RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488923.1

HDLBP-243, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-243ENST00000488923 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 EDEM3Q9BZQ6 932 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 ZMYND15Q9H091 742 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 VPS16Q9H269 839 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 PDCL3Q9H2J4 239 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 L2HGDHQ9H9P8 463 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 VEZTQ9HBM0 779 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 TUFT1Q9NNX1 390 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 MYOZ2Q9NPC6 264 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 TAB2Q9NYJ8 693 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 MYO1AQ9UBC5 1043 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 DNM3Q9UQ16 869 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 CD2APQ9Y5K6 639 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 A0A1W2PQJ5 194 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 TEX33O43247 280 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 EDIL3O43854 480 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 KIF5CO60282 957 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 ALDH1A1P00352 501 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 GYPCP04921 128 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 KRT18P05783 430 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 PLA2G4BP0C869 781 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 IDEP14735 1019 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 GAP43P17677 238 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 KRT9P35527 623 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 USP14P54578 494 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 ADKP55263 362 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 KRT83P78385 493 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 CDK17Q00537 523 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 GHRHRQ02643 423 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 CXCL9Q07325 125 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 EHHADHQ08426 723 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 RBL2Q08999 1139 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 MAN2A1Q16706 1144 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 PRR16Q569H4 304 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 ZNF662Q6ZS27 426 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 NIPA1Q7RTP0 329 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 CCDC170Q8IYT3 715 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 EHBP1Q8NDI1 1231 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 ETNPPLQ8TBG4 499 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 PLIN2Q99541 437 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 FEZ1Q99689 392 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 ABHD10Q9NUJ1 306 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 PANK4Q9NVE7 773 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 KCND2Q9NZV8 630 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 CAPN11Q9UMQ6 739 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 SIPA1L1O43166 1804 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 SCN9AQ15858 1988 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 KIF13BQ9NQT8 1826 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 A0A1W2PRG0 241 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 USP27XA6NNY8 438 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 PES1O00541 588 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 WNT10BO00744 389 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 ICAM1P05362 532 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 BCRP11274 1271 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 CASQ1P31415 396 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 CASP14P31944 242 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 MARSP56192 900 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 ZBED6P86452 979 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 STK4Q13043 487 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 EDRF1Q3B7T1 1238 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 USH1GQ495M9 461 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 FAM83BQ5T0W9 1011 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 ANKRD40Q6AI12 368 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 SYT10Q6XYQ8 523 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 DYMQ7RTS9 669 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 GPBP1Q86WP2 473 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 IRF2BP1Q8IU81 584 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 REXO1L1PQ8IX06 675 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 KIAA0895Q8NCT3 520 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 ZNF507Q8TCN5 953 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 RIT2Q99578 217 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 DNAJC7Q99615 494 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 AS3MTQ9HBK9 375 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 SEL1LQ9UBV2 794 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 DNAI1Q9UI46 699 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 FAM184BQ9ULE4 1060 aa7.34□□□□□ -1.23
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