TMEM132EQ6IEE7 984 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 TEPPQ6URK8 271 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 NME9Q86XW9 330 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 COG1Q8WTW3 980 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 IRS2Q9Y4H2 1338 aa6.77□□□□□ -1.32
CCL20-204ENST00000489160 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-204ENST00000489160 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CCL20-204ENST00000489160 RASSF10A6NK89 507 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-204ENST00000489160 PRKD3O94806 890 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-204ENST00000489160 TMEM253P0C7T8 217 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-204ENST00000489160 CD40P25942 277 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-204ENST00000489160 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CCL20-204ENST00000489160 STAT5AP42229 794 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-204ENST00000489160 NKX3-2P78367 333 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-204ENST00000489160 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CCL20-204ENST00000489160 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CCL20-204ENST00000489160 MTMR1Q13613 665 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-204ENST00000489160 EPHA7Q15375 998 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-204ENST00000489160 CR1LQ2VPA4 569 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-204ENST00000489160 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CCL20-204ENST00000489160 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CCL20-204ENST00000489160 CNTD1Q8N815 330 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-204ENST00000489160 ZNF610Q8N9Z0 462 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-204ENST00000489160 CLRN3Q8NCR9 226 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-204ENST00000489160 ASB15Q8WXK1 588 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-204ENST00000489160 KCNN1Q92952 543 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-204ENST00000489160 C16orf92Q96LL3 132 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-204ENST00000489160 MENTQ9BUN1 341 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-204ENST00000489160 MCOLN1Q9GZU1 580 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-204ENST00000489160 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-204ENST00000489160 ZMAT4Q9H898 229 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-204ENST00000489160 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-204ENST00000489160 ASB1Q9Y576 335 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-204ENST00000489160 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa6.76□□□□□ -1.33
CCL20-204ENST00000489160 K7ESF4 209 aa6.76□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms